亞洲大學 111 年 《生物化學》

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第 1 題

Histidine has the following pKa values: pK1=1.82pK_1=1.82, pK2=9.17pK_2=9.17, and pKR=6.0pK_R=6.0.

Give the net charge of histidine at pH=12\mathrm{pH}=12.

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核心觀念

本題考查胺基酸依據 pH\mathrm{pH} 與各官能基 pKapK_a 的關係,判斷其酸鹼解離狀態與總淨電荷。

Histidine(組胺酸)具有三個可解離的官能基:

  • α\alpha-羧基:pK1=1.82pK_1=1.82
  • 咪唑基側鏈(imidazole side chain):pKR=6.0pK_R=6.0
  • α\alpha-胺基:pK2=9.17pK_2=9.17

基本判斷原則如下:

  • 當 pH<pKa\mathrm{pH}<pK_a,該基團傾向保持「質子化」狀態。
  • 當 pH>pKa\mathrm{pH}>pK_a,該基團傾向「去質子化」狀態。

解題方法

題目給定:

pH=12\mathrm{pH}=12

分別比較 pH\mathrm{pH} 與三個 pKapK_a。

1. α\alpha-羧基

pH=12>pK1=1.82\mathrm{pH}=12>pK_1=1.82

羧基已完全去質子化,形式為 −COOX−\ce{-COO^-},電荷為:

−1-1

2. 咪唑基側鏈

pH=12>pKR=6.0\mathrm{pH}=12>pK_R=6.0

咪唑基側鏈已去質子化。質子化的咪唑鎓側鏈帶有 +1+1 電荷;去質子化後為中性,電荷為:

00

3. α\alpha-胺基

pH=12>pK2=9.17\mathrm{pH}=12>pK_2=9.17

α\alpha-胺基已去質子化,由 −NHX3X+\ce{-NH3+} 轉為 −NHX2\ce{-NH2},電荷為:

00

4. 計算總淨電荷

總淨電荷=(−1)+0+0=−1\text{總淨電荷}=(-1)+0+0=-1

因此,pH 12 時 Histidine 的主要形式可表示為:

X−X22−OOC−CH(NHX2)−CHX2−imidazole\ce{^-OOC-CH(NH2)-CH2-imidazole}

其總淨電荷為 −1-1。


選項分析

(A) 0

錯誤。

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第 2 題

Which amino acid is NOT a building block of proteins?

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核心觀念

本題考查「蛋白質生成所使用的蛋白質生成性胺基酸(proteinogenic amino acids)」與「非蛋白質生成性胺基酸(non-proteinogenic amino acids)」的區別。

一般蛋白質由基因編碼,透過 mRNA 的遺傳密碼與 tRNA 將胺基酸依序接到生長中的多胜肽鏈上。標準遺傳密碼所指定的 20 種常見胺基酸,均可作為蛋白質的基本組成單位。

其中:

  • Tryptophan(色胺酸,Trp,W)
  • Tyrosine(酪胺酸,Tyr,Y)
  • Proline(脯胺酸,Pro,P)

皆屬於標準蛋白質生成性胺基酸。

**Ornithine(鳥胺酸)**雖然是胺基酸,也具有重要的生理功能,但不屬於標準蛋白質的基本組成單位,因此為本題答案。


解題方法

判斷此題的最快方法,是逐一確認各選項是否屬於標準 20 種蛋白質生成性胺基酸。

若某胺基酸:

  1. 有對應的標準遺傳密碼;
  2. 能被相對應的 aminoacyl-tRNA synthetase(胺醯-tRNA 合成酶)接到 tRNA 上;
  3. 能在 translation(轉譯)過程中被直接嵌入多胜肽鏈;

即可視為蛋白質的 building block。

Ornithine 不符合上述標準。它主要出現在 urea cycle(尿素循環),不是由標準遺傳密碼直接指定並嵌入蛋白質的胺基酸。

尿素循環中,ornithine 與 carbamoyl phosphate(氨甲醯磷酸)在 **ornithine transcarbamylase, OTC(鳥胺酸轉氨甲醯酶)**作用下形成 citrulline(瓜胺酸):

Ornithine+Carbamoyl phosphate⟶OTCCitrulline+PXi\text{Ornithine}+\ce{Carbamoyl\ phosphate} \overset{\text{OTC}}{\longrightarrow} \text{Citrulline}+\ce{P_i}

後續 citrulline 經由 argininosuccinate(精胺琥珀酸)與 arginine(精胺酸)等中間物,最後在 **arginase(精胺酸酶)**作用下生成 urea(尿素),並再生 ornithine:

Arginine+HX2O⟶arginaseOrnithine+Urea\text{Arginine}+\ce{H2O} \overset{\text{arginase}}{\longrightarrow} \text{Ornithine}+\ce{Urea}

因此,ornithine 是代謝途徑中的重要中間物,並非蛋白質合成時直接使用的標準胺基酸。


選項分析

(A) Tryptophan(色胺酸)

錯誤選項。Tryptophan 是標準 20 種蛋白質生成性胺基酸之一,具有對應的遺傳密碼:

UGG\text{UGG}

它可由 tRNA 攜帶,直接參與多胜肽鏈的合成。此外,tryptophan 也是 serotonin(血清素)、melatonin(褪黑激素)與 niacin(菸鹼酸)等物質的前驅物。

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第 3 題

【題組共用題幹】

The figure below shows the relationship between the titration curve and the acid–base properties of glycine. The key points in the titration are designated I to IV.

🖼️【此處有附圖,請對照原卷】

Which key point of the figure is where the average net charge of glycine is 0?

本題附圖正在準備中,以下為原卷對應頁面:
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核心觀念

本題考查胺基酸滴定曲線、等電點(isoelectric point, pIpI)與平均淨電荷的關係。

甘胺酸(glycine)具有兩個可解離基團:

  • 羧基:−COOH\ce{-COOH},pK1=2.34pK_1=2.34
  • 胺基:−NHX3X+\ce{-NH3+},pK2=9.60pK_2=9.60

隨著加入 OHX−\ce{OH^-},甘胺酸依序失去兩個質子:

X+X22+HX3N−CHX2−COOH⟶X+X22+HX3N−CHX2−COOX−⟶HX2N−CHX2−COOX−\ce{^{+}H3N-CH2-COOH} \longrightarrow \ce{^{+}H3N-CH2-COO^-} \longrightarrow \ce{H2N-CH2-COO^-}

其主要電荷依序為:

+1⟶0⟶−1+1 \longrightarrow 0 \longrightarrow -1

平均淨電荷為 00 的位置稱為等電點,此時主要存在兩性離子(zwitterion)X+X22+HX3N−CHX2−COOX−\ce{^{+}H3N-CH2-COO^-}。

解題方法

甘胺酸不含可解離側鏈,因此等電點取兩個主要解離基團的 pKapK_a 平均值:

pI=pK1+pK22=2.34+9.602=5.97pI=\frac{pK_1+pK_2}{2} =\frac{2.34+9.60}{2} =5.97

圖中 pH =5.97=5.97 的位置標示為 III。此處甘胺酸主要以兩性離子形式存在:

X+X22+HX3N−CHX2−COOX−\ce{^{+}H3N-CH2-COO^-}

分子內正、負電荷互相抵消,因此平均淨電荷為 00。

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第 4 題

【題組共用題幹】

The figure below shows the relationship between the titration curve and the acid–base properties of glycine. The key points in the titration are designated I to IV.

🖼️【此處有附圖,請對照原卷】

Referring to Question 3, which key point of the figure shows glycine existing as a 50:50 mixture of HX3NX+−CHX2−COOH\ce{H3N+–CH2–COOH} and HX3NX+−CHX2−COOX−\ce{H3N+–CH2–COO-}?

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核心觀念

本題考查甘胺酸(glycine)的酸鹼滴定曲線,以及 Henderson–Hasselbalch 方程式:

pH=pKa+log⁡[鹼型][酸型]\mathrm{pH=p}K_a+\log\frac{[\text{鹼型}]}{[\text{酸型}]}

甘胺酸有兩個可解離的基團:

  1. 羧基:HX3NX+−CHX2−COOH⇌HX3NX+−CHX2−COOX−+HX+\ce{H3N+–CH2–COOH <=> H3N+–CH2–COO- + H+}
    pK1=2.34\mathrm{p}K_1=2.34

  2. 胺基:HX3NX+−CHX2−COOX−⇌HX2N−CHX2−COOX−+HX+\ce{H3N+–CH2–COO- <=> H2N–CH2–COO- + H+}
    pK2=9.60\mathrm{p}K_2=9.60

題目指定的兩種型態為:

  • 酸型:HX3NX+−CHX2−COOH\ce{H3N+–CH2–COOH}
  • 鹼型:HX3NX+−CHX2−COOX−\ce{H3N+–CH2–COO-}

因此,題目問的是羧基解離的共軛酸鹼對何時呈現 50:5050:50。


解題方法

當酸型與鹼型濃度相等時:

[HX3NX+−CHX2−COOH]=[HX3NX+−CHX2−COOX−][\ce{H3N+–CH2–COOH}] = [\ce{H3N+–CH2–COO-}]

代入 Henderson–Hasselbalch 方程式:

pH=pK1+log⁡1=pK1=2.34\mathrm{pH} = \mathrm{p}K_1+\log 1 = \mathrm{p}K_1 = 2.34

圖中 pH =2.34=2.34 的位置標示為 II,且位於加入 0.50.5 當量 OHX−\ce{OH-} 的半當量點。此時一半的 HX3NX+−CHX2−COOH\ce{H3N+–CH2–COOH} 已被 OHX−\ce{OH-} 中和為 HX3NX+−CHX2−COOX−\ce{H3N+–CH2–COO-},所以兩者比例為 1:11:1。


選項分析

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第 5 題

【題組共用題幹】

The figure below shows the relationship between the titration curve and the acid–base properties of glycine. The key points in the titration are designated I to IV.

🖼️【此處有附圖,請對照原卷】

Referring to Question 3, which region of the figure shows glycine having its maximum buffering capacity?

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核心觀念

本題考 glycine(甘胺酸)滴定曲線中「緩衝能力」最大的位置。

緩衝能力在弱酸與其共軛鹼濃度接近時最大:

[HA]≈[AX−][\ce{HA}] \approx [\ce{A^-}]

依 Henderson–Hasselbalch 方程式:

pH=pKa+log⁡[AX−][HA]\mathrm{pH}=\mathrm{p}K_a+\log\frac{[\ce{A^-}]}{[\ce{HA}]}

當 [AX−]=[HA][\ce{A^-}]=[\ce{HA}] 時:

pH=pKa\mathrm{pH}=\mathrm{p}K_a

因此,滴定曲線在兩個 pKa\mathrm{p}K_a 附近具有最大的緩衝能力。圖中 glycine 的兩個解離步驟為:

  1. + HX3N−CHX2−COOH⇌+ HX3N−CHX2−COOX−+HX+\ce{+H3N-CH2-COOH <=> +H3N-CH2-COO^- + H^+}
    pKa1=2.34\mathrm{p}K_{a1}=2.34,約位於 II 點。

  2. + HX3N−CHX2−COOX−⇌HX2N−CHX2−COOX−+HX+\ce{+H3N-CH2-COO^- <=> H2N-CH2-COO^- + H^+}
    pKa2=9.60\mathrm{p}K_{a2}=9.60,約位於 IV 點。

解題方法

圖中各點代表:

  • I:尚未明顯中和,主要為完全質子化型 + HX3N−CHX2−COOH\ce{+H3N-CH2-COOH}
  • II:第一個半當量點,pH≈pKa1=2.34\mathrm{pH}\approx\mathrm{p}K_{a1}=2.34
  • III:等電點附近,pH≈5.97\mathrm{pH}\approx5.97
  • IV:第二個半當量點,pH≈pKa2=9.60\mathrm{pH}\approx\mathrm{p}K_{a2}=9.60
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第 6 題

Which amino acid has two chirality centers?

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核心觀念

本題考查胺基酸的手性(chirality)與手性中心(chirality center,亦稱 stereocenter)。

一個四面體型碳原子若連接四個不同的取代基,通常可形成手性中心。對標準 α\alpha-胺基酸而言,α\alpha-碳通常連接:

−NHX2,−COOH,−H,−R\ce{-NH2},\quad \ce{-COOH},\quad \ce{-H},\quad \ce{-R}

當 R\ce{R} 基團不等於 H\ce{H},且四個取代基彼此不同時,α\alpha-碳即為一個手性中心。

本題要找的是具有「兩個手性中心」的胺基酸。判斷重點是:

  1. 先檢查 α\alpha-碳是否為手性中心。
  2. 再檢查側鏈中是否還有其他碳原子連接四個不同的取代基。

解題方法

逐一觀察各胺基酸的結構與側鏈:

  • Glycine:R=H\ce{R = H}
  • Tyrosine:R=CHX2−CX6HX4−OH\ce{R = CH2-C6H4-OH}
  • Threonine:R=CH(OH)CHX3\ce{R = CH(OH)CH3}
  • Valine:R=CH(CHX3)X2\ce{R = CH(CH3)2}

其中,threonine 的側鏈含有一個 CH(OH)\ce{CH(OH)} 碳原子。此碳連接:

−OH,−H,−CHX3,−CH(NHX2)COOH\ce{-OH},\quad \ce{-H},\quad \ce{-CH3},\quad \ce{-CH(NH2)COOH}

四個取代基皆不同,因此該側鏈碳也是手性中心。

所以 threonine 同時具有:

  1. α\alpha-碳上的第一個手性中心。
  2. β\beta-碳上的第二個手性中心。

選項分析

(A) Glycine

Glycine 的結構可表示為:

NHX2−CHX2−COOH\ce{NH2-CH2-COOH}

其 α\alpha-碳連接兩個相同的氫原子:

−NHX2,−COOH,−H,−H\ce{-NH2},\quad \ce{-COOH},\quad \ce{-H},\quad \ce{-H}

因為有兩個相同取代基,α\alpha-碳不是手性中心;側鏈也沒有其他碳原子可形成手性中心。

因此 glycine 具有 00 個手性中心,錯誤。


(B) Tyrosine

Tyrosine 的側鏈為:

−CHX2−CX6HX4−OH\ce{-CH2-C6H4-OH}
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第 7 題

Which of the following is a method of isolating ribosomes from mechanically homogenized E. coli cells?

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核心觀念

本題考查「細胞器與細胞內大型分子之分離方法」,特別是利用離心法從機械均質化的 E. coli 細胞裂解液中分離核糖體(ribosome)。

核糖體是由 ribosomal RNA(rRNA)與蛋白質組成的核糖核蛋白複合體。在 E. coli 中,完整核糖體為 70S,由:

  • 30S 小次單位
  • 50S 大次單位

所組成。此處的 S 為 Svedberg unit,代表沉降係數,與顆粒的大小、形狀及密度有關,並非單純的數值相加。

機械均質化會破壞細胞,使細胞內容物釋放至溶液中。接著可依據不同成分的沉降速度,使用不同轉速進行分段離心,逐步去除細胞碎片並收集核糖體。


解題方法

判斷本題的關鍵是辨識題幹中的兩個訊息:

  1. 材料是經過機械均質化的 E. coli 細胞。
  2. 目標是「分離核糖體」,屬於細胞內成分的物理分離。

最適合的方法是 differential centrifugation(差速離心)。

典型流程如下:

第一步:低速離心去除大型成分

細胞均質液中含有未破裂細胞、細胞壁碎片、細胞膜片段及其他大型顆粒。先以低速離心,使大型且沉降速度快的成分形成沉澱:

均質液→低速離心大型碎片沉澱+上清液\text{均質液} \xrightarrow{\text{低速離心}} \text{大型碎片沉澱}+\text{上清液}

核糖體體積較小,通常留在上清液中。

第二步:較高速離心沉降核糖體

將含有核糖體的上清液再以較高速離心,核糖體因具有足夠的質量與沉降特性而形成沉澱:

含核糖體上清液→高速離心核糖體沉澱+可溶性蛋白質上清液\text{含核糖體上清液} \xrightarrow{\text{高速離心}} \text{核糖體沉澱}+\text{可溶性蛋白質上清液}

實際實驗中,核糖體常使用超速離心、蔗糖墊(sucrose cushion)或蔗糖密度梯度進一步純化;但就本題所列方法而言,最直接且正確的分類是 differential centrifugation。

因此,官方答案選擇 (C)。


選項分析

(A) Edman degradation

Edman degradation(Edman 降解法)是用來分析蛋白質或胜肽的 N 端胺基酸序列的方法。

其基本原理是以 phenyl isothiocyanate(PITC)標記胜肽的 N 端胺基酸,再使該胺基酸逐步切除並鑑定。此方法用途是:

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第 8 題

What is the pH of a solution that has an HX+\ce{H+} concentration of 1.0×10−4 mol/L1.0\times10^{-4}\ \mathrm{mol/L}?

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核心觀念

本題考查酸鹼值(pH)的定義。pH 是氫離子濃度 HX+\ce{H+} 的負十進位對數:

pH=−log⁡[HX+]\mathrm{pH}=-\log[\ce{H+}]

其中 [HX+][\ce{H+}] 的單位為 mol/L\mathrm{mol/L}。氫離子濃度越高,溶液越酸,pH 越低。

解題方法

題目給定:

[HX+]=1.0×10−4 mol/L[\ce{H+}]=1.0\times10^{-4}\ \mathrm{mol/L}

代入 pH 公式:

pH=−log⁡(1.0×10−4)=−[log⁡(1.0)+log⁡(10−4)]=−[0+(−4)]=4\begin{aligned} \mathrm{pH} &=-\log(1.0\times10^{-4})\\ &=-\left[\log(1.0)+\log(10^{-4})\right]\\ &=-[0+(-4)]\\ &=4 \end{aligned}

因此溶液的 pH 為 44,屬於酸性溶液。

選項分析

  • (A) 9:錯誤。
    pH =9=9 代表鹼性溶液,其氫離子濃度應為:

[HX+]=1.0×10−9 mol/L[\ce{H+}]=1.0\times10^{-9}\ \mathrm{mol/L}

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第 9 題

Which of the following aqueous solutions has the lowest pH?

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核心觀念

本題考查弱酸的酸性強弱與溶液 pH 的關係。

弱酸解離反應為:

HA⇌HX++AX−\ce{HA <=> H+ + A^-}

酸解離常數為:

Ka=[HX+][AX−][HA]K_a=\frac{[\ce{H+}][\ce{A^-}]}{[\ce{HA}]}

而:

pKa=−log⁡KapK_a=-\log K_a

因此:

  • pKapK_a 越小,KaK_a 越大
  • KaK_a 越大,弱酸解離程度越高
  • 產生的 [HX+][\ce{H+}] 越大,溶液 pH 越低

本題各溶液濃度皆為 0.1 M0.1\ \mathrm{M},故主要比較各酸的 pKapK_a。


解題方法

對濃度為 CC 的弱酸,若解離產生的 HX+\ce{H+} 濃度為 xx,則:

Ka=x2C−xK_a=\frac{x^2}{C-x}

當弱酸解離程度很小時,C−x≈CC-x\approx C,可使用近似式:

[HX+]≈KaC[\ce{H+}]\approx\sqrt{K_aC}

因此:

pH≈−log⁡KaC\mathrm{pH}\approx-\log\sqrt{K_aC}

在所有酸的初始濃度相同時,KaK_a 越大,[HX+][\ce{H+}] 越大,pH 越低。換句話說,直接選擇 pKapK_a 最小的酸即可。

各選項的 pKapK_a 為:

3.75<4.19<4.86<7.863.75<4.19<4.86<7.86

最小者為甲酸(formic acid),因此其酸性最強、產生的 HX+\ce{H+} 最多,pH 最低。


數值驗算

(A) 乳酸(lactic acid)

pKa=7.86pK_a=7.86 Ka=10−7.86≈1.38×10−8K_a=10^{-7.86}\approx1.38\times10^{-8} [HX+]≈(1.38×10−8)(0.1)≈3.7×10−5 M[\ce{H+}]\approx\sqrt{(1.38\times10^{-8})(0.1)} \approx3.7\times10^{-5}\ \mathrm{M} pH≈4.43\mathrm{pH}\approx4.43

(B) 醋酸(acetic acid)

pKa=4.86pK_a=4.86 Ka=10−4.86≈1.38×10−5K_a=10^{-4.86}\approx1.38\times10^{-5} [HX+]≈(1.38×10−5)(0.1)≈1.17×10−3 M[\ce{H+}]\approx\sqrt{(1.38\times10^{-5})(0.1)} \approx1.17\times10^{-3}\ \mathrm{M} pH≈2.93\mathrm{pH}\approx2.93

(C) 琥珀酸(succinic acid)

題目提供的 pKa=4.19pK_a=4.19 應視為琥珀酸的第一級解離:

HX2A⇌HX++HAX−\ce{H2A <=> H+ + HA^-} Ka1=10−4.19≈6.46×10−5K_{a1}=10^{-4.19}\approx6.46\times10^{-5}
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第 10 題

Which of the following structural biology methods is best suited to obtaining a reconstruction of spike (S) protein of SARS-CoV-2 binding with a host receptor?

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核心觀念

本題考查不同結構生物學方法的解析對象、解析度與適用範圍,重點是判斷哪一種方法最適合重建「SARS-CoV-2 棘蛋白(spike protein, S protein)與宿主受體結合時的複合體結構」。

SARS-CoV-2 的 S protein 是大型、具高度醣基化的膜融合醣蛋白,呈現三聚體(trimer)結構,且與宿主受體 ACE2(angiotensin-converting enzyme 2)結合時會發生構形變化,例如 receptor-binding domain(RBD)由「down」轉為較容易接觸受體的「up」構形。

題目要求的是取得 S protein 與宿主受體結合狀態的「reconstruction」,也就是觀察大型蛋白質複合體的整體三維結構與構形。此類目標最適合使用冷凍電子顯微鏡(cryo-electron microscopy, cryo-EM)。


解題方法

判斷結構生物學方法時,可依序分析三件事:

  1. 研究對象是小分子、單一蛋白質,還是大型蛋白質複合體。
  2. 目標是測量二級結構、解析原子級結構,還是重建整體三維構形。
  3. 樣品是否具有大型、柔性、醣基化、膜蛋白等特性。

S protein–ACE2 複合體具有以下特徵:

  • S protein 為大型三聚體醣蛋白。
  • S protein 含有多個構形狀態,具有明顯柔性。
  • S protein 與受體結合後形成大型蛋白質複合體。
  • 蛋白質表面醣基化程度高。
  • 研究重點是複合體的整體三維重建,以及 RBD 與 ACE2 的相對位置。

cryo-EM 可將蛋白質樣品快速冷凍於玻璃態冰中,在接近天然狀態下收集大量單顆粒影像,再利用單顆粒分析(single-particle analysis)與三維重建,得到 S protein–ACE2 複合體的結構。因此最符合題目所描述的研究目的。


選項分析

(A) Circular dichroism, CD(圓二色性光譜)

CD 主要用來分析蛋白質的整體二級結構比例,例如:

  • α\alpha-helix(α\alpha-螺旋)
  • β\beta-sheet(β\beta-摺板)
  • random coil(無規則捲曲)

CD 光譜可用來觀察蛋白質摺疊、變性、配體結合或環境改變造成的二級結構變化,但不能提供 S protein–ACE2 複合體的高解析度三維影像,也不能直接顯示受體與 S protein 的結合介面及各結構域的空間位置。

因此 CD 不適合用來取得本題所要求的複合體結構重建。

錯誤。


(B) X-ray crystallography(X 光晶體學)

X-ray crystallography 可在蛋白質形成高品質晶體後,藉由 X 光繞射資料建立電子密度圖,進而解析蛋白質的原子級三維結構。其優點是解析度高,適合研究:

  • 小型蛋白質或蛋白質結構域
  • 酵素活性中心
  • 配體與蛋白質的結合方式
  • 蛋白質–蛋白質交互作用介面

然而,本題的研究對象是大型、柔性的 S protein–受體複合體。此複合體具有醣基化、構形異質性及較大的分子量,通常較難獲得適合 X 光繞射的規則晶體。即使成功結晶,晶體中的構形也可能只代表某一種固定狀態,無法充分呈現 S protein 在接近天然狀態下的多種構形。

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第 11 題

Which of the following molecular bonds primarily affect the mechanical properties of α\alpha-keratin, such as tensile strength and hardness?

