亞洲大學 114 年 《生物化學》
第 1 題
Which of the following correctly describes the net yield of ATP equivalents during complete oxidation of one molecule of palmitate () under aerobic conditions?
(A) 96 ATP
(B) 106 ATP
(C) 129 ATP
(D) 148 ATP
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核心觀念
本題考查長鏈飽和脂肪酸 (palmitate,棕櫚酸)在有氧條件下,經由:
- 脂肪酸活化(fatty acid activation)
- -氧化(-oxidation)
- acetyl-CoA 進入檸檬酸循環(citric acid cycle, TCA cycle)
- NADH 與 經電子傳遞鏈氧化磷酸化
所產生的 ATP 總量。
本題選項採用傳統 ATP 計算法:
- NADH ATP
- ATP
- GTP ATP
解題方法
一、脂肪酸活化的代價
棕櫚酸先由 acyl-CoA synthetase(脂醯-CoA 合成酶)活化:
ATP 被轉換為 AMP,相當於消耗兩個高能磷酸鍵,因此活化成本為:
二、-氧化產物
飽和脂肪酸 的 -氧化反應,每一輪切除一個 acetyl-CoA,並產生:
- NADH
-氧化輪數公式為:
因此棕櫚酸的輪數為:
每一輪的關鍵反應依序為:
-
Acyl-CoA dehydrogenase(醯基-CoA 去氫酶)
產生 trans--enoyl-CoA 與 。 -
Enoyl-CoA hydratase(烯醯-CoA 水合酶)
加入水,形成 -hydroxyacyl-CoA。 -
-Hydroxyacyl-CoA dehydrogenase(-羥基醯-CoA 去氫酶)
產生 -ketoacyl-CoA 與 NADH。 -
Thiolase(硫解酶)
加入 CoA,切除一分子 acetyl-CoA,使脂醯-CoA 縮短兩個碳。
因此,7 輪 -氧化產生:
第 2 題
In the TCA cycle, which enzyme catalyzes a reaction that directly produces GTP (or ATP) via substrate-level phosphorylation?
(A) Isocitrate dehydrogenase
(B) -Ketoglutarate dehydrogenase
(C) Succinyl-CoA synthetase
(D) Malate dehydrogenase
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核心觀念
本題考查三羧酸循環(tricarboxylic acid cycle, TCA cycle)中,哪一步能透過**基質層級磷酸化(substrate-level phosphorylation)**直接生成高能磷酸化合物。
基質層級磷酸化是指:高能量代謝中間物直接將磷酸基轉移給 或 ,生成 或 ,不需經由電子傳遞鏈與氧化磷酸化。
TCA cycle 中唯一直接進行此反應的步驟,是:
若細胞使用 作為受體,則可生成 :
因此,關鍵酵素為 Succinyl-CoA synthetase(琥珀醯-CoA 合成酶),也稱為 succinate thiokinase(琥珀酸硫激酶)。
解題方法
先抓題幹中的兩個關鍵字:
- directly produces GTP or ATP
- via substrate-level phosphorylation
接著定位 TCA cycle 中的基質層級磷酸化步驟。TCA cycle 的順序中:
在 轉變為 的這一步, 所含的高能硫酯鍵被利用,驅動磷酸基轉移,直接生成 或 。
所以正確選項是 Succinyl-CoA synthetase。
選項分析
(A) Isocitrate dehydrogenase(異檸檬酸去氫酶)
此酵素催化:
第 3 題
Which of the following is NOT a regulatory mechanism of pyruvate dehydrogenase (PDH) complex activity?
(A) Inhibition by acetyl-CoA
(B) Phosphorylation by PDH kinase
(C) Allosteric activation by cAMP
(D) Stimulation by
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核心觀念
本題考查丙酮酸去氫酶複合體(pyruvate dehydrogenase complex, PDH complex)的反應與調控。
PDH 位於粒線體基質,負責將糖解作用產生的丙酮酸轉換為乙醯輔酶 A(acetyl-CoA),銜接糖解作用與檸檬酸循環:
PDH 複合體包含三個主要酵素:
- E1:pyruvate dehydrogenase,丙酮酸去氫酶,使用 TPP。
- E2:dihydrolipoyl transacetylase,二氫硫辛醯轉乙醯酶,使用 lipoamide 與 CoA。
- E3:dihydrolipoyl dehydrogenase,二氫硫辛醯去氫酶,使用 FAD 與 。
PDH 的活性受到能量狀態、反應產物及共價修飾調節:
- 高能量狀態:ATP、NADH、acetyl-CoA 增加,抑制 PDH。
- 低能量或收縮訊號:ADP、丙酮酸、 增加,促進 PDH 活性。
- PDH kinase 磷酸化 E1,使 PDH 失活。
- PDH phosphatase 去磷酸化 E1,使 PDH 活化。
解題方法
題目問的是「哪一項不是 PDH 複合體活性的調節機制」,因此逐一判斷各選項是否符合 PDH 的已知調控方式即可。
判斷重點有兩個:
- PDH 反應的產物是否會造成產物抑制。
- 該共價修飾或訊息分子是否直接參與 PDH 的經典調控。
選項分析
(A) Inhibition by acetyl-CoA
正確。Acetyl-CoA 是 PDH 反應的產物,會產生產物抑制;同時 acetyl-CoA 也能刺激 PDH kinase,使 PDH 經磷酸化而失活。
因此,acetyl-CoA 增加時,PDH 活性下降,屬於 PDH 的調控機制。
(B) Phosphorylation by PDH kinase
正確。PDH kinase 會磷酸化 PDH 複合體的 E1 次單元,使 PDH 失活:
第 4 題
During prolonged fasting, gluconeogenesis is critical for maintaining blood glucose. Which enzyme bypasses the irreversible step of glycolysis catalyzed by pyruvate kinase?
(A) Pyruvate carboxylase
(B) Phosphoenolpyruvate carboxykinase (PEPCK)
(C) Both A and B
(D) Fructose-1,6-bisphosphatase
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核心觀念
本題考查糖質新生(gluconeogenesis)如何繞過糖解作用(glycolysis)中由 **pyruvate kinase(丙酮酸激酶)**催化的不可逆反應。
糖解作用最後一步為:
此反應具有高度負自由能,屬於糖解作用的不可逆步驟。在長期禁食時,肝臟進行糖質新生,不能直接以同一個酵素逆向催化,因此必須使用兩個酵素分兩步繞過:
- Pyruvate carboxylase(丙酮酸羧化酶)
- Phosphoenolpyruvate carboxykinase, PEPCK(磷酸烯醇丙酮酸羧激酶)
解題方法
先定位 pyruvate kinase 所催化的反應:
糖質新生必須將 pyruvate(丙酮酸)轉回 PEP。此逆向轉換分成兩個步驟:
第一步:Pyruvate carboxylase
在粒線體中,pyruvate carboxylase 將丙酮酸羧化為 oxaloacetate(草醯乙酸):
此酵素需要:
- **Biotin(生物素)**作為二氧化碳攜帶基團
- ATP
- Acetyl-CoA作為變構活化劑
第二步:PEPCK
Oxaloacetate 再由 PEPCK 轉換為 PEP:
因此,糖質新生繞過 pyruvate kinase 的總體反應為:
重點是:pyruvate carboxylase 與 PEPCK 必須共同完成 pyruvate 至 PEP 的旁路反應,所以正確選項為「Both A and B」。
選項分析
(A) Pyruvate carboxylase
正確但不完整。
Pyruvate carboxylase 負責將 pyruvate 轉成 oxaloacetate,是繞過 pyruvate kinase 的第一步。它本身不能直接生成 PEP,因此單獨列為完整答案並不充分。
第 5 題
The pentose phosphate pathway produces for biosynthetic reactions. Which enzyme is the major regulatory point of this pathway?
(A) Transketolase
(B) Glucose-6-phosphate dehydrogenase
(C) 6-Phosphogluconate dehydrogenase
(D) Ribulose-5-phosphate isomerase
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核心觀念
本題考查「磷酸戊糖途徑(pentose phosphate pathway, PPP)」的主要調控酵素,以及其產生還原力 的關鍵步驟。
磷酸戊糖途徑可分為兩個部分:
- 氧化階段(oxidative phase)
將 氧化,產生:
- 非氧化階段(non-oxidative phase)
將五碳糖磷酸相互轉換,並依細胞需求生成 ,或轉回糖解作用的中間物 與 。
其中,氧化階段的第一步由 Glucose-6-phosphate dehydrogenase, G6PD(葡萄糖-6-磷酸去氫酶) 催化,是整條磷酸戊糖途徑的主要速率限制步驟與調控點。
反應如下:
因此,G6PD 活性直接影響磷酸戊糖途徑的通量與 生成量。
解題方法
題幹提供兩個重要線索:
- 「pentose phosphate pathway」
- 「produces for biosynthetic reactions」
判斷步驟如下:
- 先找出磷酸戊糖途徑中負責產生 的階段。
- 產生於氧化階段,而非非氧化階段。
- 氧化階段的第一個反應由 G6PD 催化。
- G6PD 是此途徑的主要調控酵素,因此選擇 Glucose-6-phosphate dehydrogenase。
氧化階段的整體反應可概括為:
其中第一步由 G6PD 催化,第二個 則由 6-phosphogluconate dehydrogenase 催化,但主要的入口調控點仍是 G6PD。
G6PD 的活性受細胞氧化還原狀態調節:
- 增加:促進 G6PD 反應,增加 生成。
- 增加:抑制 G6PD,表示細胞目前還原力充足。
- 胰島素可促進肝臟等組織表現 G6PD,配合脂肪酸與膽固醇合成需求。
選項分析
(A) Transketolase(轉酮醇酶)
錯誤。
Transketolase 屬於磷酸戊糖途徑的非氧化階段酵素,負責轉移兩個碳單位,需以 (TPP,硫胺素焦磷酸)作為輔酶。
代表性反應為:
第 6 題
Which of the following correctly describes the role of carnitine in fatty acid metabolism?
(A) It activates fatty acids for -oxidation
(B) It transports fatty acids into the mitochondrial matrix
(C) It inhibits acetyl-CoA carboxylase
(D) It is a cofactor for fatty acid synthase
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核心觀念
本題考查長鏈脂肪酸進入粒線體進行 -oxidation(-氧化)時的 carnitine shuttle(肉鹼穿梭系統)。
長鏈 fatty acyl-CoA 無法直接穿越粒線體內膜,必須先將 fatty acyl group(脂醯基)轉移至 carnitine(肉鹼)上,形成 acylcarnitine(脂醯肉鹼),再運送進入 mitochondrial matrix(粒線體基質)。
關鍵步驟如下:
-
CPT I(carnitine palmitoyltransferase I,肉鹼棕櫚醯轉移酶 I)
位於粒線體外膜,將 fatty acyl group 從 fatty acyl-CoA 轉移至 carnitine,形成 acylcarnitine。 -
Carnitine-acylcarnitine translocase(肉鹼-脂醯肉鹼轉位酶)
將 acylcarnitine 送入粒線體基質,同時將游離 carnitine 送回膜間腔。 -
CPT II(carnitine palmitoyltransferase II,肉鹼棕櫚醯轉移酶 II)
位於粒線體內膜基質側,將脂醯基轉回 CoA,重新形成 fatty acyl-CoA,接著進入 -oxidation。
概念上可表示為:
解題方法
判斷 carnitine 的功能時,先定位它在脂肪酸代謝中的位置:
- 脂肪酸先由 acyl-CoA synthetase(脂醯輔酶 A 合成酶) 活化為 fatty acyl-CoA。
- 長鏈 fatty acyl-CoA 接著透過 carnitine shuttle 進入粒線體基質。
- 進入基質後,才由 -oxidation 逐步產生 acetyl-CoA(乙醯輔酶 A)、 與 。
因此,carnitine 的主要角色是「運輸脂醯基進入粒線體基質」,不是脂肪酸活化、脂肪酸合成或直接調控 acetyl-CoA carboxylase。
選項分析
(A) It activates fatty acids for -oxidation
錯誤。
脂肪酸活化是由 acyl-CoA synthetase 催化,利用 將脂肪酸轉換成 fatty acyl-CoA:
第 7 題
In glycolysis, which enzyme catalyzes an irreversible reaction that is bypassed in gluconeogenesis by fructose-1,6-bisphosphatase?
(A) Hexokinase
(B) Phosphofructokinase-1 (PFK-1)
(C) Pyruvate kinase
(D) Aldolase
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核心觀念
本題考查糖解作用(glycolysis)與糖質新生(gluconeogenesis)之間的不可逆反應與繞道反應。
糖解作用將 glucose 分解為 pyruvate,共有三個主要不可逆步驟:
-
Hexokinase(己糖激酶)
Glucose Glucose-6-phosphate -
Phosphofructokinase-1, PFK-1(磷酸果糖激酶-1)
Fructose-6-phosphate Fructose-1,6-bisphosphate -
Pyruvate kinase(丙酮酸激酶)
Phosphoenolpyruvate, PEP Pyruvate
其中,PFK-1 所催化的反應為糖解作用的承諾步驟(committed step),反應如下:
在糖質新生中,此步驟不能直接由 PFK-1 的逆反應完成,而是由 **Fructose-1,6-bisphosphatase(果糖-1,6-雙磷酸酶,FBPase-1)**繞道:
因此,題目所描述的酵素是 PFK-1。
解題方法
看到題幹中的關鍵字:
- 「glycolysis」
- 「irreversible reaction」
- 「bypassed in gluconeogenesis」
- 「fructose-1,6-bisphosphatase」
可直接將 fructose-1,6-bisphosphatase 對應到糖解作用中被繞過的反應。
FBPase-1 作用於:
因此,其所繞過的是糖解作用中反向的:
故正確選項為:
選項分析
(A) Hexokinase
錯誤。Hexokinase 催化糖解作用的第一步:
此反應在糖質新生中由 **Glucose-6-phosphatase(葡萄糖-6-磷酸酶)**繞道:
第 8 題
Which of the following is a key allosteric activator of phosphofructokinase-1 (PFK-1)?