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核心觀念

本題考查 α\alpha-keratin(α\alpha-角蛋白)的分子結構與機械性質,尤其是 tensile strength(抗張強度)與 hardness(硬度)所主要受到的鍵結影響。

α\alpha-keratin 的基本結構如下:

  1. 胜肽鏈以 α\alpha-helix(α\alpha-螺旋)存在。
  2. 多條 α\alpha-螺旋彼此纏繞形成 coiled-coil(捲曲螺旋)。
  3. 進一步組成 intermediate filaments(中間絲)。
  4. 不同角蛋白鏈之間由 cysteine(半胱胺酸)殘基形成 disulfide bonds(二硫鍵),產生交聯,使整體結構更堅固。

半胱胺酸側鏈的硫氫基可經氧化形成二硫鍵:

2R−SH+[O]→R−S−S−R+HX2O2\ce{R-SH}+\ce{[O]}\rightarrow\ce{R-S-S-R}+\ce{H2O}

其中 R−S−S−R\ce{R-S-S-R} 即為 disulfide bond。二硫鍵越多,角蛋白分子間的交聯程度越高,通常具有越高的硬度、抗拉強度與耐受性。

解題方法

判斷蛋白質機械性質時,重點在於辨認「能否把不同蛋白質鏈牢固交聯」的鍵結。

α\alpha-keratin 的抗張強度與硬度主要來自兩個層次:

  • α\alpha-螺旋與捲曲螺旋提供基本的纖維形狀。
  • cysteine 殘基間的二硫鍵提供分子鏈之間的共價交聯。

因此,本題所問的主要鍵結是二硫鍵,而非泛稱的共價鍵,也不是主要依靠較弱的離子作用力或凡得瓦力。

選項分析

(A) Disulfide bonds(二硫鍵)—正確

二硫鍵由兩個 cysteine 殘基的 −SH\ce{-SH} 基氧化形成,屬於蛋白質鏈之間的重要共價交聯。

在 α\alpha-keratin 中,二硫鍵能限制角蛋白鏈彼此滑動,使纖維結構更穩定,直接提升:

  • tensile strength(抗張強度)
  • hardness(硬度)
  • rigidity(剛性)
  • resistance to deformation(抗變形能力)

毛髮、指甲、羊毛與角等組織的硬度差異,也與二硫鍵交聯程度密切相關。二硫鍵較多、交聯程度較高的角蛋白通常較硬、較不易拉伸變形。

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第 12 題

Which of the following amino acids primarily affects the flexibility of proteins?

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核心觀念

本題考查胺基酸側鏈結構對蛋白質主鏈構形與柔軟度(flexibility)的影響。

蛋白質主鏈的可動性主要來自肽鍵兩側的旋轉,其中 ϕ\phi 與 ψ\psi 二面角會影響主鏈能採取的空間構形。多數胺基酸的側鏈與主鏈分離,主鏈具有相對較大的旋轉自由度;Proline(脯胺酸)的側鏈則與主鏈胺基氮形成環狀結構,使主鏈受到明顯限制。

Proline 的 α\alpha-胺基氮被納入五元環,結構如下概念所示:

Proline:主鏈胺基氮與側鏈形成環狀結構\text{Proline:主鏈胺基氮與側鏈形成環狀結構}

因此,Proline 會限制 ϕ\phi 角的旋轉範圍,使蛋白質主鏈較為剛性,並容易造成主鏈彎折(bend)或轉角(turn)。在 α\alpha-helix 中,Proline 也常被稱為「螺旋破壞者」(helix breaker),因為其環狀結構會干擾規則的氫鍵排列。

解題方法

題目詢問「主要影響蛋白質柔軟度」的胺基酸,切入點是比較各選項的側鏈結構:

  1. 是否限制主鏈 ϕ\phi、ψ\psi 二面角?
  2. 是否容易造成蛋白質主鏈彎折或構形改變?
  3. 是否具有特殊的環狀結構,能明顯改變蛋白質二級結構?

四個選項中,只有 Proline 的側鏈直接與主鏈胺基氮形成環狀結構,對主鏈旋轉自由度的影響最明顯。因此答案為 Proline。

須精確理解:Proline 並非單純「增加蛋白質柔軟度」,而是因為限制主鏈旋轉並促進彎折,對蛋白質的整體構形與局部柔軟度具有特別強的影響。依本題官方答案,選擇 Proline。

選項分析

(A) Phenylalanine(苯丙胺酸,Phe)錯誤

Phenylalanine 的側鏈為苯基:

−CHX2−CX6HX5\ce{-CH2-C6H5}

其特性包括:

  • 疏水性強;
  • 具有芳香環;
  • 常位於蛋白質內部的疏水核心;
  • 可參與芳香族側鏈間的疏水作用與 π\pi-相關作用。

Phenylalanine 的側鏈雖然體積較大,但並未與主鏈胺基氮形成環狀結構,因此不會像 Proline 一樣明顯限制主鏈 ϕ\phi 角。其主要功能是參與蛋白質的疏水核心與結構穩定,而非主要調控主鏈柔軟度。

(B) Proline(脯胺酸,Pro)正確

Proline 的側鏈會回接至主鏈胺基氮,形成特殊的五元環。這種結構具有兩項重要效果:

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第 13 題

Proteins 1, 2, 3, and 4 each have a binding site for ligand X. According to the following dissociation constants with ligand X, which protein has the highest affinity for ligand X?

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核心觀念

本題考查配體(ligand)與蛋白質結合的解離常數(dissociation constant, KdK_d)與結合親和力(affinity)的關係。

蛋白質 PP 與配體 XX 的可逆結合可表示為:

P+X⇌PXP+X \rightleftharpoons PX

其解離常數定義為:

Kd=[P][X][PX]K_d=\frac{[P][X]}{[PX]}

KdK_d 代表蛋白質—配體複合物解離的傾向:

  • KdK_d 越小:越不容易解離,表示結合越緊密,親和力越高。
  • KdK_d 越大:越容易解離,表示結合較弱,親和力越低。

因此,本題只需比較四個蛋白質的 KdK_d 大小,選擇數值最小者。

解題方法

各選項的解離常數為:

Protein 1:3.0×10−7 MProtein 2:4.0×10−8 MProtein 3:2.0×10−5 MProtein 4:6.0×10−4 M\begin{aligned} \text{Protein 1}:&\quad 3.0\times10^{-7}\ \mathrm{M}\\ \text{Protein 2}:&\quad 4.0\times10^{-8}\ \mathrm{M}\\ \text{Protein 3}:&\quad 2.0\times10^{-5}\ \mathrm{M}\\ \text{Protein 4}:&\quad 6.0\times10^{-4}\ \mathrm{M} \end{aligned}

比較科學記號的次方:

10−8<10−7<10−5<10−410^{-8}<10^{-7}<10^{-5}<10^{-4}

其中 4.0×10−8 M4.0\times10^{-8}\ \mathrm{M} 最小,因此 Protein 2 與 ligand X 的結合最緊密,具有最高的結合親和力。

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第 14 題

Which of the following proteins performs oxygen binding in the blood?

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核心觀念

本題考查血液中蛋白質的主要功能,尤其是「氧氣結合與運輸」。

**Hemoglobin(血紅素)**是存在於紅血球內的運輸蛋白,由四個 globin 次單元組成,每個次單元含有一個 heme(血基質)。heme 中心的二價鐵 FeX2+\ce{Fe^{2+}} 可與氧分子可逆性結合:

Hb+OX2⇌HbOX2\ce{Hb + O2 <=> HbO2}

在肺部,氧分壓較高,Hemoglobin 結合氧氣形成 oxyhemoglobin(氧合血紅素);在周邊組織,氧分壓較低,Hemoglobin 釋放氧氣供細胞進行有氧代謝。

Hemoglobin 具有協同性結合(cooperative binding):第一個 OX2\ce{O2} 結合後,會促進其他 heme 部位結合氧氣,使氧氣解離曲線呈 S 型。這是血液能有效在肺部載氧、在組織釋氧的重要機制。

解題方法

判斷本題可直接依據「各血漿蛋白或血球蛋白的主要功能」逐一比對:

  • 負責血液中氧氣結合與運輸:Hemoglobin
  • 負責結締組織的結構支撐:Collagen
  • 負責維持血漿膠體滲透壓並運輸多種小分子:Albumin
  • 負責免疫防禦:Gamma globulin

因此,執行 blood oxygen binding 的蛋白質是 Hemoglobin。

選項分析

(A) Hemoglobin

正確。

Hemoglobin 位於紅血球內,含有 heme,其 FeX2+\ce{Fe^{2+}} 可與 OX2\ce{O2} 可逆性結合,主要功能是:

  1. 在肺部結合氧氣。
  2. 隨血液運送氧氣至周邊組織。
  3. 在組織釋放氧氣,供粒線體進行 oxidative phosphorylation(氧化磷酸化)。

每個 Hemoglobin 分子含有四個 heme,因此最多可結合四個氧分子。其氧氣結合能力受氧分壓、COX2\ce{CO2} 濃度、pH 與 2,3-BPG 等因素調節。

(B) Collagen

錯誤。

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第 15 題

When a polymer of 18 residues forms an α\alpha-helix, how many repeats would you expect it to have?

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核心觀念

本題考查蛋白質二級結構中 α\alpha-helix(α\alpha-螺旋)的幾何特徵。

在典型的右手 α\alpha-helix 中:

  • 每一圈螺旋約包含 3.63.6 個胺基酸殘基(residues)。
  • 每一圈稱為一個 helix repeat(螺旋重複單位)或一個 turn。
  • 螺旋骨架主要由第 ii 個殘基的 C=O\ce{C=O} 與第 i+4i+4 個殘基的 N−H\ce{N-H} 形成氫鍵,以穩定螺旋結構。
  • 每一圈沿螺旋軸的上升距離約為 0.54 nm0.54\ \mathrm{nm},平均每個殘基上升約 0.15 nm0.15\ \mathrm{nm}。

解題方法

題目給定聚合物共有 1818 個 residues,問形成 α\alpha-helix 時具有幾個 repeats。

利用:

repeats=殘基總數每一圈的殘基數\text{repeats}=\frac{\text{殘基總數}}{\text{每一圈的殘基數}}

代入 α\alpha-helix 的結構參數:

repeats=183.6=5\text{repeats}=\frac{18}{3.6}=5

因此,1818 個胺基酸殘基可形成約 55 圈 α\alpha-helix。

選項分析

  • (A) 5:正確。
    α\alpha-helix 每圈約有 3.63.6 個 residues,因此:
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第 16 題

Which of the following molecules is an enzyme?

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核心觀念

本題考查「酵素(enzyme)」與「一般具有生理功能的蛋白質」之區別。

酵素是具有催化作用的生物分子,能降低反應的活化能,使特定化學反應速率加快;反應前後酵素本身不被消耗。多數酵素是蛋白質,少數則為具有催化能力的 RNA,稱為 ribozyme(核酶)。

本題四個選項皆與蛋白質有關,但只有 Trypsin(胰蛋白酶) 具有催化作用,因此答案為 C。

解題方法

判斷各選項是否為酵素時,應看其主要功能是否為「催化化學反應」,而非僅依據其是否為蛋白質。

Trypsin 是消化系統中的蛋白水解酵素,屬於 serine protease(絲胺酸蛋白酶)。它催化蛋白質或多胜肽中胜肽鍵的水解反應:

RX1−CO−NH−RX2+HX2O→trypsinRX1−COOH+HX2N−RX2\ce{R1-CO-NH-R2 + H2O ->[trypsin] R1-COOH + H2N-R2}

Trypsin 對 lysine(離胺酸,Lys)或 arginine(精胺酸,Arg)羧基端附近的胜肽鍵具有偏好性。其活性中心包含典型的 catalytic triad(催化三聯體):

  • Ser195(絲胺酸)
  • His57(組胺酸)
  • Asp102(天冬胺酸)

其中 Ser195 直接參與胜肽鍵水解;His57 協助質子轉移;Asp102 則穩定 His57 的帶電狀態。這些特徵顯示 Trypsin 是真正的催化蛋白質。

選項分析

(A) Fibrin(纖維蛋白)錯誤

Fibrin 是血液凝固時形成的纖維狀蛋白,主要功能是形成網狀結構,捕捉血球並加強血塊。

血液凝固過程中,酵素 thrombin(凝血酶)會切割 fibrinogen(纖維蛋白原),使其轉變為 fibrin:

Fibrinogen→thrombinFibrin\text{Fibrinogen} \xrightarrow{\text{thrombin}} \text{Fibrin}

因此,負責催化此步驟的是 thrombin,而不是 fibrin。Fibrin 本身主要是凝血後的結構性產物,不屬於酵素。

(B) Albumin(白蛋白)錯誤

Albumin 是血漿中含量最多的蛋白質,主要功能包括:

  • 維持血液膠體滲透壓
  • 運輸脂肪酸、膽紅素、藥物及部分荷爾蒙
  • 作為血漿中的蛋白質儲備
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第 17 題

What type of inhibitor X is shown in this Lineweaver–Burk plot?

🖼️【此處有附圖,請對照原卷】

本題附圖正在準備中,以下為原卷對應頁面:
原卷第 2 頁

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核心觀念

本題考查酵素抑制作用在 **Lineweaver–Burk plot(雙倒數作圖)**上的判讀。

Lineweaver–Burk 方程式為:

1v0=KmVmax⁡1[S]+1Vmax⁡\frac{1}{v_0} = \frac{K_m}{V_{\max}}\frac{1}{[S]} + \frac{1}{V_{\max}}

其中:

  • 斜率為 KmVmax⁡\frac{K_m}{V_{\max}}
  • yy 軸截距為 1Vmax⁡\frac{1}{V_{\max}}
  • xx 軸截距為 −1Km-\frac{1}{K_m}

解題方法

圖中 inhibitor X 與 no inhibitor 的兩條直線呈現近似平行,表示:

  • 斜率 KmVmax⁡\frac{K_m}{V_{\max}} 不變
  • yy 軸截距上升,表示 1Vmax⁡\frac{1}{V_{\max}} 增加,即表觀 Vmax⁡V_{\max} 降低
  • xx 軸截距向左移,表示表觀 KmK_m 降低

這是 **uncompetitive inhibition(反競爭性抑制)**的典型特徵。

反競爭性抑制劑只與酵素—受質複合體 ESES 結合:

E+S⇌ES→E+PE + S \rightleftharpoons ES \rightarrow E + P ES+I⇌ESIES + I \rightleftharpoons ESI

抑制劑不與游離酵素 EE 結合,因此會同時降低表觀 KmK_m 與 Vmax⁡V_{\max},且兩者以相同比例改變:

Km′=Kmα′Vmax⁡′=Vmax⁡α′K_m'=\frac{K_m}{\alpha'} \qquad V_{\max}'=\frac{V_{\max}}{\alpha'}

因此:

Km′Vmax⁡′=KmVmax⁡\frac{K_m'}{V_{\max}'} = \frac{K_m}{V_{\max}}

斜率不變,兩條線便呈現平行。

選項分析

(A) Competitive inhibition:錯誤

Competitive inhibition(競爭性抑制)中,抑制劑與受質競爭游離酵素的活性部位:

E+I⇌EIE+I\rightleftharpoons EI
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第 18 題

Sarin is an extremely toxic synthetic organophosphorus compound. It is a potent inhibitor of acetylcholinesterase. What type of inhibitor does Sarin belong to?

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核心觀念

本題考查酵素抑制作用的分類,以及有機磷化合物對乙醯膽鹼酯酶(acetylcholinesterase, AChE)的抑制機轉。

Sarin(沙林)屬於有機磷化合物,會與 AChE 活性部位的絲胺酸(serine)殘基形成穩定的共價鍵,使酵素失去催化能力。其反應可概念化表示為:

AChE-Ser-OH+Sarin⟶AChE-Ser-O-P(=O)(...)\text{AChE-Ser-OH}+\text{Sarin} \longrightarrow \text{AChE-Ser-O-P(=O)(...)}

AChE 正常負責催化乙醯膽鹼(acetylcholine, ACh)的水解:

Acetylcholine+HX2O→AChECholine+Acetate\ce{Acetylcholine + H2O ->[AChE] Choline + Acetate}

Sarin 將 AChE 的活性部位共價修飾後,乙醯膽鹼無法被有效分解,導致突觸間乙醯膽鹼大量累積,產生膽鹼性中毒。

解題方法

判斷酵素抑制劑類型時,先看抑制劑與酵素之間的作用是否形成共價鍵:

  • 只以非共價作用力暫時結合,通常屬於可逆性抑制。
  • 形成穩定共價鍵,使酵素長時間失去活性,屬於不可逆性抑制。

Sarin 會共價磷酸化 AChE 活性部位的 serine 殘基。即使移除游離的 Sarin,已被修飾的酵素仍無法恢復正常活性;因此歸類為不可逆抑制劑(irreversible inhibitor)。

在生理與毒理學上,Sarin 所形成的有機磷化酵素複合物還可能發生「老化」(aging),使酵素與有機磷基團的鍵結更加穩定,進一步降低復活 AChE 的機會。

選項分析

(A) Competitive inhibition:競爭性抑制,錯誤

競爭性抑制劑通常與受質競爭同一個活性部位,但主要以非共價方式結合。其典型動力學特徵為:

Vmax⁡ 不變,Km 上升V_{\max}\ \text{不變},\qquad K_m\ \text{上升}

增加受質濃度可部分克服競爭性抑制。

Sarin 雖然作用在 AChE 的活性部位,但其關鍵並非單純占據活性部位,而是與 serine 形成共價鍵,使酵素遭到化學修飾。因此不能歸為一般的競爭性抑制。

(B) Uncompetitive inhibition:反競爭性抑制,錯誤

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第 19 題

Which of the following descriptions of the Michaelis–Menten equation is correct?

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核心觀念

本題考查 Michaelis–Menten equation(米氏方程式)及其參數 KmK_m、Vmax⁡V_{\max}、[S][S] 的意義。

單一受質酵素反應可表示為:

E+S⇌kX−1kX1ES→kXcatE+P\ce{E + S <=>[k_1][k_{-1}] ES ->[k_{cat}] E + P}

其中:

  • E\ce{E}:游離酵素(enzyme)
  • S\ce{S}:受質(substrate)
  • ES\ce{ES}:酵素—受質複合體(enzyme–substrate complex)
  • P\ce{P}:產物(product)
  • V0V_0:初始反應速率(initial velocity)
  • Vmax⁡V_{\max}:酵素被受質完全飽和時的最大反應速率
  • KmK_m:Michaelis constant(米氏常數)

Michaelis–Menten equation 為:

V0=Vmax⁡[S]Km+[S]V_0=\frac{V_{\max}[S]}{K_m+[S]}

在標準假設下:

Km=k−1+kcatk1K_m=\frac{k_{-1}+k_{cat}}{k_1}

KmK_m 越小,通常代表酵素在較低受質濃度下即可達到較高反應速率,通常解讀為對受質具有較高表觀親和力;KmK_m 越大,則通常代表表觀親和力較低。

需注意,KmK_m 嚴格而言不一定等於酵素與受質的解離常數 KdK_d。只有在 kcat≪k−1k_{cat}\ll k_{-1} 的條件下,才可近似視為:

Km≈KdK_m\approx K_d

解題方法

直接利用 Michaelis–Menten equation 的兩個關鍵關係:

1. 當 [S]=Km[S]=K_m 時

代入公式:

V0=Vmax⁡KmKm+Km=Vmax⁡Km2Km=12Vmax⁡V_0=\frac{V_{\max}K_m}{K_m+K_m} =\frac{V_{\max}K_m}{2K_m} =\frac{1}{2}V_{\max}

因此:

[S]=Km⟺V0=12Vmax⁡[S]=K_m \Longleftrightarrow V_0=\frac{1}{2}V_{\max}

2. 當 [S]≫Km[S]\gg K_m 時

分母中的 KmK_m 相對於 [S][S] 很小,因此:

V0=Vmax⁡[S]Km+[S]≈Vmax⁡[S][S]=Vmax⁡V_0=\frac{V_{\max}[S]}{K_m+[S]} \approx\frac{V_{\max}[S]}{[S]} =V_{\max}

所以,達到 Vmax⁡V_{\max} 的條件是受質濃度遠高於 KmK_m,而不是 Km=[S]K_m=[S]。


選項分析

(A) Km=[S]K_m=[S] when V0=Vmax⁡V_0=V_{\max}

錯誤。

當:

Km=[S]K_m=[S]

代入 Michaelis–Menten equation 可得:

V0=Vmax⁡[S]Km+[S]=Vmax⁡2V_0=\frac{V_{\max}[S]}{K_m+[S]} =\frac{V_{\max}}{2}

因此,Km=[S]K_m=[S] 對應的是:

V0=12Vmax⁡V_0=\frac{1}{2}V_{\max}

而不是 V0=Vmax⁡V_0=V_{\max}。

當 V0V_0 接近 Vmax⁡V_{\max} 時,應符合:

[S]≫Km[S]\gg K_m

(B) Km≪[S]K_m\ll[S] when V0=12Vmax⁡V_0=\frac{1}{2}V_{\max}

錯誤。

由:

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第 20 題

Which of the following enzyme reactions does NOT obey Michaelis–Menten kinetics?

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核心觀念

本題考查酵素反應機制與 Michaelis–Menten kinetics(米氏動力學)的適用範圍。

最基本的 Michaelis–Menten 模型假設酵素先與單一受質形成酵素-受質複合體,再生成產物:

E+S⇌kX−1kX1ES→kX2E+P\ce{E + S <=>[k_1][k_{-1}] ES ->[k_2] E + P}

其速率方程式為:

v=Vmax⁡[S]Km+[S]v=\frac{V_{\max}[S]}{K_m+[S]}

其中:

  • vv:反應初速率
  • Vmax⁡V_{\max}:酵素被受質飽和時的最大速率
  • [S][S]:受質濃度
  • KmK_m:Michaelis constant(米氏常數)

典型 Michaelis–Menten kinetics 的特徵是:反應速率與受質濃度呈雙曲線關係,且通常只涉及「一個受質先與酵素形成 ESES 複合體」的簡化模型。

多受質酵素反應則可分為:

  1. Sequential mechanism(連續型機制):兩個受質都先與酵素結合,形成 ternary complex(三級複合體)後才產生產物。
  2. Ping-pong mechanism(乒乓型機制):第一個受質反應並釋放第一個產物後,酵素先轉變為另一種形式,再與第二個受質反應。
  3. Double-displacement mechanism(雙置換型反應):通常指反應過程中先置換一個基團,再由另一個受質完成第二次置換,常涉及酵素的共價修飾或中間型態。

解題方法

本題應先判斷各選項所代表的機制,並比較其是否能直接套用最基本的單一受質 Michaelis–Menten 方程式。

依亞洲大學本題官方公布答案,命題者將 Double-displacement reactions 視為不符合典型 Michaelis–Menten kinetics 的反應類型,因此選:

(A) Double-displacement reactions\boxed{\text{(A) Double-displacement reactions}}

判斷重點在於:雙置換反應並非單純的

E+S⇌ES→E+P\ce{E + S <=> ES -> E + P}

而是酵素在反應過程中會先形成改變後的酵素中間型態,再接受另一個受質或完成第二次基團轉移,因此基本的單一 ESES 模型不足以描述整個反應。


選項分析

(A) Double-displacement reactions——正確

Double-displacement reaction(雙置換反應)涉及兩個受質與兩次基團轉移。反應過程中,酵素可能先與第一個受質反應,形成 modified enzyme(修飾型酵素),並釋放第一個產物;接著修飾型酵素再與第二個受質反應,恢復原本的酵素形式並產生第二個產物。

概念上可表示為:

E+A→EX′+P\ce{E + A -> E' + P} EX′+B→E+Q\ce{E' + B -> E + Q}

由於反應中存在 E′E' 這種酵素中間型態,且兩個受質不會同時形成單一的 EABEAB 複合體,因此不能直接套用最基本的單一受質 Michaelis–Menten 方程式。

在本題的命題分類中,這是官方認定「不 obey Michaelis–Menten kinetics」的選項。


(B) Allosteric regulations——錯誤

Allosteric regulation(變構調控)是調節分子結合在酵素的 allosteric site(變構部位),改變酵素構形與活性的現象。

典型 allosteric enzyme(變構酵素)常具有多個次單元,且受質結合可能產生 cooperativity(協同性)。因此,嚴格而言,具強烈協同性的變構酵素常呈現 sigmoid curve(S 形曲線),而非典型 Michaelis–Menten 的雙曲線。

不過,本題將 allosteric regulation 視為調節酵素活性的方式,而非一種特定的基礎催化反應機制。變構調控本身不等於所有反應都必然完全不符合 Michaelis–Menten 關係;

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第 21 題

Which description is NOT correct?

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核心觀念

本題考查四種蛋白質調控或活化機制:

  1. 變構調控(allosteric regulation):調節分子與蛋白質結合後,引發構形變化,常涉及四級結構改變。
  2. 酵素原活化(zymogen activation):透過特定蛋白水解,切除抑制性胜肽,使酵素形成活性構形。
  3. 凝血級聯反應(blood coagulation cascade):多個凝血因子依序由酵素原轉變為活性蛋白酶。
  4. 醣基化(glycosylation):蛋白質接上醣鏈,主要影響摺疊、穩定性、運輸與細胞定位,不是最典型且最有效率的即時活性調控方式。

本題要求找出「不正確」的敘述,因此逐項判斷各敘述是否符合上述生化機制。


解題方法

判斷重點在於區分:

  • 變構調控是否涉及四級結構變化;
  • 酵素原是否藉由特定胜肽鍵切割而活化;
  • 凝血是否屬於酵素原連鎖活化;
  • 醣基化的主要功能是否是直接調節標的蛋白質活性。

前三項皆符合經典生化學描述;第四項將醣基化的功能過度概括為「高度有效的活性調控方式」,因此為不正確敘述。


選項分析

(A) Allosteric interactions in aspartate transcarbamoylase (ATCase) are mediated by large changes in quaternary structure.

此敘述正確。

ATCase(天門冬胺酸轉胺甲醯酶)是嘧啶核苷酸生合成的重要酵素,催化:

Carbamoyl phosphate+L−aspartate→N−carbamoylaspartate+Pi\ce{Carbamoyl\ phosphate + L-aspartate -> N-carbamoylaspartate + Pi}

ATCase由催化次單元與調節次單元組成,典型結構可表示為:

CX3RX2\ce{C3R2}

其中:

  • CX3\ce{C3}:三聚體催化核心;
  • RX2\ce{R2}:二聚體調節單元。

ATCase具有兩種主要構形:

  • T state(tense state):低活性構形;
  • R state(relaxed state):高活性構形。

當底物與酵素結合,或調節分子影響調控區域時,催化次單元與調節次單元會發生相對位移,造成明顯的四級結構變化,使活性位點更適合進行反應。因此,ATCase的變構作用確實是由大型四級結構變化所媒介。


(B) Chymotrypsinogen is activated by specific cleavage of a single peptide bond.

此敘述在標準酵素原活化的考法中正確。

Chymotrypsinogen(胰凝乳蛋白酶原)是由胰臟分泌的酵素原,本身缺乏成熟胰凝乳蛋白酶的完整活性。它在小腸中受到 trypsin(胰蛋白酶)作用,切割特定的胜肽鍵:

ArgX15−IleX16\ce{Arg^{15}-Ile^{16}}

切割後形成 π\pi-chymotrypsin,新的 IleX16\ce{Ile^{16}} N端會產生離子鍵與氫鍵,促使蛋白質重新排列成具有活性的構形。

後續胰凝乳蛋白酶可進行自我切割,形成較成熟的 α\alpha-chymotrypsin 與 β\beta-chymotrypsin。不過,題目所指的「活化」是酵素原最初藉由特定胜肽鍵切割而取得活性的步驟,核心切割位置為 ArgX15−IleX16\ce{Arg^{15}-Ile^{16}},因此此敘述判定為正確。


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第 22 題

Which of the following characteristics describe glycoproteins?

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核心觀念

本題考查醣蛋白(glycoproteins)、蛋白聚醣(proteoglycans)與醣胺聚醣(glycosaminoglycans, GAGs)的結構差異,以及醣鏈與蛋白質的連接方式。

  • 醣蛋白:蛋白質上連接一條或多條通常較短、分支程度較高的寡醣鏈(oligosaccharides)。
  • 蛋白聚醣:蛋白質上連接一條或多條很長、重複二醣單位組成的 GAG 鏈。
  • N-linked glycosylation:醣鏈以 NN-醣苷鍵連接至天門冬醯胺(Asn, asparagine)的側鏈醯胺氮,常見於序列基序:
Asn−X−Ser/Thr\mathrm{Asn-X-Ser/Thr}

其中 XX 通常不能是 Pro(脯胺酸)。

  • O-linked glycosylation:醣鏈以 OO-醣苷鍵連接至 Ser(絲胺酸)或 Thr(蘇胺酸)的羥基。

本題要求選出描述 glycoproteins 的正確敘述,官方答案為 C。


解題方法

判斷各選項時,依序檢查三件事:

  1. 該結構是否為醣蛋白的典型特徵?
  2. 該敘述是否把醣蛋白與蛋白聚醣或 GAG 混淆?
  3. 是否使用「exclusively」「only」等絕對化字眼;這類敘述通常容易因存在例外而錯誤。

選項分析

(A) Exclusively located at the cell surface and in the extracellular matrix.

錯誤。

醣蛋白並非只存在於細胞表面與細胞外基質(extracellular matrix, ECM)。雖然許多細胞膜蛋白與分泌蛋白是醣蛋白,例如:

  • 細胞膜受體(cell-surface receptors)
  • 細胞黏附分子(cell adhesion molecules)
  • 抗體(immunoglobulins)
  • 某些血漿蛋白
  • 細胞外基質相關蛋白

但醣蛋白也可存在於細胞內,例如:

  • 內質網(endoplasmic reticulum)與高基氏體(Golgi apparatus)中的醣蛋白
  • 溶小體酵素(lysosomal enzymes)
  • 部分細胞內醣蛋白與分泌途徑相關蛋白

因此,「exclusively located」過度限縮分布範圍,並非醣蛋白的普遍定義。


(B) Include the heparan sulfate family.

錯誤。

Heparan sulfate(硫酸乙醯肝素)屬於醣胺聚醣(GAG)家族,主要由重複的二醣單位構成,常包含:

  • GlcNAc\ce{GlcNAc}:NN-乙醯葡萄糖胺
  • IdoA\ce{IdoA} 或 GlcA\ce{GlcA}:艾杜糖醛酸或葡萄糖醛酸

其部分醣基會被硫酸化,形成帶高度負電荷的長鏈多醣。

Heparan sulfate 通常以 GAG 鏈形式共價連接至核心蛋白(core protein),形成 heparan sulfate proteoglycan,例如細胞膜上的 syndecan 與細胞外基質中的 perlecan。這類分子分類上屬於蛋白聚醣,而非一般所稱的醣蛋白。

關鍵差異如下:

特徵醣蛋白蛋白聚醣
醣鏈較短的寡醣鏈很長的 GAG 鏈
醣鏈結構通常分支較多重複二醣單位
醣所占比例通常較低可占分子的大部分
例子抗體、許多膜蛋白heparan sulfate proteoglycan
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第 23 題

What is the major component of vascular plant cell walls?

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核心觀念

本題考查植物細胞壁的主要組成,以及多醣分類與生物分布。

維管束植物(vascular plants)的細胞壁主要由下列物質構成:

  • Cellulose(纖維素):由許多 β\beta-D-glucose 以 β(1→4)\beta(1\rightarrow4) 糖苷鍵連接而成,屬於結構性多醣。
  • Hemicellulose(半纖維素):填充於纖維素微纖維之間。
  • Pectin(果膠):富含半乳糖醛酸,協助細胞壁保水與細胞間黏著。
  • Lignin(木質素):主要存在於木質部等次生細胞壁,增加硬度與抗壓性。

其中,提供細胞壁主要拉伸強度與骨架結構的是 cellulose。

纖維素的基本結構可表示為:

[β-D-Glucose]n\left[\mathrm{\beta\text{-}D\text{-}Glucose}\right]_n

葡萄糖單體間以 β(1→4)\beta(1\rightarrow4) 糖苷鍵連接,形成直鏈;多條纖維素鏈再藉由氫鍵排列成 cellulose microfibrils(纖維素微纖維),構成植物細胞壁的重要支架。

解題方法

判斷細胞壁主要成分時,先辨認題目所指的生物:

  1. 題目指定為 vascular plant(維管束植物)。
  2. 植物細胞壁的主要骨架是由纖維素微纖維形成。
  3. 因此答案選擇 Cellulose。

本題不涉及代謝途徑、酵素反應或計算;關鍵在於將「細胞壁」與不同生物的特徵性結構分子對應:

  • 植物:cellulose
  • 細菌:peptidoglycan
  • 動物細胞外基質:glycosaminoglycans 等

選項分析

(A) Homopolysaccharide(同型多醣)

此選項是多醣的分類名稱,不是特定分子。Homopolysaccharide 指由單一種類單醣重複組成的多醣;纖維素確實屬於 homopolysaccharide,因為它只由 glucose 構成。

但題目詢問的是維管束植物細胞壁的主要成分,應選擇具體名稱 cellulose。因此此選項概念上與纖維素有關,但表述過於廣泛,並非本題最佳答案。

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第 24 題

Which of the following carbohydrates is a heteropolysaccharide?

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核心觀念

多醣可依組成單醣種類分為:

  • 同多醣(homopolysaccharide):由同一種單醣反覆聚合而成。
  • 異多醣(heteropolysaccharide):由兩種或以上不同的單醣組成,常伴隨其他非糖類成分。

本題要判斷各選項的基本組成。只要確認其是否含有不同種類的單醣,即可判斷是否屬於 heteropolysaccharide。

解題方法

逐一辨認各多醣的單體:

  1. 若主要只由葡萄糖(glucose)構成,屬於同多醣。
  2. 若由兩種不同的胺基糖交替排列,且另有胜肽交聯結構,則屬於異多醣。
  3. 依此判斷四個選項。

選項分析

(A)Starch(澱粉)錯誤

澱粉是植物的儲存性多醣,主要由 α\alpha-D-glucose(α\alpha-D-葡萄糖)組成,包含兩種結構:

  • Amylose(直鏈澱粉):以 α(1→4)\alpha(1\rightarrow4) 糖苷鍵連接。
  • Amylopectin(支鏈澱粉):主鏈含 α(1→4)\alpha(1\rightarrow4) 糖苷鍵,分支處含 α(1→6)\alpha(1\rightarrow6) 糖苷鍵。

雖然 amylose 與 amylopectin 的分支型態不同,但其基本單醣皆為 glucose,因此 starch 是同多醣,不是 heteropolysaccharide。

(B)Peptidoglycan(肽聚醣)正確

Peptidoglycan 是細菌細胞壁的重要結構成分,其多醣骨架由兩種不同的胺基糖交替排列而成:

  • NN-acetylglucosamine,NAG(NN-乙醯葡萄糖胺)
  • NN-acetylmuramic acid,NAM(NN-乙醯胞壁酸)

NAG 與 NAM 以 β(1→4)\beta(1\rightarrow4) 糖苷鍵交替連接,形成長鏈:

NAG−NAM−NAG−NAM\text{NAG}-\text{NAM}-\text{NAG}-\text{NAM}
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第 25 題

Which of the following carbohydrates is a reducing sugar?

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核心觀念

本題考「還原糖(reducing sugar)」的判定。

還原糖必須具備:

  1. 有游離的異頭碳(anomeric carbon)。
  2. 能在水溶液中形成開鏈型(open-chain form)。
  3. 開鏈型含有醛基 −CHO\ce{-CHO},或能經互變異構形成可被氧化的醛糖結構。
  4. 因此可將 Tollens 試劑中的 AgX+\ce{Ag+} 還原為銀,或將 Benedict/Fehling 試劑中的 CuX2+\ce{Cu^{2+}} 還原為氧化亞銅 CuX2O\ce{Cu2O}。

判斷重點不是「是否含有氧」,而是「是否存在可開鏈的游離異頭碳」。


解題方法

逐一判斷各碳水化合物是否具有可反應的異頭碳:

  • 單醣通常具有游離異頭碳,因此多數為還原糖。
  • 若雙醣的兩個異頭碳都參與糖苷鍵,則無法開鏈,屬於非還原糖。
  • 多醣在基礎考試分類中通常視為非還原性多醣;嚴格而言,部分多醣仍保有一個還原端,見後文爭議說明。

選項分析

(A) Fructose(果糖)—正確

Fructose 是酮己糖(ketohexose),其主要環狀形式為呋喃糖型(fructofuranose),異頭碳為 C-2\ce{C-2}。

雖然果糖本身是酮糖,沒有典型的醛基,但在鹼性溶液中可經由烯二醇(enediol)中間物發生互變異構:

Fructose⇌enediol intermediate⇌glucose 或 mannose\text{Fructose} \rightleftharpoons \text{enediol intermediate} \rightleftharpoons \text{glucose 或 mannose}

形成 glucose(葡萄糖)或 mannose(甘露糖)等醛糖後,即可產生開鏈型醛基 −CHO\ce{-CHO},並將 CuX2+\ce{Cu^{2+}} 或 AgX+\ce{Ag+} 還原。

因此,果糖雖然是酮糖,仍屬於還原糖。

Fructose 是 reducing sugar\boxed{\text{Fructose 是 reducing sugar}}

(B) Cellulose(纖維素)—依本題分類錯誤

Cellulose 是由 β\beta-D-glucose 以 β(1→4)\beta(1\rightarrow4) glycosidic bond 連接而成的多醣:

Glucose−β(1→4)−Glucose\text{Glucose}-\beta(1\rightarrow4)-\text{Glucose}

在一般考試分類中,cellulose 被視為結構性多醣,不列為本題所要判定的典型還原糖。

嚴格的結構化學而言,纖維素鏈的末端仍有一個 reducing end,該端保有游離異頭碳,因此具有非常有限的還原性;但相較於單醣,反應性低,基礎選擇題通常不將 cellulose 作為標準答案。


(C) Starch(澱粉)—依本題分類錯誤

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第 26 題

Which description of an apurinic (AP) site in DNA is NOT correct?

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核心觀念

本題考查 DNA 中 apurinic site(AP site,去嘌呤位點) 的形成、修復位置與雙股 DNA 的熱力學穩定性。

AP site 又稱 abasic site(無鹼基位點),指 DNA 的去氧核糖—磷酸骨架仍存在,但某一位置的含氮鹼基已經脫落。若脫落的是嘌呤鹼基 adenine 或 guanine,稱為 apurinic site;若脫落的是 pyrimidine,則稱為 apyrimidinic site。兩者通常統稱為 AP site。

嘌呤鹼基與去氧核糖之間以 N-glycosidic bond(N-糖苷鍵) 連結,位置為嘌呤的 N9 與去氧核糖的 CX1X′\ce{C1'}:

Purine–N9–CX1X′ of deoxyribose\text{Purine--N9--}\ce{C1'}\text{ of deoxyribose}

當此鍵水解斷裂時,鹼基脫離,只留下無鹼基的去氧核糖—磷酸骨架,即形成 AP site。


解題方法

本題問的是 NOT correct,因此要找出敘述錯誤者。判斷可分為三步:

  1. 確認 AP site 是否能自發形成。
  2. 確認 AP site 是否為 base excision repair(BER,鹼基切除修復)的中間產物。
  3. 比較 AP site 與 mismatched base pair(錯配鹼基對)對 DNA 雙股穩定性的影響。

AP site 缺少鹼基,會同時失去:

  • 鹼基與互補鏈之間的氫鍵;
  • 鹼基堆疊所提供的穩定作用;
  • 正常雙股 DNA 的幾何結構。

因此 AP site 通常會使 DNA 雙股結構不穩定,而不會比錯配鹼基對更具熱力學穩定性。故不正確的敘述是 D。


AP site 的形成與修復機轉

1. 自發性去嘌呤

DNA 中的嘌呤—去氧核糖 N-糖苷鍵可自發水解:

DNA-purine+HX2O→DNA-AP site+free purine\text{DNA-purine} + \ce{H2O} \rightarrow \text{DNA-AP site} + \text{free purine}

因此 DNA 在正常生理條件下即可因自發性水解而產生 AP site,這屬於 spontaneous DNA damage(自發性 DNA 損傷)。

2. BER 中的 AP site

BER 主要修復單一鹼基受損的 DNA。其關鍵步驟如下:

  1. DNA glycosylase(DNA 糖苷酶) 辨認受損鹼基。
  2. 糖苷酶切斷受損鹼基與去氧核糖之間的 N-糖苷鍵。
  3. 形成 AP site。
  4. AP endonuclease(AP 核酸內切酶) 切開 AP site 鄰近的磷酸二酯骨架。
  5. 移除殘留的糖—磷酸片段。
  6. DNA polymerase(DNA 聚合酶) 補入正確核苷酸。
  7. DNA ligase(DNA 連接酶) 封合缺口。

因此,AP site 正是 BER 中由 DNA glycosylase 作用後產生的關鍵中間物。


選項分析

(A) An apurinic (AP) site is a kind of spontaneous DNA damage.

此敘述正確。

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第 27 題

During which step of the polymerase chain reaction (PCR) cycle do the primers bind to the template?

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核心觀念

PCR(polymerase chain reaction,聚合酶連鎖反應)每一循環主要包含三個步驟:

  1. Denaturation(變性):以高溫使雙股 DNA 的氫鍵斷裂,形成兩條單股模板。
  2. Annealing(引子退火):降低溫度,使 primers(引子)依鹼基互補原則與模板 DNA 的特定序列結合。
  3. Elongation/Extension(延伸):DNA polymerase(DNA 聚合酶)以引子的 3′3' 端為起點,加入 dNTP,合成新的互補 DNA 鏈。

因此,題目問「引子與模板結合」發生在哪一個 PCR 步驟,對應的是 Annealing。

解題方法

判斷關鍵在於區分 PCR 中「分開模板」、「引子結合」與「合成新鏈」三種事件:

  • 雙股 DNA 被分開:Denaturation。
  • primers 與單股模板互補配對:Annealing。
  • DNA polymerase 由引子 3′3' 端開始合成 DNA:Elongation。

引子與模板的結合本質上是鹼基互補配對,例如:

A−T,G−C\ce{A-T}, \qquad \ce{G-C}

這種配對需要在適當的較低溫度下進行,因此歸類於 PCR 的 Annealing step。

選項分析

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第 28 題

Which nucleosides below contain both purines?

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核心觀念

本題測驗核酸生化學(Nucleic Acid Biochemistry)中,組成核酸之含氮鹼基(Nitrogenous Bases)的分類與化學結構定義:

  1. 嘌呤(Purines):結構為雙環(六元環稠合五元咪唑環),常見種類包括:
  • 腺嘌呤(Adenine, A)
  • 鳥嘌呤(Guanine, G)
  1. 嘧啶(Pyrimidines):結構為單環(六元雜環),常見種類包括:
  • 胞嘧啶(Cytosine, C)
  • 胸腺嘧啶(Thymine, T)(主要存在於 DNA)
  • 尿嘧啶(Uracil, U)(主要存在於 RNA)

解題方法

題目詢問「下列何者皆含有嘌呤(both purines)?」,解題關鍵步驟為:

  1. 依據題目給予的單字母縮寫(A, G, C, T, U)識別對應的含氮鹼基。
  2. 檢視各選項中標示的鹼基分類,找出組成成員**皆屬於雙環嘌呤類(Purines)**的組合。
  3. (題目用詞說明)題幹使用「nucleosides」(核苷),但選項直接以代表鹼基的縮寫 A、T、C、G、U 呈現。在生化選擇題慣例中,常以鹼基縮寫指代對應之核苷(如 Adenosine、Guanosine 等)或直接指代其鹼基組成,核心考點即為分辨嘌呤與嘧啶。

選項分析

  • (A) A, T:錯誤。
  • A(Adenine,腺嘌呤):屬於嘌呤(Purine)。
  • T(Thymine,胸腺嘧啶):屬於嘧啶(Pyrimidine)。
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第 29 題

Which of the following enzymes is NOT required when cloning a foreign DNA fragment into a plasmid?

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核心觀念

將外來 DNA 片段(foreign DNA fragment)插入質體(plasmid)的基本分子選殖流程,通常包括:

  1. Restriction endonuclease(限制性內切酶)切割
  • 辨識特定 DNA 序列,切開外來 DNA 片段與質體。
  • 可產生互補的黏性末端(sticky ends)或平端(blunt ends)。
  1. DNA ligase(DNA 連接酶)接合
  • 將外來 DNA 片段與質體骨架排列在一起。
  • 催化相鄰核苷酸之間形成磷酸二酯鍵,使 DNA 骨架完整連接。
  1. DNA polymerase(DNA 聚合酶)
  • 主要負責 DNA 合成,例如 PCR 擴增、DNA 末端修補、填補突出端等。
  • 在某些外來 DNA 片段的製備或末端處理步驟中可能使用。
  1. DNA gyrase(DNA 旋轉酶)
  • 屬於 type II topoisomerase(第二型拓撲異構酶)。
  • 利用 ATP 暫時切開並重新接合 DNA,解除 DNA 超螺旋與複製、轉錄時產生的扭轉壓力。
  • 不負責切割選殖位點,也不負責連接外來 DNA 與質體。

本題依亞洲大學官方答案,判定不屬於外來 DNA 插入質體之必要選殖酵素者為 DNA gyrase。


解題方法

切入點是辨認各酵素在基因選殖流程中的主要功能:

  • 需要「切開 DNA」:Restriction endonuclease。
  • 需要「把 DNA 片段接起來」:DNA ligase。
  • 需要「合成或修補 DNA」:DNA polymerase 在某些前處理中可使用。
  • 只負責「調整 DNA 超螺旋」:DNA gyrase,並非外來 DNA 插入質體的接合酵素。

因此,選項中與「切割、合成、接合」無直接關係,且不屬於基本 cloning reaction 的酵素為 DNA gyrase。


選項分析

(A) Restriction endonuclease(限制性內切酶)—錯誤選項

限制性內切酶能辨識特定核苷酸序列,例如 palindrome sequence(迴文序列),並在特定位點切割 DNA。

在質體選殖中,通常使用相同的限制性內切酶切開:

  • 質體 DNA
  • 外來 DNA 片段

若兩者產生互補的黏性末端,外來 DNA 即可與質體進行鹼基配對,增加後續連接效率。因此此酵素是典型的基因選殖工具,不能選為答案。


(B) DNA ligase(DNA 連接酶)—錯誤選項

DNA ligase 負責封閉 DNA 骨架上的缺口,催化相鄰核苷酸之間形成磷酸二酯鍵。

在外來 DNA 插入質體的反應中,限制性內切酶先產生相容末端,DNA ligase 再將兩個 DNA 片段共價連接,形成重組質體(recombinant plasmid)。

其作用可概念化為:

外來 DNA 片段+質體 DNA→DNA ligase重組質體\text{外來 DNA 片段}+\text{質體 DNA} \xrightarrow{\text{DNA ligase}} \text{重組質體}

因此 DNA ligase 是基本選殖反應的核心酵素,不是本題答案。


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第 30 題

Which of the following methods is best suited to identify protein–protein interactions?

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核心觀念

本題考查「蛋白質—蛋白質交互作用(protein–protein interaction, PPI)」的偵測方法。

若要直接判斷兩個蛋白質是否能彼此結合,理想方法必須能:

  1. 同時提供兩個待測蛋白質;
  2. 使兩者接觸並產生可偵測訊號;
  3. 以訊號判定兩蛋白質是否發生交互作用。

解題方法

逐一判斷各選項主要偵測的生物分子與實驗目的:

  • Yeast two-hybrid analysis:專門用於偵測蛋白質—蛋白質交互作用。
  • Immunofluorescence:觀察蛋白質在細胞中的位置。
  • qPCR:定量特定核酸,通常是 mRNA。
  • ELISA:主要偵測抗原—抗體反應或蛋白質含量。

因此,最符合題目「identify protein–protein interactions」要求的是 Yeast two-hybrid analysis。

正確答案:A Yeast two-hybrid analysis

Yeast two-hybrid(酵母雙雜交法)利用轉錄因子可分為兩個功能模組的原理:

  • DNA-binding domain, BD(DNA 結合結構域)
  • Activation domain, AD(轉錄活化結構域)

實驗中將待測蛋白質分別與兩個結構域融合:

  • Bait protein(誘餌蛋白)與 BD 融合;
  • Prey protein(獵物蛋白)與 AD 融合。

若 bait 與 prey 能夠交互作用,會使 BD 與 AD 在空間上接近,重新組成具有功能的轉錄因子,進而活化報導基因(reporter gene)的轉錄。酵母細胞便會產生可觀察的訊號,例如生長於選擇性培養基,或產生顏色變化。

其基本機制可表示為:

Bait–BD+Prey–AD→蛋白質交互作用BD–AD 接近→轉錄活化Reporter gene 表現\text{Bait–BD} + \text{Prey–AD} \xrightarrow{\text{蛋白質交互作用}} \text{BD–AD 接近} \xrightarrow{\text{轉錄活化}} \text{Reporter gene 表現}

因此,報導基因是否表現即可作為蛋白質—蛋白質交互作用的間接指標。

選項分析

(A) Yeast two-hybrid analysis:正確

Yeast two-hybrid 是經典的 PPI 篩選與驗證方法,適合研究:

  • 兩個已知蛋白質是否彼此結合;
  • 一個蛋白質可能與哪些蛋白質交互作用;
  • 特定蛋白質交互作用所需的結構域。

此方法的核心是:蛋白質交互作用會使轉錄因子的 DNA-binding domain 與 activation domain 重新接近,造成報導基因表現。因此最適合本題所問的蛋白質—蛋白質交互作用偵測。

(B) Immunofluorescence:錯誤

Immunofluorescence(免疫螢光染色)利用帶有螢光標記的抗體,偵測特定蛋白質在細胞或組織中的位置與分布,例如:

  • 細胞核;
  • 細胞質;
  • 細胞膜;
  • 粒線體;
  • 內質網。
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第 31 題

Which of the following is NOT an omega-3 fatty acid?

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核心觀念

本題考查脂肪酸的 ω\omega(omega)分類與 Δ\Delta(delta)雙鍵位置表示法。

脂肪酸命名中的:

  • Δ\Delta 編號:由羧基端(carboxyl end)開始計算雙鍵位置。
  • ω\omega 編號:由甲基端(methyl end)開始計算,第一個雙鍵所在位置即為 ω\omega 類別。

若脂肪酸共有 NN 個碳,且最靠近甲基端的雙鍵位置為 Δk\Delta k,則:

ω-編號=N−k\omega\text{-編號}=N-k

因此:

  • 第一個雙鍵距離甲基端 3 個碳:ω\omega-3
  • 第一個雙鍵距離甲基端 6 個碳:ω\omega-6

判斷重點是找出最高的 Δ\Delta 數字,因為它代表最靠近甲基端的雙鍵。


解題方法

逐一取各選項的總碳數 NN,再以最高的 Δ\Delta 數字 kk 計算:

ω-編號=N−k\omega\text{-編號}=N-k

計算結果為 ω\omega-3 者,即為 omega-3 fatty acid;計算結果為 ω\omega-6 者,則不是 omega-3 fatty acid。


選項分析

(A) DHA,22:6(Δ4,7,10,13,16,19)22:6(\Delta4,7,10,13,16,19)

DHA(docosahexaenoic acid,二十二碳六烯酸)共有 22 個碳,最靠近甲基端的雙鍵為 Δ19\Delta19:

22−19=322-19=3

因此 DHA 是 ω\omega-3 脂肪酸。

DHA 的六個雙鍵位於 Δ4\Delta4、Δ7\Delta7、Δ10\Delta10、Δ13\Delta13、Δ16\Delta16、Δ19\Delta19,其末端雙鍵距離甲基端為 3 個碳,符合 omega-3 定義。此選項敘述正確。


(B) EPA,20:5(Δ5,8,11,14,17)20:5(\Delta5,8,11,14,17)

EPA(eicosapentaenoic acid,二十碳五烯酸)共有 20 個碳,最靠近甲基端的雙鍵為 Δ17\Delta17:

20−17=320-17=3

因此 EPA 是 ω\omega-3 脂肪酸。

EPA 的雙鍵位置為 Δ5\Delta5、Δ8\Delta8、Δ11\Delta11、Δ14\Delta14、Δ17\Delta17,最高 Δ\Delta 數字為 17,故屬於 omega-3。此選項敘述正確。


(C) ALA,18:3(Δ9,12,15)18:3(\Delta9,12,15)

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第 32 題

The melting points of a series of 18-carbon fatty acids are as follows: stearic acid, 69.6°C; oleic acid, 13.4°C; linoleic acid, −5°C; and linolenic acid, −11°C. Which of the above fatty acids has the largest number of cis double bonds?