(A) ATP
(B) Citrate
(C) AMP
(D) NADH
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核心觀念
本題考查糖解作用(glycolysis)中磷酸果糖激酶-1(phosphofructokinase-1, PFK-1)的變構調節(allosteric regulation)。
PFK-1 催化糖解作用的關鍵步驟:
以化學式表示:
此反應具有下列特性:
- 屬於糖解作用的不可逆反應之一。
- 是糖解作用的主要速率限制步驟。
- 也是糖解作用的重要承諾步驟(committed step),因為生成的 fructose-1,6-bisphosphate 主要進入糖解作用。
- PFK-1 會依據細胞能量狀態調整活性。
當細胞 ATP 消耗增加、能量不足時,AMP 濃度上升。AMP 與 PFK-1 的變構部位結合,使酵素構形改變,提升其對 fructose-6-phosphate 的催化效率,促進糖解作用產生更多 ATP。
因此,AMP 是本題選項中 PFK-1 的關鍵變構活化劑。
解題方法
判斷 PFK-1 的變構調節物,可先掌握「細胞能量狀態」:
- 高能量狀態:ATP、citrate 增加,抑制 PFK-1。
- 低能量狀態:AMP、ADP 增加,活化 PFK-1。
- 肝臟中,fructose-2,6-bisphosphate 是非常重要的 PFK-1 活化劑,但不在本題選項內。
AMP 與 ATP、ADP 之間具有下列能量狀態關係:
當 ATP 被大量消耗時,ADP 增加;腺苷酸激酶(adenylate kinase)可促使部分 ADP 轉換為 ATP 與 AMP,使 AMP 濃度對能量不足特別敏感。AMP 因而成為細胞低能量狀態的重要訊號,直接活化 PFK-1。
選項分析
(A) ATP
ATP 是高能量狀態的指標。
雖然 ATP 是 PFK-1 反應的受質,但當 ATP 濃度很高時,也會與 PFK-1 的變構抑制部位結合,降低酵素對 fructose-6-phosphate 的親和力,使糖解作用速率下降。
第 9 題
What is the primary function of the urea cycle?
(A) To generate ATP from amino acid catabolism
(B) To detoxify ammonia by converting it to urea
(C) To synthesize nonessential amino acids
(D) To produce ketone bodies
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核心觀念
尿素循環(urea cycle,又稱 ornithine cycle)的主要功能,是將胺基酸分解產生的有毒氨()轉換成毒性較低、可溶於水的尿素(),再經血液運送至腎臟,由尿液排出。
此循環主要發生於肝細胞,分成兩個區域:
- 粒線體:形成 carbamoyl phosphate(氨甲醯磷酸)與 citrulline(瓜胺酸)。
- 細胞質:形成 argininosuccinate(精胺酸琥珀酸)、arginine(精胺酸),最後產生 urea(尿素)並再生 ornithine(鳥胺酸)。
尿素的兩個氮來源為:
- 游離氨()
- Aspartate(天門冬胺酸)
尿素循環的總反應可表示為:
因此,尿素循環是「解毒與排氮」途徑,並非產生能量的途徑。
解題方法
判斷本題的關鍵,在於掌握「amino acid catabolism(胺基酸分解)」產生氨之後,身體如何處理氨。
胺基酸進行 transamination(轉胺作用)與 oxidative deamination(氧化脫胺作用)後,會產生 。氨對中樞神經系統尤其具有毒性,因此肝臟利用尿素循環將其轉為尿素。
尿素循環的主要步驟如下:
- Carbamoyl phosphate synthetase I(CPS I,氨甲醯磷酸合成酶 I)
在粒線體內,利用氨、碳酸氫根與 2 個 ATP 形成 carbamoyl phosphate:
CPS I 必須受到 N-acetylglutamate(N-乙醯麩胺酸)活化。
- Ornithine transcarbamylase(OTC,鳥胺酸轉氨甲醯酶)
Carbamoyl phosphate 將氨甲醯基轉移給 ornithine,形成 citrulline:
- Argininosuccinate synthetase(精胺酸琥珀酸合成酶)
Citrulline 在細胞質中與 aspartate 結合,並消耗 ATP 形成 argininosuccinate:
- Argininosuccinate lyase(精胺酸琥珀酸裂解酶)
Argininosuccinate 分解為 arginine 與 fumarate:
第 10 題
Which of the following is NOT a product of the TCA cycle?
(A) NADH
(B)
(C) GTP
(D) Acetyl-CoA
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核心觀念
本題考查三羧酸循環(TCA cycle,檸檬酸循環;citric acid cycle)的反應物與產物判斷。
每 1 分子乙醯輔酶 A(acetyl-CoA)進入 TCA cycle 後,主要產生:
其中草醯乙酸(oxaloacetate)在循環末端再生,並非被消耗。乙醯輔酶 A 則是進入循環的反應物,不是 TCA cycle 的產物。
解題方法
判斷各選項是否為 TCA cycle 的產物,可依照循環中的三類重要反應:
- 氧化反應:還原 生成 NADH,還原 生成 。
- 底物層級磷酸化:由 succinyl-CoA 生成 GTP。
- 脫羧反應:產生 。
- 乙醯基進入反應:乙醯輔酶 A 與草醯乙酸結合,開始循環,因此 acetyl-CoA 屬於反應物。
TCA cycle 的關鍵步驟如下:
-
Citrate synthase(檸檬酸合成酶)
乙醯輔酶 A 在此步驟被消耗。 -
Aconitase(順烏頭酸酶)
Citrate isocitrate -
Isocitrate dehydrogenase(異檸檬酸去氫酶)
產生第 1 個 NADH 與 :
-
-Ketoglutarate dehydrogenase complex(-酮戊二酸去氫酶複合體)
產生第 2 個 NADH 與 :
-
Succinyl-CoA synthetase(琥珀醯輔酶 A 合成酶)
進行底物層級磷酸化,產生 GTP:
第 11 題
Which enzyme is defective in phenylketonuria (PKU)?
(A) Phenylalanine hydroxylase
(B) Tyrosinase
(C) Homogentisate oxidase
(D) Alkaptonuria
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核心觀念
Phenylketonuria(PKU,苯酮尿症)主要是胺基酸代謝中,**Phenylalanine(苯丙胺酸)轉變為 Tyrosine(酪胺酸)**的反應受阻。
關鍵反應為:
其中:
- **Phenylalanine hydroxylase(苯丙胺酸羥化酶,PAH)**負責催化羥化反應。
- 反應需要 **tetrahydrobiopterin(四氫生物蝶呤,)**作為輔助因子。
- PAH 缺陷時,Phenylalanine 無法有效轉為 Tyrosine,導致血中 Phenylalanine 上升,並旁路形成 Phenylpyruvate(苯丙酮酸)、Phenyllactate(苯乳酸)及 Phenylacetate(苯乙酸)等代謝物,造成「phenyl-ketone」尿液表現。
Tyrosine 同時是製造 Catecholamines、Melanin 及 Thyroid hormones 的前驅物,因此 PKU 也可能伴隨 Tyrosine 相對不足及神經發育異常。
解題方法
先判斷題目詢問的是「PKU 缺陷的酵素」。直接鎖定 Phenylalanine 代謝途徑:
催化此步驟的酵素就是 Phenylalanine hydroxylase,因此選擇 (A)。
需要區分的是,PKU 的典型病因是 PAH 缺陷;少數病例則是 代謝或再生缺陷,使 PAH 缺乏必要的輔助因子。但在選項中,唯一符合典型酵素缺陷者為 Phenylalanine hydroxylase。
第 12 題
In glycogen metabolism, which enzyme is responsible for adding glucose units to a growing glycogen chain?
(A) Glycogen phosphorylase
(B) Glycogen synthase
(C) Debranching enzyme
(D) Phosphoglucomutase
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核心觀念
本題考查肝醣合成(glycogenesis)過程中,負責將葡萄糖單位接到成長中肝醣鏈上的酵素。
肝醣合成的主要步驟如下:
- 葡萄糖先形成葡萄糖-6-磷酸(glucose-6-phosphate)。
- **Phosphoglucomutase(磷酸葡萄糖變位酶)**將葡萄糖-6-磷酸轉為葡萄糖-1-磷酸。
- 葡萄糖-1-磷酸與 UTP 形成 UDP-glucose(UDP-葡萄糖)。
- **Glycogen synthase(肝醣合成酶)**將 UDP-glucose 中的葡萄糖單位,以 糖苷鍵接到肝醣鏈末端。
- Branching enzyme(分枝酶)再建立 糖苷鍵,形成肝醣分枝。
反應可概念化表示為:
因此,題目所述「adding glucose units to a growing glycogen chain」正是 glycogen synthase 的功能。
解題方法
先判斷題目是在問:
- 肝醣合成(glycogenesis),還是
- 肝醣分解(glycogenolysis)。
題幹出現「adding glucose units」及「growing glycogen chain」,表示葡萄糖單位正被加入正在延長的肝醣鏈,屬於肝醣合成。
在肝醣合成中,直接負責延長 主鏈的酵素為 glycogen synthase,因此選擇 (B)。
選項分析
(A)Glycogen phosphorylase(肝醣磷酸化酶)—錯誤
此酵素參與肝醣分解,不是肝醣合成。它從肝醣非還原端逐一移除葡萄糖單位,利用無機磷酸進行磷酸解,主要產物為葡萄糖-1-磷酸:
第 13 題
Which of the following is a key regulatory enzyme in cholesterol biosynthesis?
(A) HMG-CoA reductase
(B) Acetyl-CoA carboxylase
(C) Fatty acid synthase
(D) Carnitine palmitoyltransferase
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核心觀念
本題考查膽固醇生合成(cholesterol biosynthesis)中的關鍵調控酵素。
膽固醇主要在肝臟等細胞的細胞質與平滑內質網中合成,主要途徑如下:
接著經過一連串反應形成:
其中, 還原為 mevalonate 的反應是膽固醇生合成的速率限制步驟(rate-limiting step),催化酵素為 HMG-CoA reductase(HMG-CoA 還原酶):
因此,HMG-CoA reductase 是膽固醇生合成最重要的調控酵素,也是降膽固醇藥物 statins(statin 類藥物)的作用標的。
解題方法
判斷本題的關鍵,是先確認各選項所屬的代謝途徑:
- 若酵素直接參與 到 mevalonate 的反應,或位於膽固醇生合成的主要調控步驟,則為正確答案。
- 若酵素屬於脂肪酸合成或脂肪酸氧化,則與本題所問的膽固醇生合成調控無關。
膽固醇生合成的主要調控點是:
故答案為 HMG-CoA reductase。
選項分析
(A) HMG-CoA reductase
正確。
HMG-CoA reductase 催化膽固醇生合成的速率限制步驟:
此酵素受到多重調控:
- 膽固醇濃度高時:抑制 HMG-CoA reductase 的合成,並促進其分解。
- SREBP(sterol regulatory element-binding protein):當細胞內膽固醇不足時,SREBP 活化,促進 HMG-CoA reductase 的基因表現。
- 磷酸化調控:AMP-activated protein kinase(AMPK)磷酸化 HMG-CoA reductase,使其活性降低;去磷酸化則活性增加。
- 藥物抑制:statins 直接抑制 HMG-CoA reductase,降低膽固醇合成。
因此,HMG-CoA reductase 是膽固醇生合成的關鍵調控酵素。
第 14 題
Which molecule is the final electron acceptor in the electron transport chain?
(A)
(B) FAD
(C)
(D) Cytochrome c
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核心觀念
本題考查粒線體電子傳遞鏈(electron transport chain, ETC)中「最終電子受體」(final electron acceptor)的定義與作用。
電子傳遞鏈位於粒線體內膜,主要由下列成分組成:
- Complex I:NADH dehydrogenase
- Complex II:succinate dehydrogenase
- Coenzyme Q(ubiquinone)
- Complex III:cytochrome complex
- Cytochrome c
- Complex IV:cytochrome c oxidase
電子由高能量電子供體逐步傳遞至低能量受體,過程中 Complex I、III、IV 將質子由粒線體基質泵入膜間腔,形成質子電化學梯度,供 ATP synthase 合成 ATP。
在電子傳遞鏈的最後一步,Complex IV 接受來自 cytochrome c 的電子,並將氧氣還原成水:
因此,氧氣 是電子傳遞鏈的最終電子受體。
解題方法
判斷「final electron acceptor」時,應尋找電子傳遞鏈末端直接接受電子、並被還原的分子。
電子傳遞的大致順序為:
其中:
- 將電子交給 Complex I。
- 將電子經由 Complex II 導入電子傳遞鏈。
- 電子經過 CoQ、Complex III 與 cytochrome c。
- Complex IV 將電子交給 。
- 結合電子與質子後生成 。
所以,位於整條電子傳遞鏈最末端且被還原的分子是 。
選項分析
(A)
錯誤。 是氧化型輔酶,主要在代謝反應中接受氫或電子而還原成 :
第 15 題
Which of the following is a ketone body?