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核心觀念

本題涉及脂肪酸的結構、順式雙鍵(cis double bond)數量與熔點之間的關係。

18 碳脂肪酸的常見名稱如下:

  • Stearic acid(硬脂酸,18:0):沒有雙鍵。
  • Oleic acid(油酸,18:1 cis):具有 1 個順式雙鍵。
  • Linoleic acid(亞麻油酸,18:2 cis,cis):具有 2 個順式雙鍵。
  • Linolenic acid(亞麻酸,18:3 cis,cis,cis):具有 3 個順式雙鍵。

脂肪酸表示法中的「18:2」代表:

碳數=18,雙鍵數=2\text{碳數}=18,\qquad \text{雙鍵數}=2

順式雙鍵會使脂肪酸鏈產生彎折,降低分子排列的緊密程度,因此通常具有以下趨勢:

順式雙鍵越多⟹排列越不緊密⟹熔點越低\text{順式雙鍵越多} \Longrightarrow \text{排列越不緊密} \Longrightarrow \text{熔點越低}

因此,熔點由高至低應為:

Stearic acid>Oleic acid>Linoleic acid>Linolenic acid\text{Stearic acid} > \text{Oleic acid} > \text{Linoleic acid} > \text{Linolenic acid}

解題方法

本題題幹直接給出四種 18 碳脂肪酸及其熔點。判斷順式雙鍵數量時,應優先辨認各脂肪酸的標準結構:

脂肪酸簡寫順式雙鍵數
Stearic acid18:00
Oleic acid18:11
Linoleic acid18:22
Linolenic acid18:33

所以,若題目問的是「哪一種具有最多的 cis double bonds」,正確判斷應是 Linolenic acid,具有 3 個順式雙鍵。

但是,本題官方公布答案為 A。A 所對應的 Stearic acid 具有最高熔點 69.6∘C69.6^\circ\text{C},卻沒有順式雙鍵。因此,官方答案與題幹所問的「cis double bonds 數量」並不一致。

選項分析

(A) Stearic acid

Stearic acid 是飽和脂肪酸,結構簡寫為 18:0,代表 18 個碳且沒有碳碳雙鍵:

Stearic acid=18:0\text{Stearic acid}=18:0

因此其 cis double bond 數量為:

00

它的熔點最高,原因是飽和脂肪酸鏈較直,可以緊密排列,分子間凡得瓦力較強。然而,若依照題幹原文判斷「順式雙鍵最多」,Stearic acid 並不符合。

依官方公布答案,本題選 A;但 A 的合理依據只能是「熔點最高」,不能是「cis double bonds 數量最多」。

(B) Oleic acid

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第 33 題

How does the food industry increase the melting point of lipids containing fatty acids?

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核心觀念

本題考查脂質中脂肪酸的「不飽和度」與熔點之關係,以及食品工業如何藉由化學反應改變油脂的物理性質。

脂肪酸可依碳鏈中是否含有碳碳雙鍵,分為:

  • 飽和脂肪酸(saturated fatty acid):不含 C=C\ce{C=C} 雙鍵,碳鏈較直,分子容易緊密排列,分子間作用力較強,熔點較高。
  • 不飽和脂肪酸(unsaturated fatty acid):含有一個或多個 C=C\ce{C=C} 雙鍵。天然不飽和脂肪酸多為 cis 結構,碳鏈會產生彎曲,不易緊密堆積,熔點較低,常呈液態油。

食品工業若要提高植物油等液態油脂的熔點,使其具有較硬、較穩定的質地,主要是降低脂肪酸的不飽和程度,使其更接近飽和脂肪酸。

解題方法

判斷本題的關鍵是找出能將脂肪酸碳鏈上的 C=C\ce{C=C} 雙鍵轉為單鍵的反應。

催化氫化(catalytic hydrogenation)是在金屬催化劑存在下,將氫氣加到碳碳雙鍵上:

R−CH=CH−RX′+HX2→Ni,  heatR−CHX2−CHX2−RX′\ce{R-CH=CH-R' + H2 ->[Ni,\ heat] R-CH2-CH2-R'}

常見催化劑包括鎳(Ni),也可使用鉑(Pt)或鈀(Pd)。

此反應會使:

  1. 脂肪酸的雙鍵數量減少。
  2. 不飽和脂肪酸轉變為較飽和的脂肪酸。
  3. 碳鏈彎曲程度降低,分子排列更緊密。
  4. 油脂的熔點上升,液態油可轉變為半固態或固態脂肪。

食品工業中,植物油的氫化可用於製造人造奶油(margarine)、酥油及部分烘焙用脂肪。若氫化不完全,部分 cis 雙鍵可能異構化為 trans 雙鍵;trans 脂肪酸的碳鏈較直,也能增加分子堆積與熔點,但會產生反式脂肪的營養與健康問題。

選項分析

(A) Catalytic oxidation(催化氧化)

錯誤。

脂肪酸的氧化通常發生在不飽和雙鍵附近,容易形成脂質過氧化物(lipid hydroperoxide),並進一步產生醛、酮等小分子,造成油脂酸敗(rancidity)。

脂質氧化的典型過程包括:

RH→radicalR ⋅ \ce{RH ->[radical] R.} R ⋅ +OX2→ROO ⋅ \ce{R. + O2 -> ROO.} ROO ⋅ +RH→ROOH+R ⋅ \ce{ROO. + RH -> ROOH + R.}

此反應主要影響油脂的保存性與風味,並非食品工業用來提高熔點的標準方法,因此不是本題答案。

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第 34 題

Which of the following molecules is amphipathic?

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核心觀念

本題考查 amphipathic molecule(兩親性分子) 的判定。

兩親性分子同時具有:

  • 親水性區域(hydrophilic region):通常含有帶電基團或極性官能基,可與水作用。
  • 疏水性區域(hydrophobic region):通常由長碳鏈、芳香環或大量非極性的碳氫結構組成,排斥水。

典型例子包括磷脂、膽固醇及膽鹽。此類分子能排列在水與脂質的界面,因此在細胞膜結構與脂質運輸中具有重要作用。


解題方法

逐一觀察各分子的結構,判斷是否同時存在「明顯的親水區」與「明顯的疏水區」:

  1. 若整體以非極性碳氫結構為主,屬於疏水性分子。
  2. 若整體含有多個極性或可電離基團,且缺乏疏水區,通常屬於親水性分子。
  3. 只有同時具備兩種性質,才符合 amphipathic 的定義。

本題中,膽固醇具有一個極性的羥基,以及大範圍的疏水性類固醇骨架,因此符合兩親性。


選項分析

(A) Triacylglycerols(三酸甘油酯)錯誤

Triacylglycerol 由 glycerol(甘油)與三個脂肪酸形成酯鍵:

glycerol+3 fatty acids→triacylglycerol+3HX2O\text{glycerol} + 3\text{ fatty acids} \rightarrow \text{triacylglycerol} + 3\ce{H2O}

其結構含有三條長鏈脂肪酸,主要由大量非極性的 C−C\ce{C-C} 與 C−H\ce{C-H} 鍵組成。雖然酯基中的羰基與醚氧具有些微極性,但三條疏水性脂肪酸鏈占絕大部分,因此整體為高度疏水性分子。

Triacylglycerols 主要作為能量儲存形式,儲存在脂肪滴中,不會像磷脂一樣自發形成穩定的脂質雙層,因此不是典型的 amphipathic molecule。


(B) Glycerol(甘油)錯誤

Glycerol 的結構為:

HO−CHX2−CH(OH)−CHX2−OH\ce{HO-CH2-CH(OH)-CH2-OH}

它具有三個羥基,能與水形成氫鍵,因此是高度親水性的小分子。甘油缺乏大範圍的疏水性碳氫區域,不能明顯分成親水端與疏水端。

因此,glycerol 是親水性分子,不是兩親性分子。


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第 35 題

Which of the following hormones are derived from cholesterol?

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核心觀念

本題考查「類固醇荷爾蒙(steroid hormones)的共同前驅物」。

膽固醇(cholesterol)是所有類固醇荷爾蒙的起始原料,主要包括:

  • 腎上腺皮質荷爾蒙:cortisol、aldosterone
  • 性腺荷爾蒙:progesterone、androgens、estrogens
  • 部分其他類固醇衍生物:vitamin D、bile acids

類固醇荷爾蒙的共同合成起點為:

Cholesterol→CYP11A1/P450sccPregnenolone\text{Cholesterol} \xrightarrow{\text{CYP11A1/P450scc}} \text{Pregnenolone}

其中,CYP11A1(cholesterol desmolase,膽固醇側鏈裂解酶)位於粒線體內膜,催化膽固醇側鏈裂解,形成 pregnenolone(孕烯醇酮)。Pregnenolone 再經由不同酵素反應,生成 progesterone、androgens 與 estrogens。

因此,三者皆屬於膽固醇衍生的類固醇荷爾蒙。


解題方法

判斷荷爾蒙是否由膽固醇衍生,可先確認其化學分類:

  1. 若屬於類固醇荷爾蒙,通常由 cholesterol 合成。
  2. 若屬於 peptide hormone 或 amine hormone,則不是由 cholesterol 直接合成。
  3. 本題三個選項均為 steroid hormones,因此均可追溯至 cholesterol。

主要合成路徑如下:

Cholesterol→Pregnenolone→Progesterone\text{Cholesterol} \rightarrow \text{Pregnenolone} \rightarrow \text{Progesterone}

Progesterone 或其相關中間物可進一步生成 androgens:

Pregnenolone→CYP17A117α-Hydroxypregnenolone→DHEA→Androstenedione→Testosterone\text{Pregnenolone} \xrightarrow{\text{CYP17A1}} \text{17}\alpha\text{-Hydroxypregnenolone} \rightarrow \text{DHEA} \rightarrow \text{Androstenedione} \rightarrow \text{Testosterone}

Androgens 再經由芳香化酶(aromatase,CYP19A1)生成 estrogens:

Androstenedione→CYP19A1Estrone\text{Androstenedione} \xrightarrow{\text{CYP19A1}} \text{Estrone} Testosterone→CYP19A1Estradiol\text{Testosterone} \xrightarrow{\text{CYP19A1}} \text{Estradiol}

所以三類荷爾蒙均位於 cholesterol 的類固醇生成途徑中。


選項分析

(A)Estrogens

Estrogens(雌激素)包括 estradiol、estrone 與 estriol,皆屬於類固醇荷爾蒙。

其合成通常以 androgen 作為直接前驅物:

Testosterone→aromatase/CYP19A1Estradiol\text{Testosterone} \xrightarrow{\text{aromatase/CYP19A1}} \text{Estradiol}
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第 36 題

Which eukaryotic organelles are surrounded by a double membrane?

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核心觀念

本題考查真核細胞胞器的膜結構。判斷重點是:

  • 雙層膜胞器(double-membrane organelles):具有外膜與內膜,中間為膜間腔。典型包括粒線體(mitochondria)、細胞核(nucleus)與植物細胞的葉綠體(chloroplast)。
  • 單層膜胞器(single-membrane organelles):只有一層生物膜,例如內質網、高基氏體、溶體與過氧化體。

粒線體的結構由外而內包括:

  1. 外膜(outer membrane)
  2. 膜間腔(intermembrane space)
  3. 內膜(inner membrane)
  4. 基質(matrix)

內膜向內摺疊形成嵴(cristae),其上分布電子傳遞鏈與 ATP synthase,進行氧化磷酸化。因此粒線體明確屬於雙層膜胞器。

解題方法

逐一辨認各選項胞器的膜層數:

  1. 判斷該胞器是否具有外膜與內膜。
  2. 若只有一層膜包圍胞器內容物,則不屬於雙層膜胞器。
  3. 若具有兩層膜,則為正確選項。
  4. 最後檢查「All of the above」是否成立;只要前面有任一選項錯誤,D 即不能選。

本題中,只有 mitochondria 具有雙層膜,因此選 C。

選項分析

(A) Golgi apparatus(高基氏體)—錯誤

高基氏體由許多扁平囊狀構造堆疊而成,這些囊(cisternae)各自只有單層膜。其主要功能包括:

  • 接收來自內質網的蛋白質與脂質
  • 進行蛋白質的修飾,例如醣基化
  • 分類並包裝分泌蛋白、膜蛋白與溶體相關蛋白

高基氏體雖然具有多個膜囊構造,但「多個單層膜囊」不等於「一個胞器具有雙層膜」,因此本選項錯誤。

(B) Endoplasmic reticulum(內質網)—錯誤

內質網是由連續的膜性管道與囊狀結構組成,只有單層膜。依功能可分為:

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第 37 題

Which description of photosynthesis is NOT correct?

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核心觀念

本題考查光合作用的場所、光反應與暗反應、Calvin cycle(卡爾文循環)、Krebs cycle(檸檬酸循環),以及 C3、C4 植物的生理差異。

光合作用可分為兩大階段:

  1. 光反應(light reactions)
  • 場所:葉綠體的類囊體膜(thylakoid membrane)
  • 水分解並釋放氧氣:

2 HX2O→OX2+4 HX++4 eX−\ce{2H2O -> O2 + 4H+ + 4e-}

  • 電子傳遞鏈建立質子梯度,合成 ATP。
  • NADPX+\ce{NADP+} 被還原為 NADPH\ce{NADPH}。
  1. 暗反應(dark reactions)或 Calvin-Benson cycle
  • 場所:葉綠體基質(stroma)
  • 利用光反應產生的 ATP 與 NADPH\ce{NADPH},將 COX2\ce{CO2} 固定並合成糖類。
  • 主要中間物包括 RuBP、3-phosphoglycerate(3-PGA)與 glyceraldehyde-3-phosphate(G3P)。

Krebs cycle 則是粒線體中的檸檬酸循環,主要功能是氧化 acetyl-CoA,並非光合作用的糖類合成途徑。


解題方法

判斷本題可依序檢查:

  1. 光合作用場所是否正確。
  2. 水的氧化與 NADPX+\ce{NADP+} 還原究竟發生於光反應還是暗反應。
  3. 糖類合成所屬的循環名稱。
  4. C4 植物相對於 C3 植物的生長優勢及其適用條件。

依官方答案,本題選 (C),因為光合作用中負責固定 COX2\ce{CO2} 並進行糖類生成的是 Calvin cycle,不是 Krebs cycle。


選項分析

(A) The site of photosynthesis in eukaryotes such as green plants and green algae is the chloroplast.

此項正確。

綠色植物與綠藻等真核生物的光合作用主要在葉綠體進行:

  • 光反應位於類囊體膜。
  • Calvin cycle 位於葉綠體基質。

因此,將葉綠體視為真核綠色植物與綠藻進行光合作用的主要場所是正確的。


(B) In the dark reactions, water is oxidized to produce oxygen, accompanied by the reduction of NADX+\ce{NAD+} to NADH\ce{NADH}.

依標準生物學內容,此項敘述不正確。

水的氧化與氧氣生成發生在光反應,尤其是 photosystem II(光系統 II)的 water-splitting complex:

2 HX2O→OX2+4 HX++4 eX−\ce{2H2O -> O2 + 4H+ + 4e-}

此外,光合作用中被還原的受體是 NADPX+\ce{NADP+},產物是 NADPH\ce{NADPH}:

NADPX++2 eX−+HX+→NADPH\ce{NADP+ + 2e- + H+ -> NADPH}

而非 NADX+\ce{NAD+} 被還原成 NADH\ce{NADH}。暗反應主要利用 ATP 與 NADPH\ce{NADPH},進行 COX2\ce{CO2} 固定、3-PGA 還原及 RuBP 再生。

因此,(B) 將光反應誤寫成暗反應,且將 NADPX+/NADPH\ce{NADP+}/\ce{NADPH} 誤寫成 NADX+/NADH\ce{NAD+}/\ce{NADH}。


(C) The overall reaction pathway of sugar production is cyclic and is called the Krebs cycle.

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第 38 題

Which codons are stop signals for protein synthesis?

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核心觀念

蛋白質合成(protein synthesis)在翻譯作用(translation)的終止階段,核糖體遇到終止密碼子(stop codon)時,會停止延長多肽鏈。三個終止密碼子為:

  • UAA
  • UAG
  • UGA

這三個密碼子不對應任何胺基酸,也沒有相對應的 tRNA;核糖體會由釋放因子(release factor)辨識,促使新生多肽鏈從 tRNA 上釋放,翻譯作用因而終止。

解題方法

直接辨認遺傳密碼(genetic code)中的三個終止密碼子即可。翻譯作用大致依序經過:

  1. 起始(initiation):核糖體在起始密碼子 AUG 開始翻譯。
  2. 延長(elongation):tRNA 依序將胺基酸帶入核糖體,形成胜肽鍵。
  3. 終止(termination):核糖體遇到 UAA、UAG 或 UGA,釋放因子促使多肽鏈釋放。

因此,UAA、UAG、UGA 全部都是蛋白質合成的終止訊號。

選項分析

(A) UAA:正確

UAA 是終止密碼子,傳統名稱為 ochre codon(赭色密碼子)。它不指定任何胺基酸,會被釋放因子辨識,使翻譯終止。

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第 39 題

What kind of protein secondary structure is hair α\alpha-keratin made of?

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核心觀念

本題考查蛋白質的二級結構(secondary structure),以及頭髮主要蛋白質 **α\alpha-keratin(α\alpha-角蛋白)**的結構特徵。

蛋白質二級結構是指多胜肽主鏈局部規則排列,主要由主鏈羰基與胺基之間的氫鍵穩定,常見類型包括:

  • α\alpha-helix(α\alpha-螺旋)
  • β\beta-sheet(β\beta-摺板)
  • β\beta-turn(β\beta-轉角)
  • Random coil(無規則捲曲)

頭髮、羊毛、指甲等組織的主要結構蛋白為 α\alpha-keratin,其多胜肽鏈主要採取 **α\alpha-helix(α\alpha-螺旋)**構形。多條 α\alpha-螺旋可進一步纏繞形成 coiled-coil(捲曲螺旋),再組成纖維狀結構。

解題方法

判斷本題的關鍵是直接辨識「hair α\alpha-keratin」的代表性結構:

Hair α-keratin⟶α-helix\text{Hair } \alpha\text{-keratin} \longrightarrow \alpha\text{-helix}

因此,頭髮的 α\alpha-keratin 主要由 α\alpha-螺旋二級結構構成,選擇 (A)。

需注意,頭髮具有韌性與強度,除了 α\alpha-螺旋排列外,也與角蛋白分子間的二硫鍵交聯有關。半胱胺酸側鏈可形成胱胺酸二硫鍵:

2 R−SH⟶R−S−S−R2\,\ce{R-SH} \longrightarrow \ce{R-S-S-R}

這些二硫鍵主要涉及蛋白質的三級與四級結構穩定性,不能因此將頭髮的二級結構判定為其他類型。

選項分析

(A) α\alpha-helix(α\alpha-螺旋)——正確

α\alpha-keratin 的多胜肽主鏈主要形成右手 α\alpha-螺旋。其特徵為同一條多胜肽鏈內,主鏈第 ii 個胺基酸的羰基氧,與約第 i+4i+4 個胺基酸的主鏈 N−H\ce{N-H} 形成氫鍵:

C=Oi⋯H−Ni+4\ce{C=O}_{i}\cdots\ce{H-N}_{i+4}
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第 40 題

Which description of lipid bilayers is NOT correct?

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核心觀念

本題考查磷脂質(phospholipids)的兩親性(amphipathic)與脂質雙層(lipid bilayer)的形成原理。

磷脂質通常具有:

  • 親水性頭部(hydrophilic head):常含磷酸基團,能與水作用。
  • 疏水性尾部(hydrophobic tails):通常為兩條脂肪酸鏈,會避開水。

在水溶液中,磷脂質會受到疏水作用(hydrophobic effect)影響,使疏水性脂肪酸尾部彼此聚集、埋藏於內部,親水性頭部則朝向水相,形成脂質雙層。雙層進一步封閉後,可形成脂質囊泡(liposome)。

解題方法

判斷各選項是否正確時,掌握兩個重點:

  1. 脂質雙層的形成需要水相環境,因為其主要驅動力是疏水性尾部避開水。
  2. 形成雙層的脂質必須具有親水端與疏水端,也就是兩親性分子。

逐一檢查選項後,描述「磷脂質懸浮於油中會形成脂質雙層」不符合上述原理,因此選 A。

選項分析

(A) Lipid bilayers form when phospholipids are suspended in oil.

此敘述不正確。

脂質雙層主要形成於水性環境,而不是單純的油相中。磷脂質的疏水性脂肪酸尾部會避開水,親水性頭部則與水接觸,因此在水中排列成:

親水頭部−疏水尾部∥疏水尾部−親水頭部\text{親水頭部} - \text{疏水尾部} \parallel \text{疏水尾部} - \text{親水頭部}

若磷脂質存在於油中,油相本身是非極性環境,無法產生「疏水尾部避水、親水頭部朝水」的排列驅動力,因此不會形成典型的脂質雙層。

在油水界面,磷脂質可形成單層(monolayer),但題目敘述為懸浮於油中並形成雙層,故為錯誤描述。依亞洲大學官方答案,本題選 A。

(B) Lipids that form bilayers are amphipathic molecules.

此敘述正確。

能形成脂質雙層的脂質具有兩種性質:

  • 一端親水,可與水分子及其他極性物質作用。
  • 一端疏水,會避開水並與其他疏水性尾部聚集。
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第 41 題

Which of the following diseases is associated with protein misfolding?

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核心觀念

本題考查「蛋白質錯誤摺疊(protein misfolding)」與神經退化性疾病、普利昂疾病(prion disease)的關聯。

蛋白質必須摺疊成正確的三維構形,才能執行正常功能。當胺基酸序列、細胞環境或摺疊輔助系統異常時,蛋白質可能形成錯誤構形,並進一步:

  • 暴露原本埋藏的疏水性區域。
  • 彼此聚集形成不溶性蛋白質聚合物。
  • 形成 amyloid fibrils(類澱粉纖維)或其他蛋白質沉積。
  • 干擾神經細胞功能,造成細胞死亡。

細胞通常透過 molecular chaperones(分子伴護蛋白)、ubiquitin–proteasome system(泛素–蛋白酶體系統)及 autophagy(自噬作用)處理異常蛋白質。當錯誤摺疊蛋白質生成量超過清除能力,就可能導致疾病。

本題的三種疾病都具有代表性的錯誤摺疊蛋白質,因此正確選項為「以上皆是」。

解題方法

判斷此題的切入點,是辨認各疾病是否與特定異常構形蛋白質的聚集或轉換有關:

疾病主要相關蛋白質典型異常形式
Alzheimer’s disease(阿茲海默症)amyloid-β\beta(Aβ\mathrm{A\beta})、tau類澱粉斑塊、神經纖維糾結
Parkinson’s disease(帕金森氏症)α\alpha-synuclein(α\alpha-突觸核蛋白)Lewy bodies(路易氏體)
Mad cow disease(狂牛症)prion protein(普利昂蛋白,PrP)異常 PrP 聚集與神經毒性

三個選項均符合 protein misfolding disease 的範疇,因此選擇涵蓋全部選項的 (D)。

選項分析

(A) Alzheimer’s disease:正確

阿茲海默症與兩類重要的異常蛋白質有關:

  1. Amyloid-β\beta(Aβ\mathrm{A\beta})

Aβ\mathrm{A\beta} 由 amyloid precursor protein(APP,類澱粉前驅蛋白)經由 β\beta-secretase 與 γ\gamma-secretase 切割產生。特別是 Aβ42\mathrm{A\beta_{42}} 容易聚集,形成 extracellular amyloid plaques(細胞外類澱粉斑塊)。

  1. Tau protein(tau 蛋白)

Tau 正常功能是穩定 axonal microtubules(軸突微管)。在疾病狀態下,tau 過度磷酸化,導致其與微管分離並錯誤聚集,形成 intracellular neurofibrillary tangles(細胞內神經纖維糾結)。

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第 42 題

Which of the following lipoproteins is primarily responsible for transporting cholesterol from surrounding tissues to the liver or steroidogenic organs?

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核心觀念

本題考查血漿脂蛋白的主要功能,尤其是「逆向膽固醇運輸」(reverse cholesterol transport)。

周邊組織細胞中的游離膽固醇可經由下列途徑回收到肝臟:

  1. 膽固醇由細胞膜移出,轉交給初生 HDL(nascent HDL)。
  2. 主要載脂蛋白 ApoA-I 與細胞膜上的 ABCA1、ABCG1 促進膽固醇外排。
  3. HDL 上的 LCAT(lecithin-cholesterol acyltransferase,卵磷脂-膽固醇醯基轉移酶) 將游離膽固醇酯化:
Cholesterol+Phosphatidylcholine→LCATCholesteryl ester+Lysophosphatidylcholine\text{Cholesterol}+\text{Phosphatidylcholine} \xrightarrow{\text{LCAT}} \text{Cholesteryl ester}+\text{Lysophosphatidylcholine}
  1. 膽固醇酯被 HDL 運送至肝臟,主要透過肝細胞表面的 SR-BI(scavenger receptor class B type I) 進行選擇性攝取。
  2. 膽固醇也可由 HDL 運送至腎上腺、睪丸、卵巢等類固醇生成器官,供類固醇荷爾蒙合成使用。

因此,負責將周邊組織膽固醇送回肝臟或類固醇生成器官的脂蛋白是 HDL。


解題方法

先辨認題幹中的方向:

transporting cholesterol from surrounding tissues to the liver or steroidogenic organs

關鍵是「由周邊組織送往肝臟」。這是逆向膽固醇運輸的定義,對應 HDL 的功能。

脂蛋白功能可用下列方向快速整理:

肝臟→周邊組織:VLDL、LDL\text{肝臟} \rightarrow \text{周邊組織:VLDL、LDL} 周邊組織→肝臟:HDL\text{周邊組織} \rightarrow \text{肝臟:HDL}

其中,LDL 雖然主要攜帶膽固醇,但方向是將膽固醇由肝臟及其他組織送至周邊細胞;題目問的是回收周邊組織膽固醇,因此不能選 LDL。


選項分析

(A) VLDL(極低密度脂蛋白)

VLDL 由肝臟合成,主要功能是將肝臟製造的內源性三酸甘油酯運送至周邊組織。

其代謝過程如下:

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第 43 題

Which description of fatty acid oxidation is NOT correct?

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核心觀念

本題考查脂肪酸氧化(fatty acid oxidation),尤其是:

  1. 脂肪酸 β-氧化(β\beta-oxidation)的主要場所。
  2. 不同組織利用脂肪酸作為能量來源的能力。
  3. 脂肪酸氧化缺陷所造成的代謝疾病。
  4. 脂肪酸氧化的代謝物與荷爾蒙調控。

脂肪酸通常先在粒線體外膜附近活化為脂醯輔酶 A(fatty acyl-CoA),長鏈脂肪酸需經由肉鹼穿梭系統(carnitine shuttle)進入粒線體基質,接著進行 β-氧化。

每一輪 β-氧化包括四個主要反應:

  1. 脂醯-CoA 去氫化:由 acyl-CoA dehydrogenase 催化,產生 FADHX2\ce{FADH2}。
  2. 烯醯-CoA 水合:由 enoyl-CoA hydratase 催化。
  3. β-羥基脂醯-CoA 去氫化:由 β\beta-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase 催化,產生 NADH\ce{NADH}。
  4. 硫解作用:由 thiolase 催化,釋放 acetyl-CoA,並使脂醯-CoA 縮短兩個碳。

產生的 acetyl-CoA 進入檸檬酸循環,NADH\ce{NADH} 與 FADHX2\ce{FADH2} 則進入電子傳遞鏈產生 ATP。


解題方法

判斷本題各敘述是否正確時,應分成兩個層次:

  • 先判斷脂肪酸氧化的一般生化特性。
  • 再檢查敘述中所列舉的特定組織是否真的能進行脂肪酸氧化。

本題的陷阱在於,B 選項前半段「脂肪酸氧化是許多組織的重要能量來源」大致正確,但後半段把**中樞神經系統(CNS)與循環紅血球(circulating red blood cells)**列入,導致整個敘述不正確。

其中循環紅血球沒有粒線體,無法進行粒線體 β-氧化;中樞神經系統在正常情況下主要使用葡萄糖,脂肪酸並非其主要直接能量來源。


選項分析

(A) Fatty acid oxidation occurs in mitochondria.

此敘述正確。

脂肪酸 β-氧化主要發生於粒線體基質(mitochondrial matrix)。長鏈脂肪酸不能直接以脂醯-CoA 的形式穿過粒線體內膜,必須先透過肉鹼穿梭系統:

  1. CPT I(carnitine palmitoyltransferase I)將脂醯基轉移至肉鹼,形成 acyl-carnitine。
  2. Translocase 將 acyl-carnitine 運入粒線體基質。
  3. CPT II 將脂醯基轉回 CoA,重新形成脂醯-CoA。
  4. 脂醯-CoA 接著進行 β-氧化。

此外,極長鏈脂肪酸也可先在過氧化體(peroxisome)進行部分氧化,但考試所指的主要脂肪酸氧化場所仍是粒線體。因此 A 正確。


(B) Fatty acid oxidation is the primary source of energy for many tissues, including the central nervous system and circulating red blood cells.

此敘述不正確,為本題答案。

脂肪酸氧化確實是許多組織的重要能量來源,例如:

  • 心肌
  • 骨骼肌
  • 肝臟
  • 腎皮質

但是,選項所列的兩個組織不符合:

1. 循環紅血球不能進行脂肪酸氧化

成熟紅血球在成熟過程中會失去細胞核與粒線體,因此沒有進行 β-氧化與氧化磷酸化所需的粒線體。

紅血球主要依靠無氧糖解作用(anaerobic glycolysis)產生 ATP:

Glucose→Pyruvate→Lactate\text{Glucose} \rightarrow \text{Pyruvate} \rightarrow \text{Lactate}

因此,循環紅血球的主要能量來源是葡萄糖,而不是脂肪酸。

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第 44 題

Which description of the biological membrane is NOT correct?

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核心觀念

本題考查生物膜(biological membrane)的組成與「流動鑲嵌模型」(fluid mosaic model)。

生物膜主要由下列成分構成:

  • 脂質(lipids):磷脂質(phospholipids)、醣鞘脂(glycosphingolipids)、膽固醇(cholesterol)。
  • 蛋白質(proteins):膜蛋白可為醣蛋白(glycoproteins),也可透過脂質與膜結合,形成脂質連結蛋白(lipid-linked proteins)。
  • 醣類(carbohydrates):通常以醣蛋白或醣脂形式分布於膜的非細胞質側。

膜中的脂質與蛋白質主要透過非共價作用力維持組織,包括疏水作用、凡得瓦力、氫鍵及靜電作用等,因此膜具有一定的流動性。


解題方法

判斷每個選項是否符合生物膜的基本特徵:

  1. 檢查膜的脂質成分。
  2. 檢查膜蛋白的類型。
  3. 判斷膜成分之間的結合方式是共價鍵或非共價作用力。
  4. 判斷膜是否具有流動性。

其中,若選項宣稱膜中脂質與蛋白質以共價鍵彼此固定,便違反流動鑲嵌模型的基本概念,應判定為不正確。


選項分析

(A) Cell membrane lipid constituents include phospholipids, glycosphingolipids, and cholesterol.

此敘述正確。

細胞膜的脂質成分包括:

  • 磷脂質(phospholipids):構成脂質雙層的主要骨架,具有親水性頭部與疏水性尾部。
  • 醣鞘脂(glycosphingolipids):由鞘脂骨架連接醣類所形成,常位於細胞膜外側,參與細胞辨識與細胞間交互作用。
  • 膽固醇(cholesterol):嵌入磷脂質雙層,可調節膜的流動性與通透性。

因此,這些都是常見的細胞膜脂質成分。


(B) Cell membrane protein constituents include glycoproteins and lipid-linked proteins.

此敘述正確。

膜蛋白可依附著方式分為多種類型:

  • 醣蛋白(glycoproteins):蛋白質上以共價方式連接寡醣鏈,常參與細胞辨識、受體作用及免疫反應。
  • 脂質連結蛋白(lipid-linked proteins):蛋白質透過共價連接的脂質基團固定於膜上。
  • 整合膜蛋白(integral membrane proteins):部分或全部嵌入脂質雙層。
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第 45 題

Which of the following does NOT cross a cellular membrane without transporters or channels?

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核心觀念

本題考查物質通過細胞膜的方式,以及磷脂雙層對帶電離子的通透性。

細胞膜主要由磷脂雙層構成,中央為疏水性的脂肪酸尾部。物質能否直接穿過細胞膜,主要取決於其:

  • 脂溶性
  • 分子大小
  • 是否帶電
  • 是否具有極性

帶電離子具有高度親水性,且穿越疏水性膜核心時必須付出很高的能量代價,因此不能以簡單擴散方式直接通過細胞膜。它們必須依靠膜蛋白,例如:

  • 離子通道(ion channel)
  • 載體蛋白(transporter)
  • 幫浦(pump)
  • 離子交換器(exchanger)

才能跨膜運輸。

解題方法

看到題幹中的關鍵字「without transporters or channels」,應立即判斷題目是在問:

哪些物質不能在沒有膜蛋白協助的情況下,直接穿過磷脂雙層?

NaX+\ce{Na+}、KX+\ce{K+} 與 CaX2+\ce{Ca^2+} 都是帶正電的無機離子,無法直接穿越磷脂雙層的疏水核心。因此三者皆符合「does NOT cross a cellular membrane without transporters or channels」。

由於 A、B、C 所列的三種離子全部符合題幹描述,應選擇統括三者的選項 D。

選項分析

(A) NaX+\ce{Na+}

NaX+\ce{Na+} 是鈉離子,帶有一個正電荷,具有高度親水性,不能直接溶入磷脂雙層的疏水核心。

細胞通常透過下列蛋白質運輸 NaX+\ce{Na+}:

  • 電壓閘控鈉離子通道(voltage-gated NaX+\ce{Na+} channel)
  • NaX+/KX+\ce{Na+}/\ce{K+}-ATPase
  • 鈉離子—葡萄糖同向運輸器(NaX+\ce{Na+}-glucose cotransporter)
  • 鈉離子—鈣離子交換器(NaX+/CaX2+\ce{Na+}/\ce{Ca^2+} exchanger)

因此,NaX+\ce{Na+} 在沒有通道或載體時不能跨越細胞膜。A 所述內容正確,但本題有更完整的統括選項,因此不是最佳答案。

(B) KX+\ce{K+}

KX+\ce{K+} 是鉀離子,同樣帶有一個正電荷,無法直接穿過磷脂雙層。

KX+\ce{K+} 可經由:

  • 鉀離子通道(KX+\ce{K+} channel)
  • NaX+/KX+\ce{Na+}/\ce{K+}-ATPase
  • 鉀離子輸送器(KX+\ce{K+} transporter)

進行跨膜運輸。

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第 46 題

Which of the following is a second messenger molecule that can activate protein kinase A (PKA) in eukaryotes?

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核心觀念

本題考查真核細胞中的第二訊使(second messenger)及其所活化的蛋白激酶。

第二訊使是由細胞外訊號刺激後,在細胞內快速生成或濃度改變的小分子,可將細胞膜上的受體訊號傳遞至細胞內。與本題相關的主要分子包括:

  • cAMP\mathrm{cAMP}:活化蛋白激酶 A(protein kinase A, PKA)
  • cGMP\mathrm{cGMP}:主要活化蛋白激酶 G(protein kinase G, PKG)
  • IP3\mathrm{IP_3}:促進內質網釋放 CaX2+\ce{Ca^{2+}}
  • DAG\mathrm{DAG}:活化蛋白激酶 C(protein kinase C, PKC)

解題方法

直接利用「第二訊使—蛋白激酶」的配對關係判斷。

典型的 cAMP\mathrm{cAMP} 訊息傳遞路徑如下:

配體→Gs蛋白偶聯受體→Gs→adenylyl cyclase\text{配體} \rightarrow \text{Gs蛋白偶聯受體} \rightarrow \text{Gs} \rightarrow \text{adenylyl cyclase}

腺苷酸環化酶(adenylyl cyclase)催化 ATP 形成 cyclic AMP:

ATP→adenylyl cyclasec AMP+PPXi\ce{ATP ->[adenylyl\ cyclase] cAMP + PP_i}

生成的 cAMP\mathrm{cAMP} 會結合 PKA 的調節次單元(regulatory subunits),使催化次單元(catalytic subunits)釋放並活化。活化的 PKA 接著磷酸化特定蛋白質,改變其活性,產生細胞反應。

因此,能夠活化 PKA 的第二訊使是 cAMP\mathrm{cAMP}。

選項分析

(A) Cyclic AMP(環磷酸腺苷,cAMP\mathrm{cAMP})—正確

cAMP\mathrm{cAMP} 是典型的第二訊使,也是 PKA 的直接活化分子。

其生成、作用與降解流程為:

ATP→adenylyl cyclasec AMP\ce{ATP ->[adenylyl\ cyclase] cAMP} cAMP+PKA→PKA催化次單元活化\mathrm{cAMP + PKA} \rightarrow \text{PKA催化次單元活化}

之後,磷酸二酯酶(phosphodiesterase, PDE)可將 cAMP\mathrm{cAMP} 水解為 5′-AMP,使訊號終止:

c AMP→PDE5X′−AMP\ce{cAMP ->[PDE] 5'-AMP}

所以本選項符合題目所問,為官方答案。

(B) Cyclic GMP(環磷酸鳥苷,cGMP\mathrm{cGMP})—錯誤

cGMP\mathrm{cGMP} 也是第二訊使,但其典型作用標的是蛋白激酶 G(PKG),不是 PKA。

cGMP\mathrm{cGMP} 可由鳥苷酸環化酶(guanylyl cyclase)催化 GTP 生成:

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第 47 題

Which of the following metabolisms can NOT be regulated by protein kinase A (PKA)?

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核心觀念

本題考查 cAMP–protein kinase A(PKA)訊息傳遞路徑對不同組織代謝的調控,尤其是胰高血糖素(glucagon)與腎上腺素(epinephrine)如何透過 PKA 調節脂肪分解、肝醣代謝與糖質新生。

典型流程如下:

Hormone→G protein→adenylate cyclase→↑cAMP→PKA activation\text{Hormone} \rightarrow \text{G protein} \rightarrow \text{adenylate cyclase} \rightarrow \uparrow \text{cAMP} \rightarrow \text{PKA activation}

活化的 PKA 會藉由磷酸化下游酵素,快速改變代謝方向。整體原則為:

  • 增加血糖供應:促進肝臟肝醣分解與糖質新生。
  • 動員脂肪:促進脂肪細胞 lipolysis(脂解)。
  • 抑制葡萄糖儲存:抑制肝醣合成。

解題方法

判斷每個選項是否符合 PKA 的典型代謝效應即可。

PKA 的重要標的包括:

  1. **Hormone-sensitive lipase(HSL,荷爾蒙敏感性脂肪酶)**與 perilipin
    促進脂肪細胞內 triacylglycerol(TAG,三酸甘油酯)分解。

  2. Phosphorylase kinase(磷酸化酶激酶)
    被 PKA 活化後,進一步活化 glycogen phosphorylase(肝醣磷酸化酶),促進肝醣分解。

  3. Glycogen synthase(肝醣合成酶)
    被 PKA 磷酸化後活性降低,因此抑制肝醣合成。

  4. Liver PFK-2/FBPase-2(肝臟雙功能磷酸果糖激酶-2/果糖-2,6-二磷酸酶)
    PKA 磷酸化此酵素,使 fructose-2,6-bisphosphate(F-2,6-BP\ce{F-2,6-BP})濃度下降,抑制 glycolysis(糖解作用),並解除對 fructose-1,6-bisphosphatase-1(FBPase-1)的抑制,促進 gluconeogenesis(糖質新生)。

因此,PKA 主要促進「動員能量與提高血糖」的代謝方向,而非促進肝醣儲存。

選項分析

(A) Enhance lipolysis in adipocytes

正確,PKA 可促進脂肪細胞脂解。

在脂肪細胞中,epinephrine 或 glucagon-like signaling 可提高 cAMP,活化 PKA。PKA 會磷酸化:

  • perilipin,使脂肪滴表面結構改變,增加脂解酵素接觸脂肪滴的機會;
  • HSL,使 HSL 活性增加;
  • 相關脂解調控蛋白,促進 TAG 分解。

脂解反應可概括為:

Triacylglycerol→Diacylglycerol→Monoacylglycerol→Glycerol+fatty acids\text{Triacylglycerol} \rightarrow \text{Diacylglycerol} \rightarrow \text{Monoacylglycerol} \rightarrow \text{Glycerol}+\text{fatty acids}

其中 HSL 主要參與 diacylglycerol(DAG)轉換為 monoacylglycerol(MAG)的步驟。釋出的 fatty acids(脂肪酸)可供其他組織進行 β\beta-oxidation(β\beta-氧化),glycerol(甘油)則可進入肝臟作為糖質新生原料。

所以 PKA 能 enhance lipolysis。

(B) Enhance glycogenesis in skeletal muscle

錯誤,本選項為本題答案。

Glycogenesis(肝醣合成)主要由 glycogen synthase 催化:

UDP-glucose→glycogen\text{UDP-glucose} \rightarrow \text{glycogen}

PKA 活化後會磷酸化 glycogen synthase,使其由活性較高的去磷酸化型轉變為活性較低的磷酸化型,結果是:

PKA activation→glycogen synthase phosphorylation→↓glycogenesis\text{PKA activation} \rightarrow \text{glycogen synthase phosphorylation} \rightarrow \downarrow \text{glycogenesis}

在骨骼肌中,epinephrine–cAMP–PKA 路徑的主要生理作用是供應肌肉即時能量,因此會促進 glycogenolysis(肝醣分解),而非促進 glycogenesis。

PKA 也會活化 phosphorylase kinase:

PKA→phosphorylase kinase→glycogen phosphorylase→↑glycogenolysis\text{PKA} \rightarrow \text{phosphorylase kinase} \rightarrow \text{glycogen phosphorylase} \rightarrow \uparrow \text{glycogenolysis}
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第 48 題

Which ions are required for the glucose symporter transporter in the intestinal epithelium?

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核心觀念

本題考查小腸上皮細胞吸收葡萄糖的 鈉-葡萄糖同向運輸體(sodium-glucose linked transporter, SGLT)。

在小腸上皮細胞的頂端膜(apical membrane)上,主要由 SGLT1 將葡萄糖與 NaX+\ce{Na+} 一起運入細胞。此運輸方式屬於:

  • 次級主動運輸(secondary active transport)
  • 葡萄糖與 NaX+\ce{Na+} 朝同一方向運輸,因此稱為 symporter(同向運輸體)
  • 通常每次運輸約伴隨 22 個 NaX+\ce{Na+} 與 11 個葡萄糖進入細胞

SGLT1 本身不直接水解 ATP,而是利用 NaX+\ce{Na+} 電化學梯度所提供的能量。此梯度由基底外側膜上的 鈉鉀幫浦(Na⁺/K⁺-ATPase) 維持:

ATP+3 NaXcell++2 KXoutside+→ADP+Pi+3 NaXoutside++2 KXcell+\ce{ATP + 3 Na+_{cell} + 2 K+_{outside} -> ADP + Pi + 3 Na+_{outside} + 2 K+_{cell}}

細胞內低濃度的 NaX+\ce{Na+} 促使 NaX+\ce{Na+} 由腸腔進入細胞,並帶動葡萄糖逆著其濃度梯度進入腸上皮細胞。葡萄糖之後經由基底外側膜的 GLUT2(glucose transporter 2) 進入血液。

解題方法

看到題幹中的關鍵字:

  • intestinal epithelium:腸道上皮
  • glucose symporter:葡萄糖同向運輸體

即可聯想到小腸刷狀緣的 SGLT1。SGLT1 的必要共運輸離子是 NaX+\ce{Na+},因此直接選擇 NaX+\ce{Na+}。

整體吸收路徑可整理為:

腸腔葡萄糖→NaX+SGLT1腸上皮細胞→GLUT2血液\text{腸腔葡萄糖} \xrightarrow[\ce{Na+}]{\text{SGLT1}} \text{腸上皮細胞} \xrightarrow{\text{GLUT2}} \text{血液}

其中 NaX+\ce{Na+} 梯度由基底外側膜的 Na⁺/K⁺-ATPase 維持,這正是 SGLT1 能持續吸收葡萄糖的能量基礎。

選項分析

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第 49 題

How many fatty acid molecules does a phosphatidylcholine (PC) of the plasma membrane have?

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核心觀念

本題考查磷脂醯膽鹼(phosphatidylcholine, PC)的基本結構,以及甘油磷脂(glycerophospholipid)的脂肪酸數目。

PC 是細胞膜常見的甘油磷脂,基本結構包含:

  • 一個甘油(glycerol)骨架
  • 兩條脂肪酸(fatty acid)鏈
  • 一個磷酸基(phosphate)
  • 一個膽鹼(choline)

其結構可表示為:

Glycerol+2 fatty acids+phosphate+choline\text{Glycerol} + 2\text{ fatty acids} + \text{phosphate} + \text{choline}

在典型 PC 中,甘油的 snsn-1 與 snsn-2 位置分別以酯鍵連接兩條脂肪酸;snsn-3 位置則連接磷酸膽鹼(phosphocholine)基團。

因此:

一個 PC 分子=2 個脂肪酸分子\text{一個 PC 分子} = 2\text{ 個脂肪酸分子}

解題方法

判斷此題可直接拆解 PC 的名稱與結構:

  1. 「phosphatidyl」表示甘油骨架上帶有兩條脂肪酸鏈,形成 phosphatidic acid 的核心結構。
  2. 「choline」表示磷酸基上再連接膽鹼。
  3. 膽鹼與磷酸屬於極性頭部(polar head group),不是脂肪酸。

PC 的簡化結構如下:

Fatty acid1−glycerol−Fatty acid2\text{Fatty acid}_1-\text{glycerol}-\text{Fatty acid}_2 ∣\hspace{3.4cm}|
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第 50 題

Which of the following molecules does NOT affect membrane fluidity?

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核心觀念

本題考的是「細胞膜組成與膜流動性(membrane fluidity)」。

細胞膜主要由磷脂、膽固醇及膜醣脂質構成。膜流動性是指膜內脂質與膜蛋白在脂雙層中的側向移動能力,主要受下列因素影響:

  • 脂肪酸鏈長度:鏈越短,分子間作用力越弱,流動性越高。
  • 脂肪酸不飽和程度:雙鍵越多,脂肪酸鏈越彎曲,越不易緊密排列,流動性越高。
  • 膽固醇含量:可依溫度調節膜流動性。
  • 膜脂質種類與排列:不同脂質會改變膜的緊密程度、厚度與局部微區結構。

解題方法

判斷各選項是否為細胞膜的主要組成成分即可。

若某分子本身是膜脂質,能嵌入脂雙層並改變脂質排列,便會影響膜流動性。若是主要存在於細胞內作為能量儲存、通常不構成膜脂雙層的脂質,則依考試標準判定為不直接影響膜流動性。

其中,三酸甘油酯(triglyceride)是由甘油與三條脂肪酸形成的中性脂質,主要儲存在脂肪細胞的脂滴中,不是細胞膜脂雙層的正常主要成分。因此官方答案為(B)。

選項分析

(A)Sphingomyelin(鞘磷脂)—錯誤選項

Sphingomyelin 是鞘脂(sphingolipid)的一種,結構骨架為 sphingosine(鞘氨醇),並含有脂肪酸及 phosphocholine(磷酸膽鹼)等部分。

它是細胞膜的重要組成成分,尤其常見於:

  • 動物細胞膜的外層
  • 神經細胞髓鞘
  • 膜上的脂筏(lipid rafts)

Sphingomyelin 可與 cholesterol 形成較有秩序的膜脂質區域,改變局部膜的緊密度與流動性。因此會影響膜流動性,不能選。

(B)Triglyceride(三酸甘油酯)—正確答案

Triglyceride 的基本反應可表示為:

甘油+3脂肪酸→三酸甘油酯+3HX2O\text{甘油} + 3\text{脂肪酸} \rightarrow \text{三酸甘油酯} + 3\ce{H2O}
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第 51 題

Which description of receptor tyrosine kinases (RTKs) is NOT correct?

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核心觀念

本題考查受體型酪胺酸激酶(receptor tyrosine kinases, RTKs)的結構與訊息傳遞機轉。

RTK 是一類位於細胞膜上的受體,典型結構包括:

  1. 細胞外的配體結合區(ligand-binding domain)
  2. 單次穿膜區段(single-pass transmembrane domain)
  3. 細胞質側具有酪胺酸激酶活性的酵素區(cytoplasmic tyrosine kinase domain)

配體與 RTK 結合後,常促使兩個受體彼此接近或形成二聚體,接著發生酪胺酸殘基的交互自體磷酸化(trans-autophosphorylation)。磷酸化的受體可作為訊息傳遞蛋白的停泊平台,啟動 Ras–MAPK、PI3K–Akt 等下游路徑。

GPCR(G protein-coupled receptors)則是七次穿膜受體,主要透過異源三聚體 G 蛋白進行訊息傳遞,機轉與 RTK 有本質差異。


解題方法

判斷本題的關鍵,是比較 RTK 與 GPCR 的三個面向:

  • 受體結構
  • 催化活性的位置
  • 細胞內訊息傳遞方式

RTK 的特色是「受體本身具有蛋白激酶活性」,其細胞質側可直接催化 ATP 將磷酸基轉移至蛋白質的酪胺酸殘基:

Protein-Tyr+ATP→Protein-Tyr-P+ADP\text{Protein-Tyr}+\text{ATP} \rightarrow \text{Protein-Tyr-P}+\text{ADP}

GPCR 本身沒有蛋白激酶活性,而是先活化 G 蛋白,使 GDP\ce{GDP} 置換為 GTP\ce{GTP},再調控腺苷酸環化酶(adenylyl cyclase)、磷脂酶 C(phospholipase C)等效應器。

因此,將 RTK 描述成透過與 GPCR 類似的機制傳遞訊號,並不正確。


選項分析

(A) RTKs are a family of plasma membrane receptors with protein kinase activity.