(A) Pyruvate
(B) Acetoacetate
(C) Lactate
(D) Succinate
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核心觀念
本題考查「酮體(ketone bodies)」的定義與生成途徑。
酮體是肝臟在禁食、長時間運動或低醣狀態下,以脂肪酸分解產生的 為原料合成的水溶性燃料,主要包括:
- 乙醯乙酸(acetoacetate)
- β-羥基丁酸(β-hydroxybutyrate)
- 丙酮(acetone)
其中,乙醯乙酸是酮體生成途徑的第一個主要產物。
解題方法
判斷選項是否為酮體,直接將各物質與三種酮體比對即可。若進一步從代謝途徑判斷,酮體生成發生於肝臟粒線體:
生成的 可進行以下反應:
此反應由 β-hydroxybutyrate dehydrogenase 催化;此外,乙醯乙酸也可自發脫羧形成丙酮:
因此,選項中屬於酮體者為 acetoacetate。
選項分析
(A) Pyruvate(丙酮酸)
錯誤。Pyruvate 是糖解作用的最終產物,反應如下:
在有氧條件下,pyruvate 可由 pyruvate dehydrogenase complex 轉變為 :
第 16 題
Which vitamin is a precursor for and ?
(A) Thiamine (B₁)
(B) Riboflavin (B₂)
(C) Niacin (B₃)
(D) Pantothenic acid (B₅)
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核心觀念
本題考的是水溶性維生素與其衍生輔酶的對應關係。
維生素 B₃ 又稱 Niacin(菸鹼素),包括:
- Nicotinic acid(菸鹼酸)
- Nicotinamide/Niacinamide(菸醯胺)
Niacin 是合成下列兩種重要氧化還原輔酶的前驅物:
- :Nicotinamide adenine dinucleotide,菸醯胺腺嘌呤二核苷酸
- :Nicotinamide adenine dinucleotide phosphate,菸醯胺腺嘌呤二核苷酸磷酸
其中菸醯胺環可在氧化型與還原型之間轉換:
因此,Niacin 缺乏會影響細胞的氧化還原反應、能量代謝及還原力供應。
解題方法
本題可直接使用「維生素 B 群與輔酶」的配對記憶:
| 維生素 | 主要衍生輔酶 |
|---|---|
| B₁ Thiamine | TPP |
| B₂ Riboflavin | FMN、FAD |
| B₃ Niacin | 、 |
| B₅ Pantothenic acid | Coenzyme A |
題幹明確指出 與 ,因此對應維生素 B₃(Niacin)。
相關生合成路徑
Niacin 可透過補救途徑形成 。以 Nicotinamide 為例:
其中:
- NAMPT:Nicotinamide phosphoribosyltransferase
- NMN:Nicotinamide mononucleotide
Nicotinic acid 則可經由下列途徑生成 :
而 是由 經磷酸化形成:
第 17 題
Which of the following inhibits glycolysis and stimulates gluconeogenesis?
(A) Insulin
(B) Glucagon
(C) High ATP levels
(D) Fructose-2,6-bisphosphate
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本題考查肝臟中「醣解作用(glycolysis)」與「糖質新生作用(gluconeogenesis)」的相互調控。
兩條途徑的方向相反:
- 醣解作用:葡萄糖分解為丙酮酸,產生 ATP。
- 糖質新生作用:由乳酸、甘油、胺基酸等非醣類前驅物合成葡萄糖,消耗 ATP 與 GTP。
主要調控位點包括:
- PFK-1(phosphofructokinase-1)
- 催化:
- 是醣解作用的主要限速酵素。
- 受 AMP、fructose-2,6-bisphosphate 活化。
- 受 ATP 抑制。
- Fructose-1,6-bisphosphatase(FBPase-1)
- 催化:
- 是糖質新生作用的重要調控酵素。
- 受 fructose-2,6-bisphosphate 抑制。
- PFK-2/FBPase-2
- 負責調節 fructose-2,6-bisphosphate 濃度。
- fructose-2,6-bisphosphate 高時,促進醣解並抑制糖質新生。
- fructose-2,6-bisphosphate 低時,抑制醣解並解除糖質新生的抑制。
解題方法
判斷此題可從「升糖狀態」與「降糖狀態」切入:
- 飢餓或低血糖時,肝臟需要停止消耗葡萄糖,改為製造並釋放葡萄糖。
- 此時由 glucagon(升糖素) 啟動訊息傳遞,使醣解作用下降、糖質新生作用上升。
在肝細胞中:
PKA 磷酸化 PFK-2/FBPase-2,使其 FBPase-2 活性增加、PFK-2 活性降低,導致:
結果為:
- PFK-1 活性下降,醣解作用受抑制。
- FBPase-1 抑制解除,糖質新生作用增加。
因此最符合題幹「同時抑制醣解並促進糖質新生」的選項是 Glucagon。
選項分析
(A) Insulin(胰島素)—錯誤
胰島素在血糖升高時分泌,促進肝臟與周邊組織利用葡萄糖。
其代謝作用包括:
第 18 題
Which enzyme is responsible for fixing in the Calvin cycle?
(A) Rubisco
(B) PEP carboxylase
(C) Pyruvate carboxylase
(D) Carbonic anhydrase
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核心觀念
Calvin cycle(卡爾文循環)是植物在葉綠體基質中進行的碳同化途徑,主要分為三階段:
- 碳固定(carbon fixation)
- 還原反應(reduction)
- 受體再生(regeneration of acceptor)
本題問的是第一階段:將無機碳 固定至有機分子中的酵素。
Calvin cycle 中的碳受體是五碳糖 ribulose-1,5-bisphosphate(RuBP,核酮糖-1,5-二磷酸)。催化 與 RuBP 反應的酵素是 Rubisco,全名為 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase。
其羧化反應可表示為:
不穩定的六碳中間物會迅速分解成兩分子三碳的 3-phosphoglycerate(3-PGA,3-磷酸甘油酸)。因此,Rubisco 所催化的這一步就是 Calvin cycle 的「 固定」步驟。
解題方法
判斷關鍵在於辨認「Calvin cycle 的 固定酵素」。
Calvin cycle 的特徵是:
- 的受體為 RuBP。
- 反應產物首先形成 3-PGA。
- 主要催化酵素為 Rubisco。
只要題目出現「fixing in the Calvin cycle」,就應直接聯想到:
因此正確酵素為 Rubisco。
選項分析
(A) Rubisco:正確
Rubisco 是 Calvin cycle 碳固定反應的核心酵素,催化 加成至 RuBP:
Rubisco 同時具有 carboxylase(羧化酶)與 oxygenase(加氧酶)活性;在 作為受質時,進行 Calvin cycle 的碳固定。
(B) PEP carboxylase:錯誤
PEP carboxylase(磷酸烯醇丙酮酸羧化酶)催化:
第 19 題
Which of the following is a product of anaerobic glycolysis in muscle cells?
(A) Ethanol
(B) Lactate
(C) Acetyl-CoA
(D) Oxaloacetate
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核心觀念
本題考查肌肉細胞在缺氧或供氧不足時的無氧糖解作用(anaerobic glycolysis)。
糖解作用(glycolysis)在細胞質中將葡萄糖分解為兩分子丙酮酸(pyruvate):
在有氧條件下,丙酮酸可進入粒線體,轉換為乙醯輔酶 A(acetyl-CoA),再進入檸檬酸循環。肌肉細胞缺氧時,電子傳遞鏈無法有效再生 ,糖解作用中的甘油醛-3-磷酸去氫酶反應會因缺乏 而受阻。
因此,丙酮酸由乳酸去氫酶(lactate dehydrogenase, LDH)還原為乳酸(lactate),同時將 氧化回 :
再生的 可繼續支持糖解作用,使肌肉在短時間內維持 ATP 生成。
解題方法
判斷「肌肉細胞的無氧糖解作用產物」時,沿著糖解作用的末端判斷:
題目問的是無氧糖解作用在肌肉細胞中的產物。肌肉細胞的典型無氧代謝終產物是乳酸(lactate),因此選擇 Lactate。
此反應的重點不是額外產生大量 ATP,而是透過 轉換為 ,維持糖解作用持續進行。每分子葡萄糖經糖解作用淨產生 2 分子 ATP,並形成 2 分子乳酸。
選項分析
- (A) Ethanol(乙醇)
錯誤。乙醇是酵母菌及部分微生物進行酒精發酵(alcoholic fermentation)的產物。其路徑為:
第 20 題
Which hormone stimulates lipolysis in adipose tissue?
(A) Insulin
(B) Glucagon
(C) Leptin
(D) Adiponectin
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核心觀念
本題考查脂肪組織的脂解作用(lipolysis)及其荷爾蒙調控。
脂肪細胞儲存的主要形式是三酸甘油酯(triacylglycerol, TAG)。當身體需要能量時,TAG 會被分解為游離脂肪酸(free fatty acids, FFA)與甘油,供周邊組織使用。
脂解作用的主要酵素依序為:
-
Adipose triglyceride lipase(ATGL,脂肪三酸甘油酯脂解酶)
-
Hormone-sensitive lipase(HSL,荷爾蒙敏感性脂解酶)
-
Monoacylglycerol lipase(MGL,單酸甘油酯脂解酶)
本題的關鍵是辨認「促進脂解」與「抑制脂解」的荷爾蒙。
解題方法
判斷脂肪組織是否進行脂解,可由荷爾蒙所代表的生理狀態切入:
- Insulin(胰島素)升高:表示進食後、血糖與能量充足,促進脂肪合成並抑制脂解。
- Glucagon(升糖素)升高:表示禁食或低血糖,促進分解代謝與脂肪動員。
- Leptin(瘦體素)與 Adiponectin(脂聯素):主要為脂肪組織分泌的代謝調節因子,並非本題所指的急性脂解主要刺激荷爾蒙。
Glucagon 與脂肪細胞膜上的 G protein-coupled receptor(G 蛋白偶聯受體)結合後,主要訊息傳遞如下:
其中,Perilipin 是包覆脂滴表面的蛋白質。Perilipin 被磷酸化後,可使脂解酵素更容易接觸脂滴中的 TAG;PKA 磷酸化 HSL 後,則提高 HSL 的脂解活性。
因此,正確答案為 Glucagon。
選項分析
(A) Insulin
錯誤。
第 21 題
A Lineweaver-Burk plot for an enzyme shows parallel lines for reactions with and without a competitive inhibitor. Which conclusion is correct?
(A) The inhibitor binds only to the ES complex
(B) The inhibitor changes the but not
(C) The experiment was performed incorrectly
(D) The inhibitor is noncompetitive
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核心觀念
本題考查酵素抑制作用在 **Lineweaver–Burk plot(雙倒數圖)**上的判讀。
Michaelis–Menten 方程式為:
取倒數後得到 Lineweaver–Burk 方程式:
其中:
- 斜率:
- 軸截距:
- 軸截距:
不同抑制型態在雙倒數圖上的特徵如下:
| 抑制型態 | 抑制劑結合對象 | 圖形特徵 | ||
|---|---|---|---|---|
| Competitive inhibition(競爭性) | 游離酵素 | 不變 | 增加 | 共用 軸截距 |
| Uncompetitive inhibition(反競爭性) | 酵素-受質複合體 | 降低 | 降低 | 平行線 |
| Noncompetitive inhibition(非競爭性) | 與 均可結合 | 降低 | 不變 | 共用 軸截距 |
| Mixed inhibition(混合型) | 與 ,親和力不同 | 通常降低 | 改變 | 線條相交但不在典型截距 |
解題方法
題幹指出:加入與未加入競爭性抑制劑的反應,其 Lineweaver–Burk plot 呈現平行線。
平行線表示斜率不變:
這是 **uncompetitive inhibition(反競爭性抑制)**的典型圖形。
反競爭性抑制劑只與 結合:
並形成無催化活性的複合體:
其結果是:
第 22 題
Which amino acid is MOST likely to act as a nucleophile in an enzyme's active site?
(A) Valine
(B) Serine
(C) Proline
(D) Leucine
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核心觀念
本題考查胺基酸側鏈在酵素活性中心中的親核性(nucleophilicity)。
親核基團具有可供出的電子對,能攻擊反應物上的親電子中心(electrophilic center),形成新的共價鍵。酵素催化中常見的親核性胺基酸包括:
- Serine(絲胺酸):側鏈含羥基
- Cysteine(半胱胺酸):側鏈含硫氫基
- Lysine(離胺酸):側鏈含胺基
- Histidine(組胺酸):咪唑環可參與質子轉移與親核攻擊
- Tyrosine(酪胺酸):酚羥基在去質子化後可具親核性
其中,Serine 的羥基可在活性中心中被去質子化,形成較具親核性的烷氧基:
接著 可攻擊受質上的親電子中心,例如蛋白質胜肽鍵羰基碳,形成共價酵素中間體。這是 **serine protease(絲胺酸蛋白酶)**的重要催化機制。
解題方法
判斷胺基酸是否適合擔任親核試劑,應觀察其側鏈是否具有:
- 可供出的孤電子對;
- 能直接攻擊受質的反應性官能基;
- 適合在酵素活性中心中進行去質子化或質子轉移。
四個選項中,只有 Serine 的側鏈具有游離羥基:
在酵素活性中心內,鄰近的 Histidine 可作為一般鹼(general base),協助 Serine 去除羥基上的質子,使氧原子帶負電:
生成的 具有較高電子密度,能攻擊受質的羰基碳:
因此,Serine 最符合「在酵素活性中心中擔任親核試劑」的條件。
選項分析
(A) Valine(纈胺酸)
Valine 的側鏈為異丙基:
第 23 題
An enzyme with a of and of is studied. At , what is the reaction velocity () as a fraction of ?