此敘述正確。

RTK 是位於細胞膜上的受體家族,且受體本身含有蛋白激酶活性,主要是酪胺酸激酶活性。配體結合後,受體通常二聚化並彼此磷酸化,進一步啟動細胞內訊息傳遞。

因此,(A) 不是錯誤選項。


(B) RTKs transduce extracellular signals through a mechanism similar to G protein-coupled receptors (GPCRs).

此敘述錯誤,為本題答案。

RTK 與 GPCR 雖然都能將細胞外配體訊號轉換為細胞內反應,但兩者的直接傳遞機制不同:

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第 52 題

Which description of G protein-coupled receptors (GPCRs) is NOT correct?

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核心觀念

本題考查 G protein-coupled receptors, GPCRs(G 蛋白偶聯受體) 的結構、作用機轉、分布與疾病關聯。

GPCR 的共同特徵包括:

  1. 具有 7 條穿越細胞膜的 α-螺旋(seven transmembrane α-helices)。
  2. 受體活化後,透過 異三聚體 G 蛋白(heterotrimeric G protein) 傳遞訊息。
  3. G 蛋白由 α\alpha、β\beta、γ\gamma 三個次單元組成。
  4. 參與嗅覺、味覺、視覺、荷爾蒙作用、神經傳導與免疫反應,也與多種疾病及藥物標的有關。

因此,本題應找出將 GPCR 結構或功能描述錯誤的選項。

解題方法

判斷 GPCR 題目時,先抓住最具代表性的結構記憶點:

GPCR = 7 次跨膜 α-螺旋受體

GPCR 的跨膜區不是 β-sheet(β-摺板),而是由 7 條疏水性的 α-helices(α-螺旋)構成。只要選項將 GPCR 說成具有「seven transmembrane beta-sheet domains」,即與其基本結構矛盾,故選 A。

GPCR 的典型訊息傳遞機轉如下:

Ligand binding→GPCR conformational change→GDP-GTP exchange on Gα\text{Ligand binding} \rightarrow \text{GPCR conformational change} \rightarrow \text{GDP-GTP exchange on } G\alpha

活化後的 GαG\alpha 與 GβγG\beta\gamma 會調控下游效應器,例如:

  • Adenylyl cyclase(腺苷酸環化酶)
  • Phospholipase C-β, PLCβ\beta(磷脂酶 C-β)
  • 離子通道

常見路徑包括:

Adenylyl cyclase→cAMP→Protein kinase A, PKA\text{Adenylyl cyclase} \rightarrow \text{cAMP} \rightarrow \text{Protein kinase A, PKA}

以及:

PLCβ→PIP2→IP3+DAG\text{PLC}\beta \rightarrow \text{PIP}_2 \rightarrow \text{IP}_3 + \text{DAG}

其中,IP3_3 促進內質網釋放 CaX2+\ce{Ca^{2+}},DAG 則與 CaX2+\ce{Ca^{2+}} 共同活化 Protein kinase C(PKC)。

選項分析

(A) G protein-coupled receptors (GPCRs) have seven transmembrane beta-sheet domains.

錯誤。

GPCR 的確具有七個穿膜區域,但這些區域是 七條跨膜 α-螺旋,不是 β-sheet。

GPCR 的七條跨膜 α-螺旋形成受體的核心結構,配體與受體結合後,會引發跨膜螺旋重新排列,使細胞內側構形改變,進而活化 G 蛋白。

因此,選項錯誤的關鍵在於:

  • 正確:seven transmembrane α-helices
  • 錯誤:seven transmembrane beta-sheet domains
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第 53 題

Which receptor of signal-transduction pathways is involved in glucose uptake regulation?

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核心觀念

本題考查「訊息傳遞受體」與「葡萄糖攝取調控」的關係。哺乳動物在骨骼肌與脂肪細胞中,胰島素(insulin)透過胰島素受體(insulin receptor)促進葡萄糖轉運蛋白 GLUT4 移動至細胞膜,使細胞攝取更多葡萄糖。

因此,與血糖下降及周邊組織葡萄糖攝取增加最直接相關的受體是 Insulin receptor。


解題方法

判斷本題可從「哪一種訊息傳遞路徑直接促進 GLUT4 膜轉位」切入。

胰島素作用於骨骼肌細胞與脂肪細胞時,主要路徑如下:

Insulin→Insulin receptor→IRS→PI3K→PIP3→AKT→AS160/TBC1D4→GLUT4 translocation\text{Insulin} \rightarrow \text{Insulin receptor} \rightarrow \text{IRS} \rightarrow \text{PI3K} \rightarrow \text{PIP}_3 \rightarrow \text{AKT} \rightarrow \text{AS160/TBC1D4} \rightarrow \text{GLUT4 translocation}

機轉重點如下:

  1. 胰島素與細胞膜上的胰島素受體結合。
  2. 胰島素受體具有受體型酪胺酸激酶(receptor tyrosine kinase, RTK)活性,受體彼此磷酸化。
  3. 受體磷酸化胰島素受體受質(insulin receptor substrate, IRS)。
  4. IRS 活化磷脂醯肌醇-3-激酶(phosphoinositide 3-kinase, PI3K)。
  5. PI3K 促使膜上的 PIPX2\ce{PIP2} 轉變為 PIPX3\ce{PIP3}。
  6. PIPX3\ce{PIP3} 促進 AKT,也稱 protein kinase B(蛋白激酶 B)活化。
  7. AKT 抑制 AS160/TBC1D4 對 Rab 蛋白的抑制作用,使含有 GLUT4 的囊泡移動並融合至細胞膜。
  8. 細胞膜上的 GLUT4 增加,葡萄糖進入細胞的速率上升。

此題問的是「哪一種 receptor involved in glucose uptake regulation」,最符合上述典型路徑者即為胰島素受體。


選項分析

(A) Sialic acid receptor

Sialic acid(唾液酸)是細胞表面醣蛋白與醣脂質常見的末端糖類,參與細胞辨識、病原體附著及免疫相關作用。

「Sialic acid receptor」並不是調控骨骼肌或脂肪細胞 GLUT4 轉位的經典主要受體,也不負責啟動胰島素的 PI3K–AKT 葡萄糖攝取路徑,因此本選項錯誤。

(B) Insulin receptor

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第 54 題

Which of the following is NOT a product of the oxidative, nonreversible phase of the pentose phosphate pathway (PPP)?

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核心觀念

本題考查 pentose phosphate pathway(磷酸戊糖途徑,PPP)氧化、不可逆階段的產物,以及其與糖解作用產物的區別。

PPP 可分為:

  1. 氧化、不可逆階段(oxidative, irreversible phase)
  • 產生 NADPH\ce{NADPH}
  • 釋放 COX2\ce{CO2}
  • 形成五碳糖磷酸,主要為 ribulose-5-phosphate
  1. 非氧化、可逆階段(nonoxidative, reversible phase)
  • 將 ribulose-5-phosphate 轉換為 ribose-5-phosphate、xylulose-5-phosphate 等
  • 透過 transketolase 與 transaldolase 連接至糖解作用中間物

PPP 的重要功能是提供:

  • NADPH\ce{NADPH}:用於脂肪酸合成、膽固醇合成及維持 glutathione 還原狀態
  • Ribose-5-phosphate:用於核苷酸與核酸合成

解題方法

先逐步列出 PPP 氧化階段的反應。

第一步:Glucose-6-phosphate dehydrogenase

Glucose-6-phosphate+NADPX+→6-phosphoglucono−δ-lactone+NADPH+HX+\ce{Glucose-6-phosphate + NADP+ -> 6-phosphoglucono-\delta-lactone + NADPH + H+}

此步驟由 **glucose-6-phosphate dehydrogenase(G6PD,葡萄糖-6-磷酸去氫酶)**催化,產生第一分子 NADPH\ce{NADPH},也是 PPP 的主要速率限制步驟。

第二步:6-Phosphogluconolactonase

6-phosphoglucono−δ-lactone+HX2O→6-phosphogluconate\ce{6-phosphoglucono-\delta-lactone + H2O -> 6-phosphogluconate}

此步驟為水解反應,不產生還原當量。

第三步:6-Phosphogluconate dehydrogenase

6-phosphogluconate+NADPX+→Ribulose-5-phosphate+COX2+NADPH+HX+\ce{6-phosphogluconate + NADP+ -> Ribulose-5-phosphate + CO2 + NADPH + H+}

此步驟由 **6-phosphogluconate dehydrogenase(6-磷酸葡萄糖酸去氫酶)**催化,產生第二分子 NADPH\ce{NADPH},並進行氧化脫羧,釋放 COX2\ce{CO2}。

因此,每 1 分子 glucose-6-phosphate 經過氧化階段,總反應可寫成:

Glucose-6-phosphate+2 NADPX++HX2O→Ribulose-5-phosphate+COX2+2 NADPH+2 HX+\ce{Glucose-6-phosphate + 2 NADP+ + H2O -> Ribulose-5-phosphate + CO2 + 2 NADPH + 2 H+}

其中並沒有 NADH\ce{NADH},因為 PPP 使用的是 NADPX+\ce{NADP+},產物是 NADPH\ce{NADPH};糖解作用及檸檬酸循環則主要涉及 NADX+\ce{NAD+} 與 NADH\ce{NADH}。


選項分析

(A) Ribose-5-phosphate

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第 55 題

Which one of the following molecules is NOT a second messenger in the phosphoinositol signaling pathway?

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核心觀念

本題考查「磷酸肌醇訊息傳遞途徑(phosphoinositol signaling pathway)」中的第二訊息者(second messenger)。

第二訊息者是指:細胞外的第一訊息者(first messenger),例如荷爾蒙或神經傳遞物質,與細胞膜上的受體結合後,在細胞內產生、釋放或活化的訊號分子,負責將細胞外訊號傳遞至細胞內。

磷酸肌醇途徑的核心反應如下:

Ligand→G protein-coupled receptor→Gq→phospholipase C (PLC)\text{Ligand} \rightarrow \text{G protein-coupled receptor} \rightarrow \text{G}_q \rightarrow \text{phospholipase C (PLC)}

活化的 PLC 會水解細胞膜上的磷脂醯肌醇-4,5-二磷酸(phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate, PIPX2\ce{PIP2}):

PIPX2→PLCIPX3+DAG\ce{PIP2 ->[PLC] IP3 + DAG}

其中:

  • IPX3\ce{IP3}:促使內質網(endoplasmic reticulum, ER)釋放 CaX2+\ce{Ca^2+}。
  • DAG\ce{DAG}:留在細胞膜上,與 CaX2+\ce{Ca^2+} 共同活化蛋白激酶 C(protein kinase C, PKC)。
  • CaX2+\ce{Ca^2+}:作為細胞內重要的第二訊息者,調節肌肉收縮、分泌、代謝及蛋白質磷酸化等反應。

因此,本途徑的典型第二訊息者包括 IPX3\ce{IP3}、DAG\ce{DAG} 與 CaX2+\ce{Ca^2+}。


解題方法

判斷選項是否屬於磷酸肌醇途徑,可直接對照下列關鍵路徑:

PIPX2→PLCIPX3+DAG\ce{PIP2 ->[PLC] IP3 + DAG}

接著:

IPX3→CaX2+ release from ER\ce{IP3 -> Ca^2+ release from ER}

所以只要選項出現在「PIPX2\ce{PIP2} 被 PLC 分解、產生 IPX3\ce{IP3} 和 DAG\ce{DAG},並引起 CaX2+\ce{Ca^2+} 上升」這條路徑中,即屬於本途徑的第二訊息者。

c AMP\ce{cAMP} 雖然是細胞內重要的第二訊息者,但它主要屬於腺苷酸環化酶(adenylyl cyclase)訊息傳遞途徑,並非磷酸肌醇途徑的典型成員。


選項分析

(A) Calcium ions(CaX2+\ce{Ca^2+})

正確,屬於磷酸肌醇途徑中的第二訊息者。

PLC 水解 PIPX2\ce{PIP2} 形成 IPX3\ce{IP3} 後,IPX3\ce{IP3} 會與內質網膜上的 IPX3\ce{IP3} receptor 結合,開啟鈣離子通道,使 CaX2+\ce{Ca^2+} 釋放至細胞質:

IPX3+IPX3 receptor→CaX2+ release\ce{IP3 + IP3 receptor -> Ca^2+ release}

細胞質內升高的 CaX2+\ce{Ca^2+} 可與 calmodulin 結合,亦可與 DAG 一同活化 PKC,因此 CaX2+\ce{Ca^2+} 是本途徑的重要第二訊息者。

(B) Inositol 1,4,5-trisphosphate(IP3)

正確,屬於磷酸肌醇途徑的直接第二訊息者。

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第 56 題

Which of the following DNA types forms a left-handed helix?

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核心觀念

本題考查 DNA 雙股螺旋的「旋向」(helicity 或 handedness):

  • 右手螺旋(right-handed helix):螺旋沿著軸向前進時,旋轉方向如右手螺旋。
  • 左手螺旋(left-handed helix):螺旋方向與右手螺旋相反。

常見 DNA 構型如下:

DNA 構型螺旋旋向主要特徵
A-DNA右手螺旋較短、較寬,常見於低水合 DNA 及 DNA–RNA 雜合雙股
B-DNA右手螺旋生理條件下最常見的 DNA 型態
Z-DNA左手螺旋骨架呈鋸齒狀,常與嘌呤、嘧啶交替排列及負超螺旋有關

因此,題目詢問「形成左手螺旋的 DNA」,關鍵是辨認各 DNA 構型的螺旋旋向。

解題方法

直接利用 DNA 構型與螺旋旋向的固定配對:

A-DNA:右手螺旋\text{A-DNA:右手螺旋} B-DNA:右手螺旋\text{B-DNA:右手螺旋} Z-DNA:左手螺旋\text{Z-DNA:左手螺旋}

符合題目條件者為 Z-DNA,因此選擇 (C)。

Z-DNA 的重要特徵

Z-DNA 是 DNA 的一種左手雙股螺旋構型,名稱中的「Z」主要反映其磷酸脫氧核糖骨架呈現類似鋸齒形(zigzag)的排列。

其常見特徵包括:

  1. 左手螺旋:與 A-DNA、B-DNA 的右手螺旋方向相反。
  2. 骨架呈鋸齒狀:磷酸基團排列形成 zigzag pattern。
  3. 常見於嘌呤與嘧啶交替序列:例如 (CG)n\ce{(CG)n} 或 (GC)n\ce{(GC)n}。
  4. Guanine(鳥嘌呤)常採 syn conformation:相鄰核苷酸的糖苷鍵構形交替變化,有助於形成 Z-DNA。
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第 57 題

Which of the following enzymes is contained in mitochondria?

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核心觀念

本題考查粒線體(mitochondria)內的三羧酸循環(TCA cycle)與電子傳遞鏈(electron transport chain)之酵素定位。

真核細胞的粒線體主要分為:

  • 粒線體基質(matrix):三羧酸循環多數酵素所在位置。
  • 粒線體內膜(inner mitochondrial membrane):電子傳遞鏈複合體與氧化磷酸化相關酵素所在位置。

本題三個酵素均存在於粒線體內,但分布位置不同,因此正確答案為 All of the above。


解題方法

逐一判斷各酵素所參與的代謝途徑與細胞內位置:

  1. 若為三羧酸循環酵素,通常位於粒線體基質。
  2. 若為電子傳遞鏈複合體,則位於粒線體內膜。
  3. 三個選項皆符合粒線體定位時,選擇 (D) All of the above。

選項分析

(A) Succinate dehydrogenase(琥珀酸去氫酶)—正確

Succinate dehydrogenase 同時是:

  • 三羧酸循環中催化 succinate(琥珀酸)氧化的酵素;
  • 電子傳遞鏈的 Complex II(複合體 II)。

其反應為:

Succinate+FAD→Fumarate+FADHX2\ce{Succinate + FAD -> Fumarate + FADH2}

在三羧酸循環中,succinate 被氧化為 fumarate。Succinate dehydrogenase 是唯一同時參與三羧酸循環與電子傳遞鏈的酵素,嵌在粒線體內膜上。

由於位於內膜,所產生的電子可經由 FADHX2\ce{FADH2} 傳遞至 ubiquinone(輔酶 Q,CoQ),形成 ubiquinol(QHX2\ce{QH2}),再進入後續電子傳遞。

因此,Succinate dehydrogenase 確實包含於粒線體中。


(B) Fumarase(延胡索酸酶)—正確

Fumarase 是三羧酸循環的酵素,催化 fumarate(延胡索酸)加水形成 malate(蘋果酸):

Fumarate+HX2O⇌Malate\ce{Fumarate + H2O <=> Malate}

此反應是三羧酸循環中 succinate dehydrogenase 反應之後的下一步:

Succinate→Succinate dehydrogenaseFumarate→ Fumarase Malate\ce{Succinate ->[Succinate\ dehydrogenase] Fumarate ->[\ Fumarase\ ] Malate}

Fumarase 位於粒線體基質,屬於三羧酸循環的基質酵素。因此,Fumarase 也包含於粒線體中。

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第 58 題

Which of the following ions plays a key role in the enzymatic activity of ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase (RuBisCO)?

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核心觀念

本題考查核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶(ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase, RuBisCO)的金屬離子輔因子。

RuBisCO 的活性中心需要二價金屬離子參與催化。酵素先由活化作用形成胺基甲醯化的 Lysine(carbamylated lysine),再結合金屬離子;金屬離子可協助固定底物 ribulose-1,5-bisphosphate(RuBP),並穩定反應過程中的負電荷與烯二醇中間物。

在生理狀況下,RuBisCO 最典型的活化金屬是 MgX2+\ce{Mg^{2+}}。但本題選項沒有鎂離子,MnX2+\ce{Mn^{2+}} 可作為 RuBisCO 的二價金屬輔因子,支持其羧化與加氧反應,因此依官方答案選擇 manganese(錳)。

RuBisCO 所催化的主要羧化反應為:

RuBP+COX2+HX2O⟶23-phosphoglycerate\text{RuBP}+\ce{CO2}+\ce{H2O} \longrightarrow 2\text{3-phosphoglycerate}

其中金屬離子主要作用在活性中心的底物定位、酸鹼催化及反應中間物穩定,而不是作為反應物被消耗。

解題方法

本題可採「酵素金屬輔因子」切入:

  1. RuBisCO 屬於需要二價金屬離子活化的酵素。
  2. 生理上最典型的是 MgX2+\ce{Mg^{2+}}。
  3. 選項中只有 manganese 以 MnX2+\ce{Mn^{2+}} 形式能合理扮演類似的二價金屬輔因子角色。
  4. Calcium 雖為二價離子,但不是 RuBisCO 的典型催化金屬;sodium 為一價離子;iron 並非此酵素的標準活化離子。
  5. 因此在本題既定選項與官方答案下,選 MnX2+\ce{Mn^{2+}}。

選項分析

(A) Calcium(鈣)—錯誤

CaX2+\ce{Ca^{2+}} 是重要的細胞訊息傳遞離子,也參與細胞壁、膜穩定及部分蛋白質功能,但不是 RuBisCO 的典型催化金屬離子。

RuBisCO 活性中心所需的二價金屬,主要是 MgX2+\ce{Mg^{2+}},而 MnX2+\ce{Mn^{2+}} 可在實驗條件下提供相近的催化功能。鈣離子不屬於本題所考的標準 RuBisCO 活化離子。

(B) Sodium(鈉)—錯誤

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第 59 題

What is the main site of fatty acid β\beta-oxidation in cells?

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核心觀念

脂肪酸 β\beta-氧化(fatty acid β\beta-oxidation)是將脂肪酸逐步分解成乙醯輔酶 A(acetyl-CoA)的主要分解代謝途徑,並產生可供電子傳遞鏈使用的還原當量:

  • FADHX2\ce{FADH2}
  • NADH\ce{NADH}
  • acetyl-CoA

在真核細胞中,長鏈脂肪酸經活化及肉鹼穿梭系統(carnitine shuttle)運送後,主要於**粒線體基質(mitochondrial matrix)**進行 β\beta-氧化。因此本題答案為粒線體。


解題方法

判斷脂肪酸 β\beta-氧化的位置,可依序掌握三個重點:

  1. 脂肪酸先在細胞質側或粒線體外膜附近被活化成 fatty acyl-CoA。
  2. 長鏈 fatty acyl-CoA 不能直接通過粒線體內膜,需利用肉鹼穿梭系統:
  • CPT I(carnitine palmitoyltransferase I)將 fatty acyl-CoA 轉成 acyl-carnitine。
  • Carnitine-acylcarnitine translocase 將 acyl-carnitine 運入粒線體基質。
  • CPT II 再將其轉回 fatty acyl-CoA。
  1. fatty acyl-CoA 在粒線體基質進行反覆的四步驟 β\beta-氧化循環。

每一輪循環依序包括:

  1. 氧化:acyl-CoA dehydrogenase
    產生 trans-Δ2\Delta^2-enoyl-CoA,並將 FAD 還原為 FADHX2\ce{FADH2}。
  2. 水合:enoyl-CoA hydratase
    形成 L-3-hydroxyacyl-CoA。
  3. 氧化:3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase
    形成 3-ketoacyl-CoA,並將 NADX+\ce{NAD+} 還原為 NADH\ce{NADH}。
  4. 硫解:β\beta-ketothiolase
    加入 CoA−SH\ce{CoA-SH},產生 acetyl-CoA,以及縮短兩個碳的 fatty acyl-CoA。

總反應可概念化表示為:

fatty acyl-CoA→acetyl-CoA+縮短兩碳的 fatty acyl-CoA+FADHX2+NADH\text{fatty acyl-CoA} \rightarrow \text{acetyl-CoA} + \text{縮短兩碳的 fatty acyl-CoA} + \ce{FADH2} + \ce{NADH}

因此,題目問「主要位置」時,應選擇負責一般脂肪酸分解的粒線體。


選項分析

(A) Cytosol(細胞質)錯誤

細胞質不是一般脂肪酸 β\beta-氧化的主要場所。

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第 60 題

Ketone bodies are water-soluble molecules that contain ketone groups and are produced from fatty acids by the liver. Which of the following molecules is NOT a liver-derived ketone body?

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核心觀念

本題考查「酮體(ketone bodies)」的定義、肝臟中的酮體生成(ketogenesis),以及三種主要酮體:

  1. Acetoacetate(乙醯乙酸)
  2. β\beta-Hydroxybutyrate(β\beta-羥基丁酸)
  3. Acetone(丙酮)

酮體是肝臟利用脂肪酸分解產生的 acetyl-CoA,在飢餓、長時間運動、低醣飲食或未控制糖尿病時合成的水溶性代謝物。其主要功能是運送脂肪酸所提供的能量,供腦、心肌及骨骼肌使用。

判斷酮體時,必須注意「ketone bodies」是代謝分類名稱,不是只要含有某種短鏈碳化合物就算。Acetoacetate、β\beta-hydroxybutyrate 與 acetone 才是標準的三種酮體。


解題方法

直接比對各選項是否屬於標準酮體即可。

肝臟的酮體生成途徑如下:

2 Acetyl−CoA⟶thiolaseAcetoacetyl−CoA2\ \ce{Acetyl-CoA} \overset{\text{thiolase}}{\longrightarrow} \ce{Acetoacetyl-CoA} Acetoacetyl−CoA+Acetyl−CoA⟶HMG-CoA synthaseHMG−CoA\ce{Acetoacetyl-CoA + Acetyl-CoA} \overset{\text{HMG-CoA synthase}}{\longrightarrow} \ce{HMG-CoA} HMG−CoA⟶HMG-CoA lyaseAcetoacetate+Acetyl−CoA\ce{HMG-CoA} \overset{\text{HMG-CoA lyase}}{\longrightarrow} \ce{Acetoacetate + Acetyl-CoA}

形成的 Acetoacetate\ce{Acetoacetate} 有兩條主要去路:

Acetoacetate+NADH+HX+⇌β-hydroxybutyrate dehydrogenaseβ-Hydroxybutyrate+NADX+\ce{Acetoacetate + NADH + H+} \overset{\beta\text{-hydroxybutyrate dehydrogenase}}{\rightleftharpoons} \ce{\beta-Hydroxybutyrate + NAD+}

以及自發脫羧:

Acetoacetate⟶Acetone+COX2\ce{Acetoacetate} \longrightarrow \ce{Acetone + CO2}

因此,酮體生成的關鍵中間產物是 Acetoacetate\ce{Acetoacetate},再分別形成 β-Hydroxybutyrate\ce{\beta-Hydroxybutyrate} 與 Acetone\ce{Acetone}。


選項分析

(A) Acetoacetate

正確屬於酮體。

Acetoacetate(乙醯乙酸)是肝臟酮體生成途徑的第一個主要產物,由 HMG−CoA\ce{HMG-CoA} 經 HMG-CoA lyase 裂解形成。它可被送入血液,供周邊組織利用,也可轉變為另外兩種酮體。

因此,A 不是本題所問的「NOT」。


(B) Acetic acid

此選項不是酮體,故為正確答案。

Acetic acid(醋酸、乙酸)的結構為 CHX3COOH\ce{CH3COOH},屬於 carboxylic acid(羧酸),具有羧基 −COOH\ce{-COOH},不是 ketone(酮)。

酮體中的 β\beta-hydroxybutyrate 雖然名稱含有 hydroxy,但仍被歸入酮體代謝系統;acetoacetate 與 acetone 則分別具有酮體途徑中的酮基結構。然而 acetic acid 並不屬於三種標準酮體,也不是酮體生成途徑的主要產物。

因此,官方答案為 B。


(C) β\beta-Hydroxybutyrate

正確屬於酮體。

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第 61 題

What is the net gain in ATP molecules from lactic fermentation by the homofermentative process?