(A)
(B)
(C)
(D)
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核心觀念
本題考查 Michaelis–Menten 酵素動力學,以及反應速度 與最大反應速度 的關係。
Michaelis–Menten 方程式為:
因此,若要求「 作為 的分率」,直接將方程式除以 :
其中:
- :基質濃度
- :Michaelis constant,米氏常數
- :催化常數,代表酵素在基質飽和時每秒可催化的反應次數
- :最大反應速度,關係為
本題只問 ,所以不需要知道總酵素濃度,也不需要實際計算 ; 為此小題的非必要資訊。
解題方法
已知:
代入分率公式:
換算成百分比:
因此,在 時,反應速度約為 的 。
選項分析
- (A) :正確。
第 24 題
Which type of enzyme inhibition is overcome by increasing substrate concentration?
(A) Competitive
(B) Noncompetitive
(C) Uncompetitive
(D) Mixed
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核心觀念
本題考的是可逆性酵素抑制(reversible enzyme inhibition)中,不同抑制類型對底物濃度 的反應。
基本酵素反應為:
其中 為游離酵素、 為底物、 為酵素—底物複合體、 為產物。
競爭型抑制劑會與底物競爭酵素的活性部位:
增加底物濃度後,底物可提高與酵素結合的機會,排擠抑制劑,因此能克服競爭型抑制。
Michaelis–Menten 方程式為:
競爭型抑制的特徵是:
- 表觀 增加
- 不變
- 增加 可達到原本的
競爭型抑制下的速率方程式可表示為:
其中:
抑制劑使達到半最大速率所需的底物濃度增加,但在底物濃度足夠高時,底物仍可完全競爭抑制劑。
解題方法
題幹問「哪一種酵素抑制可藉由增加底物濃度克服」,判斷重點在於:
- 抑制劑是否與底物競爭同一個活性部位。
- 增加底物後, 是否仍可恢復。
- 若抑制劑降低 ,單純增加底物濃度便無法完全克服。
只有競爭型抑制符合「 不變,增加 可克服」的條件。
選項分析
(A) Competitive(競爭型抑制)—正確
競爭型抑制劑與底物競爭酵素活性部位。當底物濃度增加時,底物與酵素碰撞及結合的機會提高,可減少抑制劑對酵素的占用。
其動力學特徵為:
但:
因此,足夠高的底物濃度可克服競爭型抑制。此項正確。
(B) Noncompetitive(非競爭型抑制)—錯誤
純非競爭型抑制劑可同時與游離酵素 及酵素—底物複合體 結合,抑制劑不必占據底物的活性部位。
其典型特徵為:
第 25 題
Which of the following is NOT a mechanism of enzyme regulation?
(A) Allosteric modulation
(B) Covalent modification
(C) Proteolytic cleavage
(D) Denaturation at high temperatures
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核心觀念
本題考查「酵素活性調控(enzyme regulation)」的主要機制。酵素調控是指細胞透過特定、受控制的方式,改變酵素的活性、數量或作用時機,以配合代謝需求。
常見機制包括:
- Allosteric modulation(變構調節):調節分子結合酵素的變構位點,改變酵素構形與活性。
- Covalent modification(共價修飾):透過可逆或不可逆的化學修飾改變酵素活性。
- Proteolytic cleavage(蛋白水解切割):切除特定胜肽片段,使酵素由前驅物轉變為活化型。
- 改變酵素量:例如調控基因轉錄、翻譯與酵素降解。
題目詢問「哪一項不是酵素調控機制」,因此要找出不屬於細胞主動調節、而是造成酵素結構破壞的現象。
解題方法
逐一判斷各選項是否能透過特定生物機制,有目的地調整酵素活性:
- 若是透過結合調節位點、化學修飾或蛋白水解活化,屬於酵素調控。
- 若是因非特異性物理因素造成蛋白質結構破壞,導致酵素失活,則不屬於正常的酵素調控機制。
高溫會破壞酵素的氫鍵、離子鍵、疏水作用等非共價作用,使蛋白質的三維構形改變,活性部位失去正確形狀,此現象稱為 denaturation(變性)。這是酵素受到傷害後的失活,不是細胞用來精確調節代謝的機制。
選項分析
(A) Allosteric modulation
正確屬於酵素調控機制。
變構調節分子會結合酵素的變構位點,而非直接占據活性部位,進而改變酵素的構形與催化能力。
變構調節可分為:
- Allosteric activator(變構活化劑):穩定活性構形,使酵素活性增加。
- Allosteric inhibitor(變構抑制劑):穩定低活性構形,使酵素活性降低。
例如糖解作用中的 phosphofructokinase-1, PFK-1(磷酸果糖激酶-1),會受到 ATP、AMP 及 fructose-2,6-bisphosphate 的變構調節:
- ATP 高時,代表細胞能量充足,抑制 PFK-1。
- AMP 高時,代表能量不足,活化 PFK-1。
- Fructose-2,6-bisphosphate 可強烈活化 PFK-1,促進 fructose-6-phosphate 轉變為 fructose-1,6-bisphosphate。
因此,(A) 是典型的酵素調控方式。
(B) Covalent modification
正確屬於酵素調控機制。
共價修飾是指在酵素特定胺基酸殘基上加入或移除化學基團,以改變酵素活性、位置或與其他蛋白質的交互作用。
最常見的形式是 phosphorylation/dephosphorylation(磷酸化/去磷酸化):
- **Protein kinase(蛋白激酶)**利用 ATP 將磷酸基團轉移至酵素上的 Ser、Thr 或 Tyr 殘基。
- **Protein phosphatase(蛋白磷酸酶)**移除酵素上的磷酸基團。
一般反應可表示為:
第 26 題
A protease that cleaves peptide bonds on the carboxyl side of aromatic amino acids has which type of specificity?
(A) Absolute
(B) Group
(C) Linkage
(D) Stereochemical
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核心觀念
本題考查酵素的「受質特異性(substrate specificity)」分類。
題幹指出:某蛋白酶會切斷芳香族胺基酸羧基側的胜肽鍵。芳香族胺基酸包括:
- Phenylalanine(苯丙胺酸,Phe,F)
- Tyrosine(酪胺酸,Tyr,Y)
- Tryptophan(色胺酸,Trp,W)
也就是說,酵素不是只辨認一種特定胺基酸,而是能辨認具有共同結構特徵的「一群」胺基酸,因此屬於群特異性(group specificity)。
切割位置可表示為:
若酵素辨認 Tyr 的羧基側,則切斷的是 Tyr 與其右側胺基酸之間的胜肽鍵:
「羧基側」也稱為該胺基酸殘基的 C-terminal side。
解題方法
判斷酵素特異性時,先看題幹描述的是:
- 單一特定受質或單一特定胺基酸;
- 具有共同結構特徵的一群受質;
- 特定類型的化學鍵;
- 特定立體構型。
本題的關鍵字是 aromatic amino acids。題幹不是指定單一胺基酸,而是指出一群具有芳香環的胺基酸,因此符合 group specificity。
典型例子是 chymotrypsin(胰凝乳蛋白酶)。Chymotrypsin 的受質結合口袋具有疏水性芳香族結構,可容納 Phe、Tyr、Trp 等芳香族胺基酸,因此主要在這些胺基酸的羧基側切割胜肽鍵。
其辨識重點可概念化為:
選項分析
(A) Absolute(絕對特異性)
錯誤。絕對特異性表示酵素只作用於一種特定受質,或只辨認一種特定分子。例如某酵素只作用於 glucose,而不作用於其他己糖。
本題的酵素可辨認多種芳香族胺基酸,包括 Phe、Tyr、Trp,並非只對單一胺基酸具有專一性。
(B) Group(群特異性)
第 27 題
Which of the following is a coenzyme derived from vitamin B6 (pyridoxine)?
(A) Thiamine pyrophosphate
(B) Flavin adenine dinucleotide
(C) Pyridoxal phosphate
(D) Biotin
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核心觀念
本題考查「維生素與其衍生輔酶」的對應關係。
維生素 B6(vitamin B6)包括 pyridoxine(吡哆醇)、pyridoxal(吡哆醛)與 pyridoxamine(吡哆胺)等形式。其主要活性輔酶形式為:
PLP 主要參與胺基酸代謝,作為胺基轉移、脫羧、消除及消旋反應的輔酶。其中最典型的反應是 transamination(轉胺反應)。
在 aminotransferase(胺基轉移酶)作用下,PLP 與酵素活性部位的 lysine(離胺酸)形成 Schiff base(席夫鹼),再與胺基酸底物形成外部席夫鹼,協助穩定反應中間物。
典型反應為:
因此,本題的關鍵是辨認「vitamin B6 的輔酶形式」為 PLP。
解題方法
採用「維生素—輔酶配對」直接判斷:
- Vitamin B1 Thiamine pyrophosphate(TPP)
- Vitamin B2 Flavin adenine dinucleotide(FAD)
- Vitamin B6 Pyridoxal phosphate(PLP)
- Vitamin B7 Biotin
題幹指定為 vitamin B6 的衍生輔酶,對照後可確定選項(C)。
選項分析
(A)Thiamine pyrophosphate,TPP(硫胺素焦磷酸)
錯誤。TPP 是 vitamin B1(thiamine,硫胺素)的活性輔酶形式,不是 vitamin B6 的衍生物。
TPP 參與醣類代謝中的醛酮酸脫羧反應,例如 pyruvate dehydrogenase complex(丙酮酸去氫酶複合體)及 -ketoglutarate dehydrogenase complex(-酮戊二酸去氫酶複合體)。其重要結構為 thiazolium ring(噻唑鎓環),可穩定脫羧反應形成的碳負離子中間物。
(B)Flavin adenine dinucleotide,FAD(黃素腺嘌呤二核苷酸)
錯誤。FAD 是 vitamin B2(riboflavin,核黃素)的衍生輔酶。
FAD 主要參與氧化還原反應,可在氧化態 FAD 與還原態 之間轉換:
例如 succinate dehydrogenase(琥珀酸去氫酶)以 FAD 作為輔酶,催化:
第 28 題
A reaction with a negative is best described as:
(A) Endergonic
(B) Exergonic
(C) At equilibrium
(D) Spontaneous in the reverse direction
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核心觀念
本題考查 Gibbs free energy change(吉布斯自由能變化,)與反應方向、反應自發性的關係。
在固定溫度、壓力及反應物濃度條件下:
- :反應釋放自由能,稱為 exergonic reaction(放能反應),正向反應在熱力學上具有自發性。
- :反應需要輸入自由能,稱為 endergonic reaction(吸能反應)。
- :系統達到 equilibrium(平衡),正逆反應速率相等,沒有淨反應方向。
相關公式為:
其中 是標準生化自由能變化, 是氣體常數, 是絕對溫度, 是反應商。題目直接給定實際條件下 ,因此可直接判斷正向反應為放能且具有熱力學自發性。
解題方法
判斷 的正負號:
表示正向反應進行時,系統的 Gibbs free energy 降低,釋出的自由能可用於推動其他細胞反應。因此此反應是 exergonic(放能反應),正確答案為 (B)。
須注意,「自發」只代表熱力學上有利,並不代表反應速率一定很快。反應速率仍受 activation energy(活化能)及 enzyme(酵素)催化影響。
選項分析
(A) Endergonic
錯誤。Endergonic reaction(吸能反應)的特徵是:
第 29 題
Which of the following is a zymogen?
(A) Trypsin
(B) Trypsinogen
(C) Chymotrypsin
(D) Pepsin
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核心觀念
本題考查 zymogen(酶原、酵素原) 的定義與消化酵素的活化機制。
Zymogen 是指:
以「不具催化活性或活性極低」的前驅形式合成,經特定蛋白酶切除一段胜肽後,轉變為具有活性的酵素。
此機制可避免蛋白酶在胰臟或胃黏膜細胞內過早活化,造成自身組織的蛋白質被分解。
蛋白酶原的活化通常涉及特定胜肽鍵水解:
本題選項皆與蛋白質消化有關,判斷重點在於:該名稱代表的是「未活化前驅物」還是「已具有活性的成熟酵素」。
解題方法
依序辨認各選項是否為活化前的酵素原:
- 名稱以 -ogen 結尾,通常表示酵素原。
- trypsinogen(胰蛋白酶原) 經活化後形成 trypsin。
- chymotrypsinogen(胰凝乳蛋白酶原) 經活化後形成 chymotrypsin。
- pepsinogen(胃蛋白酶原) 經活化後形成 pepsin。
胰蛋白酶的活化路徑如下:
腸腔中的 enteropeptidase(腸激酶) 先切割 trypsinogen,使其形成少量 trypsin;接著 trypsin 可再活化更多 trypsinogen,形成級聯反應:
因此,trypsinogen 是酵素原。
選項分析
(A) Trypsin
Trypsin(胰蛋白酶)是已經活化的蛋白水解酵素,能切割蛋白質或多肽中 Lys(離胺酸)與 Arg(精胺酸)羧基側的胜肽鍵。
它是 trypsinogen 活化後的成熟酵素:
因此 Trypsin 不是 zymogen。
第 30 題
Which enzyme class catalyzes oxidation-reduction reactions?