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核心觀念

本題考查「同型乳酸發酵」(homofermentative lactic fermentation)的 ATP 淨產量。

同型乳酸菌主要利用糖解作用(glycolysis)將 1 分子葡萄糖分解成 2 分子乳酸,並以乳酸發酵再生 NADX+\ce{NAD+},使糖解作用能持續進行。乳酸發酵本身不額外製造 ATP。

整體反應可表示為:

Glucose+2 ADP+2 Pi→2 Lactate+2 ATP+2 HX2O\ce{Glucose + 2 ADP + 2 Pi -> 2 Lactate + 2 ATP + 2 H2O}

因此,每 1 分子葡萄糖經同型乳酸發酵後,ATP 淨收益為 2 分子。

解題方法與代謝機轉

關鍵在於分開計算「糖解作用產生的 ATP」與「乳酸生成反應的作用」。

  1. 糖解作用的投資階段

在 phosphofructokinase-1(PFK-1)及 hexokinase(己糖激酶)等反應中,共消耗 2 分子 ATP:

Glucose→Glucose-6-phosphate→Fructose-6-phosphate→Fructose-1,6-bisphosphate\ce{Glucose -> Glucose-6-phosphate -> Fructose-6-phosphate -> Fructose-1,6-bisphosphate}
  1. 糖解作用的回收階段

1 分子 fructose-1,6-bisphosphate(果糖-1,6-二磷酸)裂解成兩個三碳中間物,最後形成 2 分子 pyruvate(丙酮酸)。在此階段透過 substrate-level phosphorylation(受質層級磷酸化)產生:

  • phosphoglycerate kinase:產生 2 分子 ATP
  • pyruvate kinase:產生 2 分子 ATP

總共產生 4 分子 ATP。

因此糖解作用的 ATP 淨收益為:

4−2=2 ATP4-2=2\ \text{ATP}
  1. 丙酮酸還原為乳酸

在乳酸脫氫酶(lactate dehydrogenase, LDH)作用下:

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第 62 題

Which of the following molecules is the final electron acceptor in the electron transport chain?

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核心觀念

本題考查粒線體電子傳遞鏈(electron transport chain, ETC)的最終電子受體。

在真核細胞中,電子傳遞鏈位於粒線體內膜,電子依序經過:

NADH→Complex I\text{NADH} \rightarrow \text{Complex I}

或

FADH2→Complex II\text{FADH}_2 \rightarrow \text{Complex II}

接著經由輔酶 Q(coenzyme Q)、Complex III、cytochrome cc,最後抵達 Complex IV(cytochrome cc oxidase,細胞色素 cc 氧化酶)。

Complex IV 將電子交給氧氣,氧氣接受電子與質子後生成水:

OX2+4 eX−+4 HX+→2 HX2O\ce{O2 + 4e^- + 4H+ -> 2H2O}

因此,氧氣是電子傳遞鏈的最終電子受體;水則是反應產物。

解題方法

判斷「final electron acceptor」時,直接尋找電子傳遞鏈末端接受電子的分子。

電子傳遞鏈的功能是將 NADH 與 FADHX2\ce{FADH2} 所攜帶的高能電子,逐步傳遞給氧氣。Complex IV 催化最後一步:

OX2→HX2O\ce{O2 -> H2O}

氧氣在此被還原,水是被還原後形成的最終產物。因此本題選擇 Oxygen。

選項分析

(A) Nitrogen

Nitrogen(氮)不是粒線體電子傳遞鏈的最終電子受體。正常有氧呼吸中,電子傳遞鏈的末端電子受體是氧氣,不是氮氣 NX2\ce{N2}。

氮元素雖然參與胺基酸、核苷酸等生物分子的組成,但不負責接受電子傳遞鏈末端的電子,故錯誤。

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第 63 題

Which of the following metabolic reactions occurs in the mitochondrial matrix?

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核心觀念

本題考查真核細胞主要代謝途徑的細胞區室(subcellular compartment):

  • 粒線體基質(mitochondrial matrix):主要進行 Citric acid cycle(檸檬酸循環,又稱 TCA cycle)及部分 gluconeogenesis。
  • 細胞質(cytosol):主要進行 glycolysis(糖解作用)與 pentose phosphate pathway(磷酸戊糖途徑)。
  • 粒線體內膜(inner mitochondrial membrane):進行 electron transport chain(電子傳遞鏈)與 oxidative phosphorylation(氧化磷酸化)。

本題官方答案為 A,命題重點是辨認「最典型、主要位於粒線體基質中的完整代謝途徑」。


解題方法

逐一判斷各代謝途徑的主要發生位置:

  1. Citric acid cycle:位於粒線體基質。
  2. Glycolysis:位於細胞質。
  3. Pentose phosphate pathway:位於細胞質。
  4. Gluconeogenesis:是跨區室途徑,部分反應位於粒線體基質,但整條途徑並非完全在粒線體基質中進行。

因此,依亞洲大學此題的單選命題意圖,選擇最具代表性的粒線體基質代謝途徑,即 A。


選項分析

(A) Citric acid cycle(檸檬酸循環)—正確

Citric acid cycle 的主要反應位於粒線體基質,功能是將 acetyl-CoA(乙醯輔酶 A)氧化成 COX2\ce{CO2},並產生還原當量:

Acetyl−CoA+3 NADX++FAD+GDP+Pi+2 HX2O→2 COX2+3 NADH+FADHX2+GTP+CoA−SH+3 HX+\ce{Acetyl-CoA + 3 NAD+ + FAD + GDP + Pi + 2 H2O -> 2 CO2 + 3 NADH + FADH2 + GTP + CoA-SH + 3 H+}

主要反應順序如下:

  1. Citrate synthase(檸檬酸合成酶)
    Oxaloacetate+Acetyl−CoA→Citrate\ce{Oxaloacetate + Acetyl-CoA -> Citrate}

  2. Aconitase(順烏頭酸酶)
    Citrate ⇌\rightleftharpoons Isocitrate

  3. Isocitrate dehydrogenase(異檸檬酸去氫酶)
    產生 NADH\ce{NADH} 與 COX2\ce{CO2}。

  4. α\alpha-Ketoglutarate dehydrogenase complex(α\alpha-酮戊二酸去氫酶複合體)
    產生 NADH\ce{NADH} 與 COX2\ce{CO2}。

  5. Succinyl-CoA synthetase(琥珀醯輔酶 A 合成酶)
    進行 substrate-level phosphorylation,產生 GTP。

  6. Succinate dehydrogenase(琥珀酸去氫酶)
    產生 FADHX2\ce{FADH2},此酵素同時也是電子傳遞鏈的 Complex II,嵌在粒線體內膜上。

  7. Fumarase(延胡索酸酶)
    Fumarate →\rightarrow Malate

  8. Malate dehydrogenase(蘋果酸去氫酶)
    Malate →\rightarrow Oxaloacetate,產生 NADH\ce{NADH}。

除了 succinate dehydrogenase 位於粒線體內膜,其餘檸檬酸循環酵素主要位於粒線體基質。因此在考試分類上,Citric acid cycle 應判定為發生於 mitochondrial matrix。


(B) Glycolysis(糖解作用)—錯誤

Glycolysis 發生於細胞質,不需要粒線體直接參與。其主要步驟為:

Glucose→2 Pyruvate\ce{Glucose -> 2 Pyruvate}

關鍵酵素包括:

  • Hexokinase(己糖激酶)或 glucokinase(葡萄糖激酶)
  • Phosphofructokinase-1, PFK-1(磷酸果糖激酶-1)
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第 64 題

Which of the following amino acids is achiral?

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核心觀念

本題考查胺基酸的**手性(chirality)**與「手性中心(chiral center)」判定。

一般 α\alpha-胺基酸的 α\alpha-碳原子連接四個基團:

NHX2−CXα(H)(R)−COOH\ce{NH2-C_\alpha(H)(R)-COOH}

若 α\alpha-碳連接的四個基團皆不相同,便是手性中心,該胺基酸具有立體異構物(通常為 LL 型與 DD 型)。若同一個碳連接兩個相同基團,則不具手性。

甘胺酸(glycine)的側鏈為 R=HR=\ce{H},因此其 α\alpha-碳連接兩個氫原子,不是手性中心。

解題方法

逐一檢查各胺基酸的 α\alpha-碳所連接的四個基團:

  1. 胺基或亞胺基
  2. 羧基
  3. 氫原子
  4. 側鏈 RR

只要側鏈不是氫,通常四個基團便彼此不同,α\alpha-碳即具有手性。甘胺酸的側鏈也是氫,造成 α\alpha-碳上有兩個相同的氫原子,因此為 achiral(非手性)。

選項分析

(A) Proline(脯胺酸)—錯誤

脯胺酸的側鏈為:

−(CHX2)X3X−\ce{-(CH2)3-}

此側鏈與 α\alpha-胺基形成環狀結構。脯胺酸的 α\alpha-碳仍連接四種不同的基團:

  • 羧基 −COOH\ce{-COOH}
  • 氫原子 −H\ce{-H}
  • 環狀含氮基團的一側
  • 環狀含氮基團的另一側

因此 α\alpha-碳為手性中心,脯胺酸屬於 chiral amino acid。

脯胺酸的胺基屬於次級胺(secondary amine),但這不會使其 α\alpha-碳失去手性。

(B) Leucine(白胺酸)—錯誤

白胺酸的側鏈為:

−CHX2−CH(CHX3)X2\ce{-CH2-CH(CH3)2}
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第 65 題

Which of the following is NOT a basic amino acid?

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核心觀念

本題考查胺基酸側鏈的酸鹼性與分類。

「鹼性胺基酸(basic amino acids)」是指其側鏈含有可接受質子的鹼性官能基,在適當 pH 下可帶正電。常見的鹼性胺基酸包括:

  • Histidine(組胺酸,H)
  • Arginine(精胺酸,R)
  • Lysine(離胺酸,K)

Leucine(白胺酸,L)則屬於非極性、疏水性胺基酸,側鏈不具鹼性官能基。

胺基酸的酸鹼性主要取決於側鏈官能基是否能進行質子化反應:

B+HX+⇌BHX+\ce{B + H+ <=> BH+}

鹼性胺基酸的側鏈在質子化後通常帶有正電荷。

解題方法

判斷每個選項的側鏈結構:

  1. 若側鏈含有可接受質子的含氮官能基,例如 amino group、imidazole group 或 guanidinium group,屬於鹼性胺基酸。
  2. 若側鏈主要是碳氫鏈,缺乏可進行酸鹼反應的官能基,則通常屬於非極性胺基酸。
  3. 找出不具鹼性側鏈的選項,即為題目所問的 NOT。

四個選項中,Leucine 的側鏈為異丁基:

−CHX2−CH(CHX3)X2\ce{-CH2-CH(CH3)2}

此側鏈是非極性的碳氫鏈,不含可質子化的鹼性氮原子,因此不是鹼性胺基酸。

選項分析

(A) Histidine

Histidine 的側鏈含有 imidazole ring(咪唑環),其中的環狀氮可接受質子:

Imidazole+HX+⇌ImidazoliumX+\ce{Imidazole + H+ <=> Imidazolium+}

咪唑基的側鏈 pKapK_a 約為 6.06.0,屬於弱鹼性側鏈。在生理 pH 附近,Histidine 的側鏈可在未帶電與帶正電形式間轉換,因此常參與酵素活性中心的質子轉移。

Histidine 屬於鹼性胺基酸,此選項不是答案。

(B) Leucine

Leucine 的側鏈為疏水性脂肪族碳氫鏈:

−CHX2−CH(CHX3)X2\ce{-CH2-CH(CH3)2}
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第 66 題

Which of the following is NOT a glucogenic amino acid?

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核心觀念

胺基酸分解後,其碳骨架可轉變為:

  • 生糖性胺基酸(glucogenic amino acids):轉變為丙酮酸(pyruvate)或三羧酸循環(TCA cycle)的中間物,能經由糖質新生作用(gluconeogenesis)形成葡萄糖。
  • 生酮性胺基酸(ketogenic amino acids):轉變為乙醯輔酶 A(acetyl-CoA)或乙醯乙酸(acetoacetate),可形成酮體或脂肪酸,但不能淨生成葡萄糖。
  • 兼具生糖性與生酮性:碳骨架同時產生生糖與生酮產物。

人體中「純生酮性」胺基酸只有:

  1. Leucine(白胺酸)
  2. Lysine(離胺酸)

因此,本題只要辨認各選項的碳骨架最終產物,即可判斷。

解題方法

逐一追蹤胺基酸分解後的碳骨架:

胺基酸主要分解產物分類
AsparagineOxaloacetate(草醯乙酸)生糖性
MethionineSuccinyl-CoA(琥珀醯輔酶 A)生糖性
LeucineAcetyl-CoA、Acetoacetate純生酮性
Prolineα-Ketoglutarate(α-酮戊二酸)生糖性

能進入糖質新生作用的 TCA cycle 中間物包括 oxaloacetate、α-ketoglutarate 衍生物及 succinyl-CoA 衍生物;其中 acetyl-CoA 無法造成葡萄糖的淨生成。因此,不能形成生糖性中間物的 Leucine 即為答案。

選項分析

(A) Asparagine(天門冬醯胺)

Asparagine 先由 **asparaginase(天門冬醯胺酶)**水解,生成 Aspartate(天門冬胺酸):

Asparagine→Aspartate+NHX4X+\text{Asparagine} \rightarrow \text{Aspartate} + \ce{NH4+}

接著 Aspartate 可經由 **AST,aspartate aminotransferase(天門冬胺酸轉胺酶)**轉換為 Oxaloacetate:

Aspartate+α-Ketoglutarate⇌Oxaloacetate+Glutamate\text{Aspartate} + \alpha\text{-Ketoglutarate} \rightleftharpoons \text{Oxaloacetate} + \text{Glutamate}

Oxaloacetate 可進入糖質新生作用,因此 Asparagine 是生糖性胺基酸。此選項錯誤。

(B) Methionine(甲硫胺酸)

Methionine 經由轉硫途徑(transsulfuration pathway)分解,其碳骨架可形成 Propionyl-CoA,接著轉變為 Succinyl-CoA:

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第 67 題

The intermediate compound common to aerobic and anaerobic respiration is:

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核心觀念

本題考查有氧呼吸(aerobic respiration)與無氧呼吸/發酵(anaerobic respiration/fermentation)共同經過的代謝中間物。

葡萄糖首先經由糖解作用(glycolysis)分解成丙酮酸(pyruvic acid,生理 pH 下主要為 pyruvate):

Glucose→glycolysis2 Pyruvate\ce{Glucose ->[glycolysis] 2 Pyruvate}

糖解作用發生於細胞質,產生:

  • 22 分子丙酮酸
  • 淨得 22 分子 ATP
  • 22 分子 NADH\ce{NADH}

丙酮酸是糖解作用的終產物,也是後續有氧與無氧代謝的共同分流點。


解題方法

判斷本題的關鍵,是沿著葡萄糖分解後的路徑向下追蹤:

Glucose→Pyruvate\ce{Glucose -> Pyruvate}

形成丙酮酸後,代謝分成兩條主要方向:

  1. 有氧呼吸

在氧氣充足時,丙酮酸進入粒線體,由丙酮酸去氫酶複合體(pyruvate dehydrogenase complex)催化氧化脫羧:

Pyruvate→Acetyl−CoA+COX2+NADH\ce{Pyruvate -> Acetyl-CoA + CO2 + NADH}

接著 Acetyl−CoA\ce{Acetyl-CoA} 進入檸檬酸循環(citric acid cycle),產生更多 NADH\ce{NADH} 與 FADHX2\ce{FADH2},再經電子傳遞鏈與氧化磷酸化產生大量 ATP。

  1. 無氧代謝

缺乏氧氣時,電子傳遞鏈無法正常以 OX2\ce{O2} 作為最終電子受體。此時丙酮酸可接受電子,使 NADH\ce{NADH} 再生為 NADX+\ce{NAD+},維持糖解作用持續進行。

例如乳酸發酵:

Pyruvate+NADH+HX+→lactate dehydrogenaseLactate+NADX+\ce{Pyruvate + NADH + H+ ->[lactate\ dehydrogenase] Lactate + NAD+}

酒精發酵則為:

Pyruvate→pyruvate decarboxylaseAcetaldehyde+COX2\ce{Pyruvate ->[pyruvate\ decarboxylase] Acetaldehyde + CO2} Acetaldehyde+NADH+HX+→alcohol dehydrogenaseEthanol+NADX+\ce{Acetaldehyde + NADH + H+ ->[alcohol\ dehydrogenase] Ethanol + NAD+}

因此,丙酮酸位於有氧呼吸與無氧代謝的共同路徑交會點,故選 (C)\textbf{(C)}。


選項分析

(A) Succinic acid,琥珀酸

琥珀酸是檸檬酸循環中的中間物,路徑為:

Succinate→succinate dehydrogenaseFumarate\ce{Succinate ->[succinate dehydrogenase] Fumarate}
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第 68 題

Which of the following is the common intermediate compound for carbohydrates, lipids, and amino acids to enter the citric acid cycle in the respiratory pathway?

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核心觀念

本題考查醣類、脂質與胺基酸分解後,如何匯入 citric acid cycle(檸檬酸循環,又稱 Krebs cycle)。

三大營養素的分解途徑如下:

  • 醣類:葡萄糖經 glycolysis(糖解作用)形成 pyruvate(丙酮酸),再由 pyruvate dehydrogenase complex(丙酮酸去氫酶複合體)催化,生成 acetyl-CoA(乙醯輔酶 A)。
  • 脂質:脂肪酸經 β\beta-oxidation(β-氧化)反覆切割,主要產生 acetyl-CoA。
  • 胺基酸:先經 transamination(轉胺作用)、deamination(脫胺作用)等反應,碳骨架可轉變成 pyruvate、acetyl-CoA 或 citric acid cycle 的其他中間物。

其中,acetyl-CoA 可與 oxaloacetate(草醯乙酸)縮合,形成 citrate(檸檬酸),正式進入檸檬酸循環:

Acetyl−CoA+Oxaloacetate→Citrate+CoA−SH\ce{Acetyl-CoA + Oxaloacetate -> Citrate + CoA-SH}

此反應由 citrate synthase(檸檬酸合成酶)催化。


解題方法

判斷本題的關鍵,是找出三大營養素分解後,能共同匯入檸檬酸循環的代表性代謝中間物。

整合三條路徑:

Carbohydrates→Pyruvate→Acetyl-CoA\text{Carbohydrates} \rightarrow \text{Pyruvate} \rightarrow \text{Acetyl-CoA} Lipids→Fatty acids→β-oxidationAcetyl-CoA\text{Lipids} \rightarrow \text{Fatty acids} \xrightarrow{\beta\text{-oxidation}} \text{Acetyl-CoA} Amino acids→Carbon skeletons→Acetyl-CoA or TCA intermediates\text{Amino acids} \rightarrow \text{Carbon skeletons} \rightarrow \text{Acetyl-CoA or TCA intermediates}

因此,依本題及一般基礎生化考試的命題慣例,三者共同銜接呼吸代謝與檸檬酸循環的標準答案為 acetyl-CoA。


選項分析

(A) Succinic acid(琥珀酸)錯誤

Succinic acid 在生理條件下通常以 succinate(琥珀酸根)形式存在,是檸檬酸循環內部的中間物。

其生成反應為:

Succinyl−CoA→Succinate\ce{Succinyl-CoA -> Succinate}

此反應由 succinyl-CoA synthetase(琥珀醯輔酶 A 合成酶)催化,並伴隨 GTP 或 ATP 的形成。

Succinic acid 並不是醣類、脂質與胺基酸共同進入檸檬酸循環的主要匯合點,而是已經位於循環內部,因此不是本題答案。


(B) Acetyl-CoA(乙醯輔酶 A)正確

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第 69 題

Which of the following compounds is involved in the urea cycle?

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核心觀念

本題考查尿素循環(urea cycle,又稱 ornithine cycle)的參與物質,以及胺基酸分解與三羧酸循環(TCA cycle)之間的代謝連結。

尿素循環的主要功能,是將有毒的氨 NHX3\ce{NH3} 轉換成尿素 CO(NHX2)X2\ce{CO(NH2)2},再由尿液排出。其反應主要發生於肝細胞:

  • 前兩步位於粒線體(mitochondria)
  • 後三步位於細胞質(cytosol)

尿素的兩個氮來源分別是:

  1. 游離氨 NHX3\ce{NH3}
  2. Aspartate(天門冬胺酸)的胺基

尿素循環的碳原子則來自 COX2\ce{CO2},以 bicarbonate(碳酸氫根)形式參與。


解題方法

判斷某化合物是否「涉及尿素循環」,可檢查它是否符合下列任一條件:

  1. 是尿素循環的直接中間產物;
  2. 提供尿素的氮原子;
  3. 是尿素循環反應產生、並與其他代謝途徑相連的產物。

尿素循環的關鍵反應如下:

1. 形成 carbamoyl phosphate(氨甲醯磷酸)

由 carbamoyl phosphate synthetase I,CPS I(氨甲醯磷酸合成酶 I)催化:

NHX3+HCOX3X−+2 ATP→Carbamoyl phosphate+2 ADP+Pi\ce{NH3 + HCO3^- + 2 ATP -> Carbamoyl\ phosphate + 2 ADP + Pi}

此步驟發生於粒線體,並使用游離氨。

2. 形成 citrulline(瓜胺酸)

由 ornithine transcarbamylase,OTC(鳥胺酸轉氨甲醯酶)催化:

Ornithine+Carbamoyl phosphate→Citrulline+Pi\ce{Ornithine + Carbamoyl\ phosphate -> Citrulline + Pi}

Ornithine(鳥胺酸)是尿素循環的重要載體,會在循環中反覆再生。

3. 形成 argininosuccinate(精胺基琥珀酸)

Citrulline 進入細胞質後,由 argininosuccinate synthetase,ASS(精胺基琥珀酸合成酶)催化,並使用 Aspartate:

Citrulline+Aspartate+ATP→Argininosuccinate+AMP+PPi\ce{Citrulline + Aspartate + ATP -> Argininosuccinate + AMP + PPi}

此步驟將 Aspartate 的胺基加入循環,成為尿素的第二個氮來源。

4. 分解 argininosuccinate

由 argininosuccinate lyase,ASL(精胺基琥珀酸裂解酶)催化:

Argininosuccinate→Arginine+Fumarate\ce{Argininosuccinate -> Arginine + Fumarate}

Fumarate(延胡索酸)是此反應的產物,並可進入 TCA cycle。Fumarate 經由 fumarase(延胡索酸酶)轉換為 malate(蘋果酸),再經由 malate dehydrogenase(蘋果酸去氫酶)形成 oxaloacetate(草醯乙酸);草醯乙酸可再經 transamination(轉胺作用)形成 Aspartate。

因此,尿素循環與 TCA cycle 之間形成「aspartate–argininosuccinate shunt」(天門冬胺酸-精胺基琥珀酸旁路)的代謝連結。

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第 70 題

With a higher content of which base pair will the DNA melting temperature (TmT_m) be higher?

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核心觀念

本題考核 DNA 熔解溫度(melting temperature, TmT_m)與鹼基組成的關係。

TmT_m 是指雙股 DNA 約有一半解離成單股時的溫度。DNA 雙股穩定度越高,解開雙股所需的熱能越多,TmT_m 就越高。

在一般考試條件下:

  • G–C 鹼基對具有 3 個氫鍵
  • A–T 鹼基對具有 2 個氫鍵

因此,DNA 中 G–C 含量越高,雙股結構通常越穩定,TmT_m 越高。

短鏈 DNA 常用近似公式表示:

Tm≈2∘C×(A+T)+4∘C×(G+C)T_m \approx 2^\circ\mathrm{C}\times(A+T)+4^\circ\mathrm{C}\times(G+C)

此公式顯示,每增加一組 G–C 鹼基對,對 TmT_m 的貢獻大於增加一組 A–T 鹼基對。

解題方法

判斷 DNA 熔解溫度時,依序掌握兩個重點:

  1. DNA 雙股主要由互補鹼基配對及鹼基堆疊作用維持。
  2. G–C 鹼基對的氫鍵數量多於 A–T 鹼基對,且 G–C 含量增加通常代表雙股 DNA 穩定度提高。

因此:

G–C 含量增加⇒DNA 雙股穩定度增加⇒Tm 升高\text{G–C 含量增加} \Rightarrow \text{DNA 雙股穩定度增加} \Rightarrow T_m \text{ 升高}

選項分析

(A) GC:正確

G–C 鹼基對具有 3 個氫鍵,較 A–T 鹼基對穩定。當 DNA 的 G–C 含量較高時,雙股 DNA 需要較高溫度才能解離,因此 TmT_m 較高。

此外,鹼基堆疊作用也會影響 DNA 穩定度;在相同長度、鹽濃度及其他條件下,較高的 G–C 比例通常與較高的 TmT_m 相關。

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第 71 題

Which of the following coenzymes is required for acetyl-CoA carboxylase activity in fatty acid synthesis?