(A) Oxidoreductases
(B) Transferases
(C) Hydrolases
(D) Lyases
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核心觀念
酵素依所催化的反應類型可分為六大類。其中,專門催化氧化還原反應(oxidation-reduction reactions)的酵素稱為 氧化還原酵素(oxidoreductases)。
氧化還原反應的本質是電子轉移,常伴隨下列變化:
- 氧化:失去電子、失去氫,或增加氧。
- 還原:獲得電子、獲得氫,或減少氧。
一般形式可表示為:
其中 被氧化, 被還原。常見電子或氫的受體包括 、、 等。
常見的 oxidoreductases 包括:
- Dehydrogenases(脫氫酵素)
- Oxidases(氧化酵素)
- Reductases(還原酵素)
- Peroxidases(過氧化物酵素)
解題方法
題幹直接問:「哪一類酵素催化氧化還原反應?」
判斷關鍵是辨認酵素分類名稱:
- Oxidoreductases:催化氧化還原反應。
- Transferases:催化官能基轉移。
- Hydrolases:利用水進行鍵的水解。
- Lyases:以非水解、非氧化還原方式切斷或形成鍵,常形成雙鍵。
因此,直接依照酵素分類的定義判斷,正確選項為 Oxidoreductases。
選項分析
(A) Oxidoreductases:正確
Oxidoreductases(氧化還原酵素)催化電子、氫原子或氧化態的轉移,涉及氧化與還原反應。
例如乳酸脫氫酵素(lactate dehydrogenase, LDH)催化:
此反應中,lactate 被氧化為 pyruvate,而 被還原為 ,因此 LDH 屬於 oxidoreductases。
(B) Transferases:錯誤
第 31 題
Which of the following conditions increases the rate of glycolysis in muscle cells?
(A) High ATP concentration
(B) Low AMP concentration
(C) High citrate levels
(D) High AMP concentration
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核心觀念
本題考查肌肉細胞中「糖解作用(glycolysis)」的能量狀態調控,關鍵酵素是磷酸果糖激酶-1(phosphofructokinase-1, PFK-1)。
糖解作用的重要限速步驟為:
PFK-1 催化糖解作用的承諾步驟,受到細胞能量狀態的變構調控:
- ATP 高濃度:表示能量充足,抑制 PFK-1,降低糖解作用。
- AMP 高濃度:表示 ATP 消耗、細胞能量不足,活化 PFK-1,提高糖解作用。
- Citrate(檸檬酸)高濃度:通常表示粒線體內代謝物充足,可增強 ATP 對 PFK-1 的抑制作用,降低糖解作用。
AMP 上升是肌肉細胞需要快速產生 ATP 的訊號,因此會促進葡萄糖分解。
解題方法
判斷糖解作用速率時,先找出 PFK-1 的變構調節物,再判斷該物質代表「能量充足」或「能量不足」。
肌肉收縮時大量消耗 ATP,ATP 可經由 adenylate kinase(腺苷酸激酶)反應維持能量平衡:
因此,即使 ATP 只下降一部分,AMP 也會明顯增加。AMP 接著活化 PFK-1,使:
這一步加速後,糖解作用整體速率上升,協助肌肉快速生成 ATP。
選項分析
第 32 題
What is the primary function of the Cori cycle?
(A) To convert ammonia into urea
(B) To recycle lactate from muscles into glucose in the liver
(C) To oxidize fatty acids in muscle tissue
(D) To produce ketone bodies from acetyl-CoA
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核心觀念
本題考查 **Cori cycle(科里循環、乳酸循環)**的主要功能。
Cori cycle 是指:
- 骨骼肌在缺氧或高強度運動時,進行無氧糖解作用。
- 葡萄糖經糖解作用形成丙酮酸(pyruvate)。
- 丙酮酸經乳酸脫氫酶(lactate dehydrogenase, LDH)還原成乳酸(lactate)。
- 乳酸經血液運送至肝臟。
- 肝臟將乳酸氧化回丙酮酸,再經糖質新生作用(gluconeogenesis)合成葡萄糖。
- 葡萄糖釋放回血液,供肌肉再次使用。
關鍵反應如下:
肌肉中:
此反應可再生 ,使無氧糖解作用得以持續進行,並產生少量 ATP。
肝臟中:
因此,Cori cycle 的核心功能是「將肌肉產生的乳酸送至肝臟,轉換成葡萄糖,再供肌肉利用」。
解題方法
判斷此題的切入點是辨識 Cori cycle 的循環物質:
接著:
其中肌肉端的關鍵酵素是乳酸脫氫酶(LDH);肝臟端則透過糖質新生作用完成乳酸再利用。
糖質新生的部分關鍵步驟包括:
- 丙酮酸 草醯乙酸(oxaloacetate):丙酮酸羧化酶(pyruvate carboxylase)
- 草醯乙酸 磷酸烯醇丙酮酸(phosphoenolpyruvate, PEP):PEP 羧激酶(PEP carboxykinase, PEPCK)
- PEP 經糖質新生途徑生成葡萄糖
所以,本題正確描述必須同時包含:
- 乳酸
- 肌肉
- 肝臟
- 葡萄糖再生
符合這四項的是選項 B。
選項分析
(A) To convert ammonia into urea
錯誤。將氨轉換成尿素是 **urea cycle(尿素循環)**的功能,主要發生於肝臟。
尿素循環的主要反應場所是肝細胞粒線體與細胞質,關鍵中間物包括:
第 33 題
Which amino acid is commonly involved in covalent catalysis?
(A) Alanine
(B) Cysteine
(C) Glycine
(D) Phenylalanine
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核心觀念
本題考查酵素催化機轉中的 共價催化(covalent catalysis)。
共價催化是指酵素的特定胺基酸側鏈先以親核基團攻擊受質,使酵素與受質之間形成短暫的共價鍵,產生 共價酵素—受質中間體(covalent enzyme–substrate intermediate),再經後續反應分解並釋放產物。
常參與共價催化的胺基酸包括:
- Cysteine(半胱胺酸):,可形成具親核性的 thiolate(硫醇負離子,)
- Serine(絲胺酸):
- Lysine(離胺酸):
- Histidine(組胺酸):咪唑基
- Aspartate、Glutamate:
本題選項中,只有 Cysteine 具有適合進行共價催化的高反應性硫醇基。
解題方法
判斷共價催化胺基酸的關鍵,是觀察側鏈是否具有能攻擊受質的 親核官能基(nucleophilic functional group)。
Cysteine 的側鏈為:
在酵素活性位中,鄰近的 Histidine 常先接受硫醇基上的質子,使其轉變為反應性較高的 thiolate:
接著, 作為親核試劑攻擊受質上的親電子中心,形成共價中間體:
此共價中間體降低反應活化能,使受質能經由較容易的反應路徑轉化為產物。完成催化後,酵素與受質之間的共價鍵被水解或經轉移反應斷裂,酵素恢復原本狀態。
第 34 題
A reaction with a high value indicates:
(A) High enzyme efficiency
(B) Low substrate affinity
(C) High
(D) Irreversible inhibition
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核心觀念
本題考查酵素動力學中的 Michaelis–Menten 方程式與 (Michaelis constant,米氏常數)。
酵素催化反應可表示為:
其中:
- :游離酵素(enzyme)
- :受質(substrate)
- :酵素—受質複合體
- :產物(product)
Michaelis–Menten 方程式為:
當反應速率達到最大速率的一半時:
此時受質濃度即為 :
在基礎生化題目中, 通常用來反映酵素對受質的親和力:
- 小:低濃度受質即可達到半最大速率,代表受質親和力高。
- 大:需要較高濃度受質才能達到半最大速率,代表受質親和力低。
更嚴謹地說, 是表觀親和力指標,不一定完全等同於解離常數 ;但在一般考試判斷中,可採用「 越大,受質親和力越低」的原則。
解題方法
題幹指出反應具有 high value。直接套用定義:
- 是酵素反應速率達到 時所需的受質濃度。
- 越高,表示需要越高的受質濃度才能達到半最大速率。
- 這表示酵素與受質的結合較不容易,受質親和力較低。
因此正確敘述為 Low substrate affinity。
選項分析
(A) High enzyme efficiency
錯誤。
酵素效率通常以催化效率(catalytic efficiency)表示:
第 35 題
Which of the following is NOT a feature of enzyme active sites?
(A) Hydrophobic pockets
(B) Flexible structure
(C) High substrate specificity
(D) Permanent covalent binding to substrate
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核心觀念
本題考查酵素活性部位(enzyme active site)的結構特徵與催化機轉。
活性部位是酵素分子中負責:
- 辨認並結合受質(substrate)
- 提供適當的化學微環境
- 降低反應活化能(activation energy)
- 促進受質轉變為產物
的局部區域。
活性部位通常具有下列特性:
- 含有適合受質結合的立體形狀與化學基團。
- 可形成疏水區、氫鍵、離子鍵及凡得瓦力等作用。
- 具有高度但非絕對的受質專一性(substrate specificity)。
- 並非完全僵硬固定,而是可因受質結合產生構形改變,稱為誘導契合(induced fit)。
- 酵素與受質通常以暫時性的非共價作用結合;即使某些酵素採用共價催化,也只是反應中間階段的暫時性共價鍵。
因此,本題要找的是「不是」活性部位特徵的敘述。
解題方法
判斷各選項是否符合酵素活性部位的基本概念:
- 若選項描述活性部位具有適當的化學環境、受質專一性或動態構形,屬於正確特徵。
- 若選項表示酵素與受質形成永久性、不可逆的結合,則與酵素可重複催化反應的本質矛盾。
酵素在反應中可表示為:
其中 為酵素、 為受質、 為酵素—受質複合體、 為產物。反應完成後,酵素會釋放產物並恢復可進行下一次催化的狀態。
選項分析
(A) Hydrophobic pockets
正確。
許多活性部位具有疏水口袋(hydrophobic pockets),可容納受質中的非極性基團,例如脂肪族側鏈或芳香族環。
疏水作用有助於:
- 將受質定位在正確方向。
- 排除水分子,形成適合反應的局部環境。
- 增強酵素與受質之間的結合。
- 協助穩定過渡態(transition state)。
例如,胰凝乳蛋白酶(chymotrypsin)的活性部位具有疏水性結合口袋,能偏好結合含有大型芳香族側鏈的受質。因此,疏水口袋是活性部位常見的結構特徵。
(B) Flexible structure
正確。
活性部位不是完全僵硬的結構。受質靠近或結合後,酵素可能發生局部構形變化,使活性部位更貼合受質,這種現象稱為誘導契合(induced fit)。
誘導契合可帶來下列效果:
- 增加酵素與受質的接觸面積。
- 將催化基團排列至適當位置。
- 使受質接近正確的反應方向。
- 穩定反應過渡態,降低活化能。
第 36 題
During DNA replication, the lagging strand is synthesized discontinuously as Okazaki fragments. Which enzyme is responsible for removing RNA primers and replacing them with DNA?
(A) DNA polymerase III
(B) DNA polymerase I
(C) DNA ligase
(D) Primase
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核心觀念
本題考查 DNA 複製時,後隨股(lagging strand)之岡崎片段(Okazaki fragments)的 RNA 引子(RNA primer)移除與 DNA 補換機制。
DNA 聚合酶無法從零開始合成 DNA,必須先由引子酶(primase)合成短 RNA 引子,提供可延伸的 -OH。後隨股因合成方向與複製叉前進方向相反,必須分段合成:
- **Primase(引子酶)**合成 RNA primer。
- **DNA polymerase III(DNA 聚合酶 III)**由引子開始延伸,形成 Okazaki fragment。
- **DNA polymerase I(DNA 聚合酶 I)**移除 RNA primer,並以 DNA 核苷酸填補缺口。
- **DNA ligase(DNA 連接酶)**封閉相鄰 DNA 片段之間的缺口,形成完整磷酸二酯鍵。
本題所問的「移除 RNA primers 並以 DNA 取代」,在原核生物 DNA 複製的經典考法中,指的是 DNA polymerase I 的功能。
DNA polymerase I 同時具有:
- DNA 聚合酶活性:合成 DNA。
- 外切核酸酶活性:校對。
- 外切核酸酶活性:移除位於前方的 RNA primer。
解題方法
抓住題幹中的兩個動作:
- Removing RNA primers
- Replacing them with DNA
能同時完成「移除 RNA」與「補上 DNA」的酵素,是 DNA polymerase I。
在細菌中,DNA polymerase I 以其 exonuclease activity 從 RNA primer 的 端逐步移除核糖核苷酸;同時利用 DNA polymerase activity,以鄰近 DNA 鏈的 -OH 作為起點,填入 DNA 核苷酸:
完成後,片段之間仍可能只剩下 nick,即糖—磷酸骨架上的單一缺口,最後由 DNA ligase 使用 ATP 或 NAD 提供能量,催化缺口封合。
選項分析
(A) DNA polymerase III
錯誤。
DNA polymerase III 是細菌主要的複製酵素,負責快速延伸 DNA 新生鏈,包括後隨股 Okazaki fragments 的合成。它可由 RNA primer 的 -OH 開始添加 DNA 核苷酸,但不負責移除 RNA primer。
其主要功能是:
第 37 題
A mutation in the TATA box of a eukaryotic promoter would most directly affect:
(A) Translation initiation
(B) Transcription termination
(C) Binding of RNA polymerase II
(D) Splicing efficiency
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核心觀念
本題考查真核生物啟動子(promoter)中 TATA box 的功能,以及 RNA polymerase II(RNA 聚合酶 II)轉錄起始複合體的形成。
TATA box 是真核生物許多基因啟動子中的保守 DNA 序列,通常位於轉錄起始點上游約 至 個鹼基的位置,常見共識序列為:
其主要功能如下:
- 由 TBP(TATA-binding protein,TATA 結合蛋白) 辨識並結合。
- TBP 是 TFIID(轉錄因子 IID) 的一部分。
- TFIID 結合後,協助其他一般轉錄因子進行組裝,包括 TFIIA、TFIIB、TFIIF、TFIIE 與 TFIIH。
- 形成 RNA polymerase II 的 pre-initiation complex(轉錄前起始複合體)。
- 定位 RNA polymerase II,使其能在正確的轉錄起始點開始合成 RNA。
因此,TATA box 發生突變時,最直接受到影響的是轉錄起始複合體的組裝,進而降低 RNA polymerase II 被正確招募與定位於啟動子的能力。
解題方法
判斷本題的關鍵是先確認 TATA box 位於基因表現的哪一階段。
基因表現主要可區分為:
TATA box 位於 DNA 上的啟動子,作用時間是在 轉錄起始階段,不是翻譯、轉錄終止或 RNA 剪接階段。
轉錄起始的簡化流程為:
因此,TATA box 突變會使 TBP 的辨識與結合受到影響,導致 RNA polymerase II 無法有效形成或穩定維持轉錄起始複合體。在本題選項中,最符合的是 RNA polymerase II 的結合受到影響。
選項分析
(A) Translation initiation(翻譯起始)錯誤
翻譯起始發生在 mRNA 被核糖體辨識之後,主要涉及:
- 核糖體小次單元
- 起始 tRNA
- 起始因子
- 真核生物 mRNA 的 5′ cap
- 起始密碼子 AUG
第 38 題
Which post-translational modification is most commonly involved in signaling protein degradation?