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核心觀念

本題考查脂肪酸合成第一個、也是重要的承諾步驟:由 acetyl-CoA carboxylase(ACC,乙醯輔酶 A 羧化酶) 催化 acetyl-CoA 羧化形成 malonyl-CoA。

反應如下:

Acetyl−CoA+HCOX3X−+ATP→Malonyl−CoA+ADP+Pi\ce{Acetyl-CoA + HCO3^- + ATP -> Malonyl-CoA + ADP + Pi}

ACC 所需的輔酶是 biotin(生物素,維生素 B7)。Biotin 以共價方式結合在酵素的 lysine(離胺酸)殘基上,作為可移動的二氧化碳攜帶者,將羧基由一個活性中心移轉至另一個活性中心。

ACC 的反應可分為兩個階段:

  1. Biotin carboxylase domain:利用 ATP,使 biotin 接受由 HCOX3X−\ce{HCO3^-} 提供的羧基。
  2. Carboxyl transferase domain:將活化的羧基轉移至 acetyl-CoA,生成 malonyl-CoA。

在脂肪酸合成途徑中,malonyl-CoA 隨後與 acetyl-CoA 共同進入 fatty acid synthase(脂肪酸合成酶) 的循環反應,經過縮合、還原、脫水、再還原等步驟,使脂肪酸碳鏈逐步延長兩個碳。

解題方法

看到題幹中的兩個關鍵字:

  • acetyl-CoA carboxylase
  • fatty acid synthesis

應立即聯想到:

Acetyl-CoA→biotinACCMalonyl-CoA\text{Acetyl-CoA} \xrightarrow[\text{biotin}]{\text{ACC}} \text{Malonyl-CoA}

只要題目問「羧化酶」在脂肪酸合成中所需的輔酶,答案即為 biotin。

生理上,ACC 的活性受到代謝調控:

  • **Citrate(檸檬酸)**促進 ACC 聚合與活化。
  • Palmitoyl-CoA 等長鏈脂醯-CoA 可抑制 ACC。
  • **Insulin(胰島素)**促進 ACC 去磷酸化,使其活化。
  • AMP-activated protein kinase,AMPK 磷酸化 ACC,使其失活。

不過本題只考 ACC 的直接輔酶,不是在考其激素調控。

選項分析

(A) Folic acid(葉酸)

錯誤。

葉酸的活性形式為 tetrahydrofolate,THF(四氫葉酸),主要負責攜帶一碳單位,例如 methyl、methylene、formyl 等,參與:

  • 嘌呤合成
  • thymidylate(胸腺嘧啶核苷酸)合成
  • methionine(甲硫胺酸)代謝
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第 72 題

Which amino acid has an indole ring?

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核心觀念

本題考查胺基酸側鏈的結構分類,重點是辨認含有 indole ring(吲哚環) 的胺基酸。

吲哚環是由一個苯環(benzene ring)與一個含氮的五元吡咯環(pyrrole ring)稠合而成的雙環芳香族結構。20 種標準胺基酸中,具有吲哚環側鏈者只有:

  • Tryptophan(色胺酸,Trp,W)

色胺酸的側鏈可表示為:

−CHX2−indole ring-\ce{CH2}-\text{indole ring}

因此,色胺酸屬於芳香族胺基酸(aromatic amino acid),其吲哚環上的氮原子可參與氫鍵作用,也使色胺酸具有特殊的光譜與化學性質。


解題方法

解題時直接辨認各選項的側鏈官能基與環狀結構:

  1. 找出是否含有「苯環與含氮五元環稠合」的吲哚結構。
  2. 只有 Tryptophan 的側鏈具有此結構。
  3. 其餘選項雖有些含氮或含環狀結構,但並非吲哚環。

因此正確答案為 Tryptophan。

本題不涉及代謝途徑或計算,關鍵在於胺基酸結構辨認。


選項分析

(A) Proline(脯胺酸)錯誤

脯胺酸的側鏈會與自身的 α\alpha-胺基形成五元環,因此其結構屬於環狀胺基酸。脯胺酸的環為飽和的吡咯烷環(pyrrolidine ring),不具芳香性,也不是由苯環與吡咯環稠合形成的吲哚環。

脯胺酸的重要特徵是:

  • α\alpha-胺基屬於二級胺
  • 常造成蛋白質主鏈彎折
  • 在膠原蛋白結構中相當重要
  • 不具有 indole ring

因此 A 錯誤。

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第 73 題

During protein separation, which method relates to the molecular size of the protein?

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核心觀念

本題考的是蛋白質分離方法的「主要分離依據」。其中,直接依照蛋白質分子大小分離的方法是 gel filtration(凝膠過濾層析),又稱 size-exclusion chromatography, SEC(分子排阻層析)。

凝膠過濾層析的固定相含有許多具有一定孔徑的多孔性膠體顆粒:

  • 大分子蛋白質無法進入孔洞,主要沿著顆粒外部空間流動,因此較早流出。
  • 小分子蛋白質能進入較多孔洞,在固定相內滯留時間較長,因此較晚流出。

因此,蛋白質的流出順序與其分子大小及水動力半徑(hydrodynamic radius)有關。

常用的分析公式為:

Kav=Ve−V0Vt−V0K_{\mathrm{av}}=\frac{V_e-V_0}{V_t-V_0}

其中:

  • VeV_e:蛋白質的洗脫體積(elution volume)
  • V0V_0:空隙體積(void volume),代表完全無法進入孔洞的大分子流出體積
  • VtV_t:總床體積(total bed volume)

在適當校正後,KavK_{\mathrm{av}}可與蛋白質分子量建立關係,常以 log⁡(molecular weight)\log(\text{molecular weight}) 對洗脫體積作圖進行估算。

解題方法

題幹問:「哪一種蛋白質分離方法與蛋白質的分子大小有關?」

判斷方式是逐一確認各方法所依據的性質:

  1. 是否依據抗原—抗體專一性?
  2. 是否依據特定配體與蛋白質的結合?
  3. 是否依據蛋白質所帶的電荷?
  4. 是否依據蛋白質能否進入凝膠孔洞?

只有第 4 項是依據蛋白質的分子大小,因此選擇 Gel filtration。

選項分析

(A) Immunoprecipitation(免疫沉澱)

免疫沉澱利用特異性抗體與目標蛋白質的抗原表位結合,使抗原—抗體複合物形成沉澱,常搭配 Protein A 或 Protein G beads 進行分離。

其主要依據是:

  • 抗原與抗體的專一性
  • 抗體對目標蛋白質的辨識能力

並非依據蛋白質分子大小,因此錯誤。

(B) Affinity chromatography(親和層析)

親和層析將特定配體(ligand)固定在填充材料上,利用目標蛋白質與配體間的高度專一性結合進行分離。例如:

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第 74 題

Which of the following immunoglobulins plays a significant role in mucous membranes?

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核心觀念

本題考查五大類免疫球蛋白(immunoglobulin, Ig)的主要分布位置與功能,尤其是黏膜免疫(mucosal immunity)。

人體黏膜表面,包括呼吸道、消化道與泌尿生殖道,經常接觸外來病原體。此處最具代表性的抗體是 IgA,尤其是分泌型 IgA(secretory IgA, sIgA)。

分泌型 IgA 的主要特徵如下:

  • 多以二聚體(dimer)形式存在。
  • 由兩個 IgA 單體、J chain(J 鏈)及 secretory component(分泌片段)組成。
  • 在黏膜固有層由 plasma cell(漿細胞)製造。
  • 透過 polymeric immunoglobulin receptor(pIgR,多聚免疫球蛋白受體)進行跨上皮細胞運輸(transcytosis)。
  • 分泌至腸腔、呼吸道分泌物、唾液、淚液及乳汁中。
  • 主要作用是阻止病原體附著於黏膜上皮,並中和病毒、細菌毒素與其他抗原。

IgA 在黏膜表面的作用以免疫排斥(immune exclusion)為主,通常不強烈活化補體,因此可降低黏膜組織受到過度發炎反應傷害的機會。

解題方法

判斷免疫球蛋白題目的核心,是先將「主要分布位置」與「主要功能」配對:

免疫球蛋白典型形式主要分布或功能
IgG單體血液與組織液;次級免疫反應、調理作用、胎盤運輸
IgA二聚體為主黏膜分泌物;阻止病原體附著與中和
IgM五聚體為主初次免疫反應;強力活化補體
IgD單體B 細胞表面抗原受體

題幹問的是「plays a significant role in mucous membranes」,也就是「在黏膜中具有重要作用」。看到 mucous membranes,應直接聯想到 mucosal IgA、secretory IgA,因此選擇 IgA。

選項分析

(A) IgG:錯誤

IgG 是血清中含量最高的免疫球蛋白,主要以單體形式存在,廣泛分布於血液與組織液中。

其重要功能包括:

  • 中和毒素與病毒。
  • 促進吞噬作用(opsonization,調理作用)。
  • 活化補體的 classical pathway(經典補體途徑)。
  • 透過 Fc receptor 參與抗體依賴型細胞媒介細胞毒作用(ADCC)。
  • 可穿過胎盤,提供胎兒被動免疫。

IgG 並非黏膜分泌物中的主要抗體,因此不是本題最佳答案。部分黏膜組織確實可測得 IgG,且在某些局部感染中具有防禦作用,但題目詢問的是最具代表性的黏膜免疫球蛋白,答案仍為 IgA。

(B) IgA:正確

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第 75 題

In patients who have not previously been infected with SARS-CoV-2 or vaccinated, which type of immunoglobulin can be detected first in the body after infection?

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這一題的完整詳解

核心觀念

本題考查「初次體液免疫反應(primary humoral immune response)」中,各類免疫球蛋白(immunoglobulin)的出現順序與功能。

未曾感染 SARS-CoV-2,也未曾接種疫苗者,體內缺乏針對 SARS-CoV-2 的記憶 B 細胞。病毒抗原進入人體後,先活化初始 B 細胞(naïve B cell),經由 B 細胞受體(B-cell receptor, BCR)辨識抗原,並在 T 輔助細胞,特別是濾泡輔助型 T 細胞(T follicular helper cell, Tfh)的協助下增殖、分化為漿細胞(plasma cell)。

初期漿細胞主要分泌 IgM。經過類別轉換(class switching)與親和力成熟(affinity maturation)後,才逐漸增加 IgG、IgA 等抗體。因此,初次感染後最早可在血液中偵測到的特異性免疫球蛋白,通常是 IgM。

解題方法

判斷此題可依照「初次免疫反應的抗體出現順序」切入:

初始 B 細胞活化⟶IgM 先產生⟶類別轉換⟶IgG、IgA 等增加\text{初始 B 細胞活化} \longrightarrow \text{IgM 先產生} \longrightarrow \text{類別轉換} \longrightarrow \text{IgG、IgA 等增加}

B 細胞在尚未進行類別轉換時,免疫球蛋白重鏈基因首先表現 μ\mu chain,因此分泌 IgM。IgM 常以五聚體(pentamer)形式存在,具有高總結合力(avidity),適合在感染初期快速辨識並凝集病原體,也能有效活化補體。

後續在生發中心(germinal center)中,透過活化誘導胞苷脫胺酶(activation-induced cytidine deaminase, AID),B 細胞進行:

  1. 體細胞超突變(somatic hypermutation)
  2. 抗體類別轉換(class-switch recombination)

在 CD40-CD40L 訊息與細胞激素調控下,B 細胞可由 IgM 轉為 IgG 或 IgA。因而在初次感染的典型免疫反應中,IgM 先出現,IgG 與 IgA 隨後上升。

選項分析

(A) IgG:錯誤

IgG 是血液與組織液中最主要的免疫球蛋白,具有中和病毒、調理作用(opsonization)及活化補體等功能。

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第 76 題

How many cycles of β\beta-oxidation are required to completely process a saturated palmitic acid (CX16\ce{C16})?

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核心觀念

本題考查飽和偶數碳脂肪酸進行 β\beta-oxidation(β\beta-氧化)時,所需的循環次數。

Palmitic acid(棕櫚酸)為飽和脂肪酸,含有 1616 個碳,即 CX16:0\ce{C16:0}。每進行一個 β\beta-oxidation cycle(β\beta-氧化循環),會:

  • 使脂肪酸碳鏈縮短 22 個碳;
  • 產生 11 個 acetyl-CoA(乙醯輔酶 A);
  • 產生 11 個 NADH 與 11 個 FADH2_2。

β\beta-氧化的四個主要反應依序為:

  1. Oxidation(氧化):由 acyl-CoA dehydrogenase(脂醯輔酶 A 去氫酶)催化,形成 trans-Δ2\Delta^2-enoyl-CoA,產生 FADH2_2。
  2. Hydration(水合):由 enoyl-CoA hydratase(水合酶)催化,形成 β\beta-hydroxyacyl-CoA。
  3. Oxidation(氧化):由 β\beta-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase(β\beta-羥基脂醯輔酶 A 去氫酶)催化,形成 β\beta-ketoacyl-CoA,產生 NADH。
  4. Thiolysis(硫解):由 thiolase(硫解酶)催化,釋出 11 個 acetyl-CoA,並留下縮短 22 個碳的脂醯-CoA。

解題方法

對於含有 nn 個碳的飽和偶數碳脂肪酸:

acetyl-CoA 產量=n2\text{acetyl-CoA 產量}=\frac{n}{2}

但最後一段四碳脂醯-CoA會經過一次硫解,直接分解成兩個 acetyl-CoA;因此,實際需要的 β\beta-氧化循環數比 acetyl-CoA 數量少 11:

循環數=n2−1\text{循環數}=\frac{n}{2}-1

代入 palmitic acid 的 n=16n=16:

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第 77 題

Which of the following is a component of succinate dehydrogenase in the electron transport chain?

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核心觀念

本題考查粒線體電子傳遞鏈(electron transport chain, ETC)中各電子傳遞複合體的功能與編號。

Succinate dehydrogenase(琥珀酸去氫酶)具有雙重身分:

  1. 它是三羧酸循環(TCA cycle)中的酵素,催化:
Succinate→succinate dehydrogenaseFumarate\text{Succinate} \xrightarrow{\text{succinate dehydrogenase}} \text{Fumarate}
  1. 它同時構成電子傳遞鏈的 Complex II(複合體 II),又稱 succinate–ubiquinone oxidoreductase。

在此反應中,succinate 被氧化為 fumarate,酵素內的 FAD 接受電子形成 FADHX2\ce{FADH2},電子再經由鐵硫中心(iron-sulfur centers)傳給 ubiquinone(輔酶 Q,Q\ce{Q}),形成 ubiquinol(QHX2\ce{QH2})。

整體可概念化表示為:

Succinate+Q→Fumarate+QHX2\text{Succinate} + \ce{Q} \rightarrow \text{Fumarate} + \ce{QH2}

Complex II 不直接將質子(HX+\ce{H+})泵入膜間腔,因此不直接建立質子梯度,但會將電子導入電子傳遞鏈。

解題方法

看到關鍵字 succinate dehydrogenase,直接聯想到:

  • TCA cycle 的 succinate →\rightarrow fumarate
  • 輔酶為 FAD
  • 電子傳給 ubiquinone
  • 位於電子傳遞鏈的 Complex II

因此本題不需要計算,只要將酵素名稱與複合體功能配對即可。

選項分析

(A) Complex I

錯誤。Complex I 的正式名稱為 NADH dehydrogenase(NADH 去氫酶),又稱 NADH:ubiquinone oxidoreductase。

其主要功能是接收 NADH 的電子:

NADH+HX+→NADX++2 eX−\ce{NADH + H+ -> NAD+ + 2e-}

電子經由 FMN(flavin mononucleotide)及鐵硫中心傳遞給 ubiquinone。Complex I 同時利用電子傳遞釋放的能量泵出 HX+\ce{H+}。

Complex I 的電子來源是 NADH,不是 succinate,因此不是 succinate dehydrogenase 所在的複合體。

(B) Complex II

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第 78 題

What is NOT required for coenzyme A (CoA) synthesis in humans?

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核心觀念

本題考查人體中 輔酶 A(coenzyme A, CoA)的生合成,重點是辨認合成 CoA 所需的:

  • 前驅物(precursors)
  • 維生素來源
  • 胺基酸來源
  • 能量或核苷酸來源

CoA 的結構包含:

  1. Pantothenate(泛酸,Vitamin B5)
  2. Cysteamine(半胱胺)
  3. Adenosine diphosphate(ADP)

其中 cysteamine 來自 Cysteine(半胱胺酸),而 CoA 的合成過程需要消耗 ATP;在中間步驟則會使用 CTP。題目提供的選項中,沒有使用 UTP,因此答案為 D。


CoA 生合成途徑

人體 CoA 合成可概略分為五個步驟:

第一步:泛酸磷酸化

泛酸先被磷酸化形成 4′-phosphopantothenate:

Pantothenate+ATP⟶4′-phosphopantothenate+ADP\text{Pantothenate}+\text{ATP} \longrightarrow 4′\text{-phosphopantothenate}+\text{ADP}

催化酵素為 pantothenate kinase(泛酸激酶,PanK)。

此步驟說明:

  • Vitamin B5 是必要原料。
  • ATP 是必要的磷酸基供體與能量來源。

第二步:接上半胱胺酸

4′-Phosphopantothenate 接上 cysteine,形成 4′-phospho-N-pantothenoylcysteine:

4′-phosphopantothenate+Cysteine+CTP⟶4′-phospho-N-pantothenoylcysteine+CMP4′\text{-phosphopantothenate} +\text{Cysteine} +\text{CTP} \longrightarrow 4′\text{-phospho-N-pantothenoylcysteine} +\text{CMP}

催化酵素為 4′-phosphopantothenoylcysteine synthetase(PPCS)。

此步驟將 cysteine 接入 CoA 前驅物,之後再經脫羧反應形成含有 cysteamine 的結構。


第三步:半胱胺酸脫羧

4′-Phospho-N-pantothenoylcysteine 經由 4′-phosphopantothenoylcysteine decarboxylase(PPCDC) 脫去羧基,形成 4′-phosphopantetheine:

4′-phospho-N-pantothenoylcysteine⟶4′-phosphopantetheine+COX24′\text{-phospho-N-pantothenoylcysteine} \longrightarrow 4′\text{-phosphopantetheine} +\ce{CO2}

這一步使 cysteine 部分轉變為 CoA 結構中的 cysteamine 部分。


第四步:接上 AMP

4′-Phosphopantetheine 與 ATP 反應,形成 dephospho-CoA:

4′-phosphopantetheine+ATP⟶Dephospho-CoA+PPi4′\text{-phosphopantetheine} +\text{ATP} \longrightarrow \text{Dephospho-CoA} +\text{PP}_{\mathrm{i}}
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第 79 題

Which of the following is primarily responsible for synthesizing tRNAs in eukaryotes?

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核心觀念

本題考查真核生物中不同 RNA polymerase(RNA 聚合酶)的分工。

真核細胞的三種主要核內 RNA 聚合酶功能如下:

RNA polymerase主要轉錄產物
RNA polymerase I大部分核糖體 RNA(rRNA),包括 18S、5.8S、28S rRNA
RNA polymerase IImessenger RNA(mRNA)、部分 small nuclear RNA(snRNA)與 microRNA(miRNA)
RNA polymerase IIItransfer RNA(tRNA)、5S rRNA,以及部分小型 RNA
RNA polymerase IV植物特有,參與小干擾 RNA(siRNA)相關轉錄

因此,負責合成真核生物 tRNA 的主要酵素是 RNA polymerase III。


解題方法

看到題目問「synthesizing tRNAs」,直接將 tRNA 對應至真核 RNA polymerase 的分工:

tRNA gene→RNA polymerase IIIpre-tRNA\text{tRNA gene} \xrightarrow{\text{RNA polymerase III}} \text{pre-tRNA}

新生的 pre-tRNA 仍需經過加工,包括:

  1. 移除 5′ 端前導序列;
  2. 移除 3′ 端多餘序列;
  3. 部分 tRNA 加上 3′ 端 CCA;
  4. 進行鹼基修飾;
  5. 摺疊成具有受體莖、反密碼子環等結構的成熟 tRNA。

本題所問的是「主要負責轉錄合成 tRNA 的 RNA polymerase」,卡在上述路徑最前端的基因轉錄步驟,答案為 RNA polymerase III。

真核 tRNA 基因通常具有位於轉錄區內部的內在啟動子元件,包括 A box 與 B box。轉錄時,轉錄因子 TFIIIC 先辨識這些序列,再協助招募 TFIIIB 與 RNA polymerase III,啟動 tRNA 的轉錄。RNA polymerase III 通常在一段由胸腺嘧啶組成的終止序列,即 DNA 上的 poly-T sequence,停止轉錄。


選項分析

(A) RNA polymerase I:錯誤

RNA polymerase I 主要位於核仁,負責轉錄大型核糖體 RNA 前驅物,之後加工形成:

  • 18S rRNA
  • 5.8S rRNA
  • 28S rRNA

這些 rRNA 參與核糖體組裝,但 RNA polymerase I 不負責主要的 tRNA 轉錄。

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第 80 題

Which of the following does NOT affect gene expression without changing the DNA sequence, as an epigenetic modification?

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核心觀念

本題考查「表觀遺傳學(epigenetics)」的定義與主要調控機制。

表觀遺傳調控是指:

在不改變 DNA 鹼基序列的情況下,改變基因的表現狀態,並且部分狀態可在細胞分裂後維持。

主要機制包括:

  1. DNA methylation(DNA 甲基化)
  2. Histone modification(組蛋白修飾)
  3. Non-coding RNA, ncRNA(非編碼 RNA)調控
  4. 染色質重塑(chromatin remodeling)

本題要求找出「不屬於在不改變 DNA 序列下調控基因表現的表觀遺傳修飾」,因此應選擇 DNA mismatch repair(DNA 錯配修復)。


解題方法

逐一判斷各選項是否符合以下兩項條件:

  1. 是否在不改變 DNA 鹼基序列的前提下調控基因表現?
  2. 是否屬於表觀遺傳調控或其相關機制?

DNA 甲基化、組蛋白修飾與 ncRNA 均可改變染色質狀態或影響轉錄、RNA 穩定性與翻譯,因此符合表觀遺傳調控概念。

DNA mismatch repair 則是 DNA 修復途徑,作用在於辨認並修正複製過程中產生的錯配鹼基,並非用來調控基因表現。因此答案為 D。


選項分析

(A) DNA methylation(DNA 甲基化)—錯誤選項

DNA 甲基化通常發生在胞嘧啶(cytosine)的 5’ 碳位置,形成 5-methylcytosine,常見於 CpG dinucleotide:

Cytosine→DNA methyltransferase, DNMT5-methylcytosine\text{Cytosine} \xrightarrow{\text{DNA methyltransferase, DNMT}} \text{5-methylcytosine}

DNA methyltransferase(DNA 甲基轉移酶)使用 SS-adenosylmethionine(SAM)作為甲基供體:

SAM+Cytosine→5-methylcytosine+SAH\ce{SAM + Cytosine -> 5-methylcytosine + SAH}

啟動子(promoter)區域若出現大量 CpG methylation,可能造成:

  • 轉錄因子無法有效結合 DNA
  • Methyl-CpG-binding proteins(甲基 CpG 結合蛋白)招募 HDAC(histone deacetylase)
  • 染色質凝縮
  • RNA polymerase II 無法有效進行轉錄

因此,DNA 甲基化可在不改變 DNA 鹼基排列的情況下,使基因表現降低或沉默,屬於典型表觀遺傳調控。


(B) Non-coding RNA, ncRNA(非編碼 RNA)—錯誤選項

非編碼 RNA 是不主要用來製造蛋白質的 RNA,許多 ncRNA 可參與基因表現調控,例如:

  • microRNA(miRNA)
  • small interfering RNA(siRNA)
  • long non-coding RNA(lncRNA)
  • small nuclear RNA(snRNA)
  • small nucleolar RNA(snoRNA)

其中 miRNA 可與目標 mRNA 互補配對,並透過 RNA-induced silencing complex(RISC)造成:

  • mRNA 降解
  • 抑制翻譯

典型流程為:

pri-miRNA→Droshapre-miRNA→DicermiRNA→RISC抑制目標 mRNA\text{pri-miRNA} \xrightarrow{\text{Drosha}} \text{pre-miRNA} \xrightarrow{\text{Dicer}} \text{miRNA} \xrightarrow{\text{RISC}} \text{抑制目標 mRNA}

siRNA 也可引導 RISC 複合體辨識並切割互補的 mRNA。某些 lncRNA 則能招募染色質修飾酵素至特定基因區域,影響組蛋白修飾與染色質結構。

因此,ncRNA 可以在不改變 DNA 序列的情況下調控基因表現,屬於表觀遺傳調控的重要相關機制。


(C) Histone modification(組蛋白修飾)—錯誤選項

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