(A) Phosphorylation
(B) Ubiquitination
(C) Glycosylation
(D) Acetylation
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核心觀念
本題考查「以何種轉譯後修飾(post-translational modification, PTM)標記蛋白質,使其進入降解途徑」。
真核細胞中,最典型的蛋白質降解標記是將多個 ubiquitin(泛素)共價接到標的蛋白質上,形成 polyubiquitin chain(多聚泛素鏈)。其中以 Lys48-linked polyubiquitin chain 最常與蛋白質送入 26S proteasome(26S 蛋白酶體) 降解有關。
泛素化反應包含三種主要酵素:
- E1:ubiquitin-activating enzyme(泛素活化酵素)
利用 ATP 活化 ubiquitin。 - E2:ubiquitin-conjugating enzyme(泛素接合酵素)
接收活化的 ubiquitin。 - E3:ubiquitin ligase(泛素連接酵素)
辨認特定標的蛋白質,並促進 ubiquitin 接到標的蛋白質的 lysine(Lys)殘基上。
反應可概括為:
因此,本題的關鍵是辨認「直接作為蛋白質降解標籤」的修飾。
解題方法
看到題幹中的 signaling protein degradation,應立即聯想到:
細胞訊息傳遞中,許多 signaling proteins(訊息傳遞蛋白)會先因磷酸化等修飾產生 degron(降解辨識序列),再被特定 E3 ubiquitin ligase 辨認並泛素化;但真正將蛋白質標記為蛋白酶體降解對象的主要修飾,是 ubiquitination。
選項分析
(A) Phosphorylation(磷酸化)
磷酸化是將 phosphate group(磷酸基)接到 serine、threonine 或 tyrosine 殘基上,通常由 protein kinase(蛋白質激酶)催化:
第 39 題
The wobble hypothesis explains:
(A) DNA polymerase proofreading
(B) Degeneracy in the genetic code
(C) Ribosome translocation
(D) tRNA anticodon flexibility
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核心觀念
本題考查 wobble hypothesis(擺動假說) 與遺傳密碼退化性的關係。
遺傳密碼具有「退化性(degeneracy)」:多個不同的 codon(密碼子)可以編碼同一種 amino acid(胺基酸)。例如:
- 、 都編碼 phenylalanine(苯丙胺酸)
- 、、、 都編碼 alanine(丙胺酸)
Crick 提出的 wobble hypothesis 說明:codon 與 anticodon 配對時,並非三個鹼基位置都具有相同嚴格程度的配對限制。
在翻譯過程中:
- mRNA codon 方向為
- tRNA anticodon 方向為
- codon 的第 3 個鹼基,會與 anticodon 的第 1 個鹼基配對
- 這個位置的配對較具彈性,稱為 wobble position(擺動位置)
因此,一個 tRNA 有時可以辨認數個只在第 3 個鹼基不同的 codon,造成多個 codon 共用同一種 amino acid 的現象。
解題方法
判斷本題的關鍵,是分辨「wobble hypothesis 所直接說明的機制」與「該機制所造成的結果」。
wobble hypothesis 的核心敘述為:
tRNA anticodon 的某一位置具有彈性,使單一 tRNA 能與多個 codon 配對。
這種配對彈性使得:
進而造成:
後者就是 degeneracy in the genetic code(遺傳密碼的退化性)。
因此,本題問「wobble hypothesis explains」時,標準考試答案是它解釋了為何遺傳密碼具有退化性,選 (B)。
wobble 配對的具體機轉
標準 Watson–Crick 配對主要為:
- A–U
- G–C
但在 wobble position,可能出現較寬鬆的配對。例如 anticodon 的第 1 個鹼基為 inosine(次黃嘌呤,I)時,可與 codon 第 3 個位置的:
- U
- C
- A
配對。
因此,含有 inosine 的單一 tRNA anticodon,可以辨認多個 codon。這種機制可減少細胞需要製造的不同 tRNA 種類。
需要注意的是,wobble 並不是說整個 codon 都能任意配對,而是特別發生在:
第 40 題
Which repair mechanism fixes thymine dimers caused by UV radiation?
(A) Base excision repair
(B) Nucleotide excision repair
(C) Mismatch repair
(D) Non-homologous end joining
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核心觀念
紫外線(UV radiation)會使 DNA 中相鄰的兩個 thymine(胸腺嘧啶)形成共價鍵,產生 thymine dimer(胸腺嘧啶二聚體),最常見的是 cyclobutane pyrimidine dimer(CPD,環丁烷嘧啶二聚體)。
此種 DNA 損傷具有兩項重要特徵:
- 會使 DNA 雙股螺旋產生明顯變形。
- 會阻礙 DNA polymerase(DNA 聚合酶)正常讀取模板,造成複製停滯。
因此,細胞主要利用能辨認 DNA 螺旋結構變形的 nucleotide excision repair(NER,核苷酸切除修復)處理 thymine dimers。
解題方法
判斷 DNA 修復機制時,先依「損傷型態」分類:
- 單一鹼基受損、但 DNA 雙股螺旋變形不明顯:通常是 base excision repair(BER)。
- 大型、造成 DNA 螺旋扭曲的損傷:通常是 nucleotide excision repair(NER)。
- DNA 複製後出現錯配鹼基:是 mismatch repair(MMR)。
- DNA 雙股斷裂:是 non-homologous end joining(NHEJ)。
Thymine dimer 是由 UV 造成相鄰嘧啶之間的共價交聯,屬於會造成 DNA 螺旋嚴重扭曲的 bulky DNA lesion(大型 DNA 損傷),所以選擇 NER。
NER 的基本步驟如下:
- 損傷辨認:辨認 DNA 雙股螺旋的結構變形。
- 局部解旋:由 helicase(解旋酶)打開損傷區域附近的 DNA。
- 雙側切割:endonuclease(內切核酸酶)在受損片段兩側切割。
- 移除受損寡核苷酸:切除包含 thymine dimer 的一小段單股 DNA。
- DNA 填補:DNA polymerase 以未受損的另一股 DNA 為模板合成新片段。
- 缺口封合:DNA ligase(DNA 連接酶)封閉最後的磷酸二酯鍵缺口。
在真核細胞中,NER 會涉及 XPC、TFIIH、XPB、XPD、XPA、ERCC1-XPF 與 XPG 等蛋白;其中 TFIIH 複合體具有解旋功能,ERCC1-XPF 與 XPG 負責受損片段兩側的切割。
選項分析
(A) Base excision repair(鹼基切除修復)—錯誤
BER 主要修復小型、局部的鹼基損傷,例如:
- deamination(脫胺)
- oxidation(氧化)
- alkylation(烷基化)
- uracil 誤置於 DNA 中
第 41 題
What is the function of the factor in bacterial transcription?
(A) Terminate transcription
(B) Initiate ribosome binding
(C) Recognize promoter sequences
(D) Proofread RNA synthesis
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核心觀念
本題考查細菌轉錄(bacterial transcription)中 factor(σ 因子)的功能。
細菌 RNA polymerase(RNA 聚合酶)由核心酵素(core enzyme)與 σ 因子結合形成完整酵素(holoenzyme)。σ 因子的主要作用,是使 RNA 聚合酶能辨認特定的 promoter(啟動子)序列,進而將轉錄起始位置定位於正確位置。
細菌啟動子通常包含兩個重要保守區域:
- region:常見序列接近 TTGACA
- region:又稱 Pribnow box,常見序列接近 TATAAT
σ 因子會與這些啟動子區域接觸,使 RNA 聚合酶定位於轉錄起始點附近,促進 DNA 局部解鏈並開始 RNA 合成。轉錄開始後,σ 因子的作用會逐漸減弱並與核心 RNA 聚合酶分離,核心酵素繼續進行延長作用(elongation)。
因此,σ 因子的核心功能是「辨認啟動子」,而非直接催化 RNA 鏈的延長反應。
解題方法
判斷此題可抓住一個關鍵配對:
細菌 RNA polymerase 的核心酵素本身具有 RNA 合成能力,但對不同基因的啟動子辨識能力不足。加入特定 σ 因子後,RNA polymerase holoenzyme 能辨識特定啟動子,完成轉錄起始(initiation)。
所以只要看到「σ 因子」與「promoter recognition」的配對,即可判定正確答案為 (C)。
選項分析
(A) Terminate transcription
錯誤。
轉錄終止主要由 terminator(終止子)序列及相關終止機制負責,例如:
- -dependent termination:由 factor(ρ 因子)參與
- -independent termination:形成 RNA hairpin(髮夾結構)並伴隨一段 U-rich sequence
σ 因子主要在轉錄起始階段發揮作用,不是負責終止轉錄的主要因子。
(B) Initiate ribosome binding
錯誤。
核糖體與 mRNA 的結合屬於 translation initiation(翻譯起始),不是 transcription initiation(轉錄起始)。
在細菌中,ribosome binding site(核糖體結合位點)通常是位於起始密碼子上游的 Shine–Dalgarno sequence(Shine–Dalgarno 序列)。
第 42 題
Alternative splicing allows:
(A) One gene to produce multiple proteins
(B) DNA replication without primers
(C) Ribosomes to switch reading frames
(D) tRNAs to recognize multiple codons
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核心觀念
本題考查真核生物的 alternative splicing(選擇性剪接)。
真核生物的基因通常先轉錄形成含有 exon(外顯子) 與 intron(內含子) 的前驅信使 RNA(pre-mRNA)。經過 RNA 剪接後,內含子被移除,外顯子重新連接形成成熟 mRNA,才能進入細胞質進行轉譯。
選擇性剪接是指同一個 pre-mRNA 的外顯子可採取不同組合,例如:
- 納入某一個外顯子
- 排除某一個外顯子
- 使用不同的 5′ splice site 或 3′ splice site
- 使不同外顯子彼此互斥
因此,同一個基因可產生多種不同序列的成熟 mRNA,進一步轉譯成多種蛋白質。
剪接反應主要由 spliceosome(剪接體) 完成,涉及 snRNPs(小核核糖核蛋白),如 U1、U2、U4、U6、U5。剪接過程會辨識:
- 5′ splice site:通常為 GU
- branch point:含有關鍵腺嘌呤(A)
- 3′ splice site:通常為 AG
其核心結果是:不同 mRNA 剪接形式 → 不同蛋白質產物。
解題方法
判斷本題的關鍵,是辨認各選項所描述的現象是否屬於「RNA 剪接」。
題幹問:
Alternative splicing allows:
意思是「選擇性剪接可以使什麼事情發生?」
選擇性剪接發生在 轉錄完成後、轉譯開始前,作用對象是 pre-mRNA。它透過改變外顯子的組合,使同一個基因產生不同成熟 mRNA,最後形成不同蛋白質。
因此,正確敘述應是「一個基因產生多種蛋白質」。
選項分析
(A) One gene to produce multiple proteins
正確。
選擇性剪接可使同一個基因的 pre-mRNA 產生多種成熟 mRNA。由於不同成熟 mRNA 含有不同的外顯子組合,其開放閱讀框與胺基酸序列可能不同,轉譯後便形成多種蛋白質異構體(protein isoforms)。
可概括為:
這種機制能增加蛋白質多樣性,而不必讓基因組中存在同等數量的不同基因。
(B) DNA replication without primers
錯誤。
第 43 題
Which enzyme adds telomeric repeats to chromosome ends?
(A) DNA polymerase
(B) Telomerase
(C) Topoisomerase II
(D) Helicase
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核心觀念
本題考查真核生物染色體末端的複製問題,以及端粒(telomere)與端粒酶(telomerase)的功能。
真核生物線性染色體末端具有端粒,由重複性的 DNA 序列組成。以脊椎動物為例,端粒主要含有重複序列:
每次 DNA 複製後,線性染色體末端都面臨「末端複製問題」(end-replication problem):DNA polymerase 只能沿著 方向合成 DNA,且必須依賴既有的 RNA primer。當複製叉接近線性染色體末端時,後隨股最末端的 RNA primer 被移除後,缺乏足夠的上游 端供 DNA polymerase 延伸,因此無法完整填補最末端的 DNA。
端粒酶(telomerase)負責補回這些端粒重複序列,維持染色體末端長度。
端粒酶是一種核糖核蛋白酵素(ribonucleoprotein),主要包含:
- 端粒酶逆轉錄酶(telomerase reverse transcriptase, TERT):具有 reverse transcriptase 活性。
- 端粒酶 RNA(telomerase RNA, TER):提供合成端粒 DNA 所需的 RNA 模板。
端粒酶利用自身攜帶的 RNA 作為模板,延伸染色體 DNA 的 端,接著由一般 DNA polymerase 合成互補股,完成端粒的維持。
解題方法
題幹的關鍵字是:
adds telomeric repeats to chromosome ends
意思是「將端粒重複序列加到染色體末端」。只要辨認出題目在問「端粒延長」的專一酵素,即可直接判定為 Telomerase。
其作用順序如下:
- 端粒酶辨認染色體末端的端粒序列。
- 端粒酶以自身的 RNA 作為模板,延伸染色體的 端。
- 端粒酶轉位至新形成的 端,重複添加端粒重複序列。
- RNA primer 形成後,DNA polymerase 延伸互補股。
- RNA primer 被移除,末端保留具有保護作用的端粒結構。
因此,真正能「直接添加 telomeric repeats」的酵素是端粒酶,而非一般 DNA 複製酵素或 DNA 拓撲結構調節酵素。
選項分析
(A) DNA polymerase
錯誤。
DNA polymerase 是真核生物重要的 DNA 複製酵素,主要參與:
第 44 題
The Shine-Dalgarno sequence is important for:
(A) Eukaryotic transcription initiation
(B) Prokaryotic translation initiation
(C) RNA splicing
(D) Protein folding
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核心觀念
Shine-Dalgarno sequence(Shine-Dalgarno 序列)是原核生物 mRNA 上、位於起始密碼子 AUG 上游的一段核苷酸序列,主要功能是協助核糖體定位翻譯起始位置。
其核心機轉為:
- 原核生物的小核糖體次單元為 30S ribosomal subunit(30S 核糖體次單元)。
- 30S 次單元中的 16S rRNA 含有與 Shine-Dalgarno sequence 互補的序列。
- 兩者進行鹼基互補配對,使 AUG 被正確定位於核糖體的 **P site(P 位點)**附近。
- 隨後,帶有起始胺基酸的 initiator tRNA,即 ,與 AUG 配對,完成原核生物翻譯起始。
因此,Shine-Dalgarno sequence 參與的是:
解題方法
判斷關鍵在於辨認 Shine-Dalgarno sequence 所屬的生物過程。
- 「Shine-Dalgarno」是原核生物 mRNA 的核糖體結合序列。
- 它透過與 16S rRNA 配對,協助翻譯起始。
- 題目選項中只有「Prokaryotic translation initiation」同時符合原核生物與翻譯起始兩項特徵。
所以正確選項為 (B)。
選項分析
(A) Eukaryotic transcription initiation
錯誤。真核生物轉錄起始主要由 RNA polymerase、一般轉錄因子及啟動子共同完成。真核啟動子常見的調控序列包括 TATA box,而非 Shine-Dalgarno sequence。
此外:
- transcription(轉錄)是 DNA RNA;
- translation(翻譯)是 mRNA protein(蛋白質)。
Shine-Dalgarno sequence 作用於翻譯起始,不是轉錄起始。
(B) Prokaryotic translation initiation
正確。Shine-Dalgarno sequence 位於原核生物 mRNA 的起始密碼子 AUG 上游,與 30S 核糖體次單元中的 16S rRNA 互補配對,協助核糖體精確定位翻譯起始點
第 45 題
What is the function of aminoacyl-tRNA synthetases?
(A) Charge tRNAs with correct amino acids
(B) Synthesize rRNA
(C) Degrade misfolded proteins
(D) Modify histones
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核心觀念
**Aminoacyl-tRNA synthetases(胺醯基-tRNA 合成酶)**的主要功能,是將正確的胺基酸接到相對應的 tRNA 上,形成 aminoacyl-tRNA(胺醯基-tRNA),此過程稱為 tRNA charging(tRNA 充電)。
反應分為兩個主要步驟:
1. 胺基酸活化
胺基酸先與 ATP 反應,形成 aminoacyl-AMP(胺醯基腺苷酸)中間物:
其中胺基酸的羧基被活化,並消耗 ATP 的兩個高能磷酸鍵。隨後焦磷酸 通常會再被水解,推動反應向前進行:
2. 胺醯基轉移至 tRNA
活化的 aminoacyl-AMP 將胺醯基轉移至正確 tRNA 的 3′-端腺苷酸殘基,形成 aminoacyl-tRNA:
胺基酸會以酯鍵連接在 tRNA 末端的腺苷酸上。之後核糖體利用此 aminoacyl-tRNA 進行蛋白質合成。
解題方法
本題直接詢問 aminoacyl-tRNA synthetases 的功能,判斷重點是:
- 是否負責辨認正確的胺基酸與 tRNA。
- 是否催化胺基酸接到 tRNA 上。
- 是否參與翻譯作用中的 tRNA 充電步驟。
Aminoacyl-tRNA synthetases 不直接催化胜肽鍵形成,而是先完成「正確胺基酸—正確 tRNA」的配對。這個步驟位於蛋白質翻譯開始前的 tRNA 充電階段,是維持遺傳訊息正確性的關鍵。
部分 aminoacyl-tRNA synthetases 具有 editing site(校正位點),能移除錯誤接上的胺基酸,提升蛋白質翻譯的準確性。
選項分析
(A) Charge tRNAs with correct amino acids
第 46 題
Which component is NOT part of the eukaryotic transcription initiation complex?
(A) TBP
(B) TFIIH
(C) Sigma factor
(D) Mediator
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核心觀念
本題考查真核生物(eukaryote)與原核生物(prokaryote)在轉錄起始(transcription initiation)時所需轉錄因子的差異。
真核生物 RNA polymerase II(RNA 聚合酶 II)無法單獨辨識啟動子(promoter),必須與一般轉錄因子(general transcription factors)、Mediator(介接體)及其他調控蛋白共同形成轉錄起始複合體(transcription initiation complex)。
真核轉錄起始複合體的重要成員包括:
- TBP(TATA-binding protein,TATA 結合蛋白):屬於 TFIID 的核心成分,負責辨識 TATA box。
- TFIIH:具有 DNA 解旋酶(helicase)及蛋白激酶(kinase)活性,參與啟動子 DNA 解旋,並磷酸化 RNA polymerase II 的 C-terminal domain(CTD)。
- Mediator(介接體):連接上游調控蛋白與 RNA polymerase II 及一般轉錄因子,協助調節轉錄起始。
- Sigma factor(σ 因子):原核生物 RNA polymerase 的轉錄起始因子,並非真核生物轉錄起始複合體的成員。
解題方法
判斷本題的關鍵,是先辨認各選項所屬的生物系統:
- 若選項屬於真核 RNA polymerase II 的一般轉錄因子或轉錄共調控因子,則可列入真核轉錄起始複合體。
- 若選項是原核生物 RNA polymerase 的專一性因子,則不屬於真核轉錄起始複合體。
- 逐一比對後,唯一屬於原核轉錄系統的選項就是 Sigma factor。
原核生物的 RNA polymerase 核心酵素需要結合 σ 因子形成 holoenzyme(全酵素),由 σ 因子協助辨識啟動子上的 −35 與 −10 區域。真核生物則由 TBP、TFIIA、TFIIB、TFIID、TFIIE、TFIIF、TFIIH 等一般轉錄因子協同完成起始。
因此,答案為 Sigma factor。
選項分析
(A) TBP
TBP 是 TATA-binding protein(TATA 結合蛋白),是真核轉錄起始的重要蛋白。
TBP 通常位於 TFIID 複合體中,能辨識啟動子上的 TATA box。TBP 結合 DNA 後會造成 DNA 彎曲,協助其他一般轉錄因子依序組裝,並定位 RNA polymerase II。
因此,TBP 是真核轉錄起始複合體的成員,本選項錯誤。
(B) TFIIH
TFIIH 是真核 RNA polymerase II 轉錄起始所需的一般轉錄因子。
TFIIH 具有兩項重要功能:
- DNA 解旋功能:利用 ATP 依賴性解旋酶活性,使啟動子附近的雙股 DNA 局部解開,形成 transcription bubble(轉錄泡)。
第 47 題
What does reverse transcriptase produce from an RNA template?
(A) cDNA
(B) rRNA
(C) siRNA
(D) mRNA
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核心觀念
本題考查「反轉錄(reverse transcription)」的產物與方向。
一般基因表現的轉錄是:
反轉錄則方向相反,由 RNA 作為模板合成 DNA:
負責催化此反應的酵素為反轉錄酶(reverse transcriptase),具有 RNA-dependent DNA polymerase activity,能以 RNA 為模板合成互補 DNA(complementary DNA, cDNA)。
解題方法
看到題幹中的關鍵字:
- RNA template:RNA 模板
- reverse transcriptase:反轉錄酶
- produce:產生
即可判斷這是「以 RNA 為模板製造 DNA」的反轉錄作用。第一步先合成與 RNA 模板互補的 DNA 鏈,形成 RNA–DNA hybrid;之後反轉錄酶中的 RNase H 活性可降解 RNA 模板,再合成第二股 DNA,最終形成雙股 cDNA。
因此反轉錄的核心方向為:
這也是 retrovirus(逆轉錄病毒)將 RNA 基因體轉換成 DNA,並進一步整合至宿主基因體的關鍵步驟。
選項分析
- (A) cDNA:正確
第 48 題
The polyA tail of eukaryotic mRNA is important for:
(A) Transcription initiation
(B) Nuclear export and stability
(C) Ribosome binding
(D) Splicing
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核心觀念
本題考查真核生物訊息 RNA(eukaryotic mRNA) 端 poly(A) tail(多聚腺苷酸尾) 的功能。
真核生物前驅 mRNA(pre-mRNA)完成轉錄後, 端會先經切割,再由 poly(A) polymerase(多聚腺苷酸聚合酶,PAP) 加上約數十至數百個腺苷酸(A),形成 poly(A) tail。此尾端會與 poly(A)-binding protein(PABP,多聚腺苷酸結合蛋白) 結合,參與:
- mRNA 由細胞核輸出至細胞質
- 保護 mRNA,增加穩定性並延長半衰期
- 促進翻譯起始效率
- 作為 mRNA 降解前的調控標的
其中最符合本題的主要功能是 nuclear export and stability(核輸出與穩定性)。
解題方法
判斷各選項是否屬於 poly(A) tail 的直接或主要功能:
- 轉錄起始主要由啟動子(promoter)、轉錄因子與 RNA polymerase II 決定。
- 真核 mRNA 的核輸出與穩定性和 端 poly(A) tail、PABP 密切相關。
- 核糖體辨認 mRNA 時,主要依賴 cap、翻譯起始因子與起始密碼子,而非直接辨認 poly(A) tail。
- RNA splicing 主要在 poly(A) tail 加上之前完成,依靠 spliceosome 處理 intron。
因此答案選 (B)。
選項分析
(A) Transcription initiation
錯誤。
Transcription initiation(轉錄起始)發生於基因的 promoter。RNA polymerase II 與一般轉錄因子先辨認 promoter,形成轉錄起始複合體,才開始合成 pre-mRNA。
poly(A) tail 是在 RNA 合成接近完成、 端經切割後才加上的成熟化修飾,位於轉錄後處理階段,不參與轉錄起始。
(B) Nuclear export and stability
正確。
poly(A) tail 與 PABP 結合後,可協助成熟 mRNA 的核輸出,使 mRNA 能由細胞核運送至細胞質進行翻譯。
此外,poly(A) tail 可保護 mRNA 的 端,降低外切核酸酶(exonuclease)直接降解的機會。
第 49 題
Which process requires a primer to begin synthesis?
(A) Transcription
(B) Translation
(C) DNA replication
(D) Protein folding
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核心觀念
本題考查不同生物合成作用是否需要 primer(引子) 才能開始合成。
Primer 是一段預先存在的核酸片段,提供游離的 -OH,讓聚合酶能夠將新的核苷酸接到其 端。DNA polymerase(DNA 聚合酶)本身無法從零開始合成 DNA,必須依賴 primer。
在 DNA replication(DNA 複製)中:
- Helicase(解旋酶)解開 DNA 雙股。
- Primase(引子酶)先合成一小段 RNA primer。
- DNA polymerase 以 RNA primer 提供的 -OH 為起點,延伸新的 DNA 鏈。
- DNA polymerase 後續移除 RNA primer 並補上 DNA,DNA ligase(DNA 連接酶)封閉缺口。
因此,DNA 複製需要 primer 才能開始 DNA 鏈的合成。
解題方法
判斷關鍵在於:負責合成核酸的聚合酶是否能進行 de novo synthesis(從頭合成)。
- DNA polymerase 不能從零開始合成,必須先有 primer。
- RNA polymerase(RNA 聚合酶)能辨識 promoter(啟動子)後,直接以第一個核糖核苷酸開始 RNA 合成,不需要 primer。
- Translation(轉譯)是核糖體依據 mRNA 合成蛋白質,起始依靠 initiator tRNA(起始 tRNA),這不是核酸 primer。
- Protein folding(蛋白質摺疊)是多肽鏈形成三維構形的過程,不涉及核酸鏈聚合。
選項分析
(A) Transcription(轉錄)
錯誤。
轉錄由 RNA polymerase 進行。RNA polymerase 結合 promoter 後,直接加入第一個 ribonucleotide(核糖核苷酸),形成 RNA 鏈的 端,屬於 de novo synthesis,因此不需要 primer。
其基本反應可表示為:
其中 NTP 可為 ATP、GTP、CTP 或 UTP。
(B) Translation(轉譯)
錯誤。
第 50 題
What is the function of chaperone proteins?
(A) Degrade misfolded proteins
(B) Assist protein folding
(C) Modify DNA structure
(D) Synthesize RNA
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核心觀念
Chaperone proteins(伴護蛋白、分子伴護蛋白)主要功能是協助新生 polypeptide(多肽鏈)及部分變性蛋白質形成正確的三維結構,避免蛋白質錯誤摺疊與聚集。
蛋白質摺疊的大致流程為:
Chaperone 不會成為成熟蛋白質的永久組成部分,也不會直接提供摺疊後的胺基酸序列;其作用是提供適當的摺疊環境,遮蔽暴露的疏水區域,降低錯誤蛋白質彼此聚集的機會。
常見例子包括:
- Hsp70:辨認新生多肽鏈上暴露的疏水區域,透過 ATP 結合與水解反覆進行結合、釋放,協助蛋白質摺疊。
- Hsp60/GroEL-GroES:形成類似圓筒狀的摺疊腔室,使蛋白質在隔離環境中完成摺疊。
因此,本題考的是「分子伴護蛋白與蛋白質摺疊」的基本功能。
解題方法
判斷關鍵在於掌握 chaperone 的定義:
若題幹詢問「協助蛋白質正確形成構形、避免聚集、幫助新生蛋白質成熟」,即應聯想到 chaperone proteins。
在細胞內,蛋白質品質管制可概括為:
Chaperone 可參與錯誤摺疊蛋白質的重新摺疊,並協助其被辨認及送往 proteasome(蛋白酶體)等降解系統;但「協助摺疊」才是其核心功能。
選項分析
(A) Degrade misfolded proteins
錯誤。Chaperone 本身的主要工作不是分解錯誤摺疊蛋白質。無法修復的蛋白質通常由 ubiquitin-proteasome system(泛素-蛋白酶體系統)或 lysosome(溶小體)負責降解。
Chaperone 可以參與蛋白質品質管制,協助將無法正確摺疊的蛋白質送往降解途徑,但不等於其主要功能是直接降解蛋白質。
第 51 題
Which enzyme is defective in xeroderma pigmentosum?
(A) DNA glycosylase
(B) Nucleotide excision repair enzyme
(C) DNA ligase
(D) Telomerase
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核心觀念
本題考查紫外線造成 DNA 損傷後的修復機制,以及 xeroderma pigmentosum(XP,著色性乾皮症)所涉及的酵素缺陷。
紫外線,尤其是 UV-B,會使相鄰胸腺嘧啶形成 胸腺嘧啶二聚體(thymine dimer),屬於 DNA 螺旋結構扭曲的大型損傷。細胞主要利用 核苷酸切除修復(nucleotide excision repair, NER) 移除這類損傷。
NER 的主要步驟如下:
- 辨識 DNA 損傷:NER 蛋白辨認由 thymine dimer 造成的 DNA 螺旋扭曲。
- 局部解旋:由 helicase 蛋白打開受損區域附近的雙股 DNA。
- 雙側切割:endonuclease 在受損核苷酸的兩側切開 DNA。
- 移除受損片段:含有 thymine dimer 的一小段寡核苷酸被移除。
- 填補缺口:DNA polymerase 依據未受損的模板股合成新 DNA。
- 封閉缺口:DNA ligase 封合最後的磷酸二酯鍵。
XP 是一群 NER 基因發生突變的遺傳疾病,患者無法有效修復紫外線造成的 DNA 損傷,因此具有嚴重光敏感、皮膚色素異常,並大幅增加皮膚癌風險。
解題方法
先判斷損傷類型:
- 紫外線造成 thymine dimer。
- Thymine dimer 會使 DNA 雙股螺旋產生空間扭曲。
- 具明顯 DNA 結構扭曲的大型損傷,應由 nucleotide excision repair 處理。
因此,本題應選擇負責 NER 的修復酵素,而非處理單一鹼基損傷、DNA 缺口封合或端粒維持的酵素。
選項分析
(A) DNA glycosylase
錯誤。DNA glycosylase 主要參與 鹼基切除修復(base excision repair, BER)。
BER 處理的是較小、局部的鹼基損傷,例如:
- 脫胺造成的異常鹼基
- 氧化損傷
- 烷基化鹼基
- uracil 誤出現在 DNA 中
DNA glycosylase 會切斷受損鹼基與去氧核糖之間的 N-glycosidic bond,留下 apurinic/apyrimidinic site(AP site),再由 AP endonuclease、DNA polymerase 與 DNA ligase 完成修復。
第 52 題
RNA interference (RNAi) involves:
(A) siRNA-mediated mRNA degradation
(B) rRNA processing
(C) tRNA modification
(D) mRNA capping
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核心觀念
本題考查 **RNA interference(RNAi,RNA 干擾)**的定義與作用機轉。RNAi 是由小型非編碼 RNA 引導的基因沉默作用,主要透過互補鹼基配對辨識標的 mRNA,抑制其轉譯或促進其降解,因而降低特定基因的表現量。
典型的 **siRNA(small interfering RNA,小干擾 RNA)**機轉如下:
- 雙股 RNA 經由 Dicer(一種 RNase III 型核酸內切酶)切割成約 21–23 個核苷酸的 siRNA。
- siRNA 被裝載至 RISC(RNA-induced silencing complex,RNA 誘導沉默複合體)。
- siRNA 的其中一股作為 guide strand(引導股),與標的 mRNA 進行互補鹼基配對。
- RISC 中的 Argonaute(Ago)蛋白切割標的 mRNA,促使 mRNA 快速降解,導致基因沉默。
若以 miRNA 為主,則常因不完全互補而抑制轉譯並促進 mRNA 去腺苷化與降解;但本題選項明確指出 siRNA,核心作用即為 siRNA 導引的 mRNA 降解。
解題方法
判斷 RNAi 的關鍵,是辨認它屬於「轉錄後基因沉默」機制。題目中的四個選項分別涉及:
- siRNA 對 mRNA 的作用
- rRNA 的加工
- tRNA 的修飾
- mRNA 5′端加帽
其中只有第一項描述 RNAi 的主要功能。RNAi 作用的直接標的為特定序列的 mRNA,作用結果是 mRNA 被切割降解或轉譯受到抑制。
選項分析
(A) siRNA-mediated mRNA degradation
正確。siRNA 與標的 mRNA 具有高度互補性,裝載於 RISC 後,由 Argonaute 蛋白辨識並切割 mRNA。切割後的 mRNA 片段會進一步被核酸酶降解,造成特定基因的表現降低。
因此,RNAi 的典型結果就是 siRNA-mediated mRNA degradation(siRNA 介導的 mRNA 降解)。
(B) rRNA processing
第 53 題
The lac operon is repressed when:
(A) Lactose is present
(B) Glucose is absent
(C) Glucose is present
(D) cAMP levels are high
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核心觀念
本題考查 Escherichia coli(大腸桿菌)乳糖操縱組(lac operon)的雙重調控:
- 負調控(negative regulation):由 lacI 基因產生的 repressor(阻遏蛋白)控制。
- 正調控(positive regulation)與分解代謝物抑制(catabolite repression):由 cAMP–CAP/CRP 系統控制。
lac operon 包含結構基因:
- lacZ:-galactosidase(-半乳糖苷酶)
- lacY:透乳糖酶(permease)
- lacA:transacetylase(轉乙醯酶)
其功能是使細菌利用乳糖作為碳源。
解題方法
判斷 lac operon 是否被有效表現,需同時考慮「乳糖」與「葡萄糖」:
- 乳糖不存在:repressor 結合 operator,阻止 RNA polymerase 轉錄。
- 乳糖存在:乳糖轉化形成 allolactose(異乳糖),與 repressor 結合,使其無法穩定結合 operator,解除負調控。
- 葡萄糖缺乏:adenylate cyclase(腺苷酸環化酶)活性上升,使 ATP 轉為 cAMP;cAMP 與 CAP/CRP 結合後,促進 RNA polymerase 結合 promoter。
- 葡萄糖存在:細胞內 cAMP 濃度下降,CAP/CRP 無法有效活化轉錄,形成 catabolite repression。
因此,「葡萄糖存在」會使 lac operon 的轉錄受到抑制,正確選項為 (C)。
選項分析
(A) Lactose is present
錯誤。乳糖存在時,會形成 allolactose。Allolactose 與 lac repressor 結合,使 repressor 脫離 operator,解除負調控,因此乳糖本身是 lac operon 的誘導物。
第 54 題
Which modification occurs to eukaryotic mRNA after transcription?
(A) 5' capping
(B) Polyadenylation
(C) Splicing
(D) All of the above
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核心觀念
本題考查真核生物前體信使 RNA(pre-mRNA)轉錄後的加工修飾(post-transcriptional processing)。真核基因由 RNA polymerase II 轉錄出的初級轉錄產物,通常仍含有 intron(內含子),必須經過多項加工才能形成成熟 mRNA:
- 5' capping(5'端加帽)
- Polyadenylation(3'端多聚腺苷酸化)
- Splicing(RNA剪接)
因此三者皆屬於真核 mRNA 成熟化的重要步驟。
解題方法
判斷本題的關鍵,是先辨認題目中的「eukaryotic mRNA after transcription」指的是:
真核 pre-mRNA 在細胞核內需進行 5'端加帽、3'端加上 poly(A) tail,以及移除 intron、接合 exon。這些加工可在轉錄進行期間即開始,亦統稱為轉錄後加工(post-transcriptional processing)。
完整流程可表示為:
三項修飾均符合題幹所述,因此正確答案為 All of the above。
各項加工的機制與功能
一、5' capping:5'端加帽
pre-mRNA 的 5'端會接上 7-methylguanosine()帽,結構為特殊的 5'-5' triphosphate linkage:
主要步驟包括:
- 先移除 5'端的一個磷酸。
- 由 guanylyltransferase(鳥嘌呤核苷酸轉移酶) 加入 GMP。
- 由 methyltransferase(甲基轉移酶) 將 guanine methylation,形成 cap。
5' cap 的功能包括:
- 保護 mRNA 免受 5' exonuclease 分解。
- 協助 mRNA 與 ribosome 結合,促進 translation initiation。
- 協助 mRNA 輸出細胞核。
- 參與部分 RNA splicing 過程。
二、Polyadenylation:3'端多聚腺苷酸化
pre-mRNA 轉錄至特定訊號序列後,會先被切割,再於 3'端加入 poly(A) tail。常見的切割訊號為:
主要相關蛋白包括:
- CPSF(cleavage and polyadenylation specificity factor)
- CstF(cleavage stimulation factor)
- Poly(A) polymerase, PAP(多聚腺苷酸聚合酶)
切割後,PAP 不依賴模板,在 3'端連續加入多個 adenine nucleotides:
poly(A) tail 的功能包括:
- 增加 mRNA 穩定性,降低 3' exonuclease 分解。
- 協助 mRNA 輸出細胞核。
- 促進 translation efficiency。
第 55 題
What is the function of the nucleolus?
(A) rRNA synthesis and ribosome assembly
(B) DNA replication
(C) Protein degradation
(D) mRNA processing
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核心觀念
Nucleolus(核仁)是位於細胞核內、沒有膜包圍的核內構造,主要功能為:
- rRNA(ribosomal RNA,核糖體 RNA)的合成與加工
- 核糖體次單位的組裝
在真核細胞中,核仁內的 rDNA 由 RNA polymerase I(RNA 聚合酶 I)轉錄,產生前驅 rRNA,接著經過切割與修飾,形成大部分成熟 rRNA。rRNA 再與由細胞質製造、輸入細胞核的核糖體蛋白結合,組裝成 40S 小次單位與 60S 大次單位,之後輸出至細胞質形成完整的 80S 核糖體。
補充而言,5S rRNA 主要由 RNA polymerase III 在核仁外的核質中合成,再輸入核仁參與大次單位組裝。因此,考試所稱核仁功能的核心仍是「rRNA 處理及核糖體組裝」。
解題方法
判斷核仁功能時,先抓住其名稱與細胞內位置:
- **nucleus(細胞核)**負責真核細胞的遺傳物質保存、DNA 複製及多種 RNA 生成。
- **nucleolus(核仁)**是細胞核內專門進行 rRNA 相關工作與核糖體次單位組裝的區域。
- **ribosome(核糖體)**的主要成分是 rRNA 與核糖體蛋白,因此核仁是核糖體生成的主要場所。
本題只需將各選項與核仁的專一功能逐一比對,即可選出正確答案。
選項分析
(A) rRNA synthesis and ribosome assembly
正確。核仁負責大部分 rRNA 的轉錄、加工與修飾,並將 rRNA 與核糖體蛋白組裝成 40S 與 60S 核糖體次單位。這正是核仁的主要功能。
(B) DNA replication
第 56 題
Which level of protein structure is primarily stabilized by hydrogen bonds between backbone amides?
(A) Primary
(B) Secondary
(C) Tertiary
(D) Quaternary
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核心觀念
蛋白質結構分為四個層次:
- Primary structure(一级結構):胺基酸排列順序,由肽鍵連接。
- Secondary structure(二級結構):局部規則構形,主要包括 -helix( 螺旋)與 -sheet( 摺板),主要由蛋白質主鏈上的氫鍵穩定。
- Tertiary structure(三級結構):單一多肽鏈的整體三維構形,主要由側鏈間的疏水作用、離子作用、氫鍵與二硫鍵等穩定。
- Quaternary structure(四級結構):多條多肽鏈組成的蛋白質,其次單元之間的交互作用。
本題關鍵在於「hydrogen bonds between backbone amides」,即「主鏈醯胺基之間的氫鍵」。蛋白質主鏈每個肽鍵附近具有:
- 胺基氮上的 ,可作為氫鍵供體;
- 羰基氧上的 ,可作為氫鍵受體。
這些主鏈 與 之間形成規則、重複的氫鍵,是 螺旋與 摺板的主要穩定力量,因此所對應的結構層次是二級結構。
解題方法
先辨認題幹中的結構線索:
在 螺旋中,主鏈第 個胺基酸的羰基氧,通常與第 個胺基酸的 形成氫鍵,使多肽鏈維持螺旋構形。
在 摺板中,不同多肽鏈段之間的主鏈 與 形成氫鍵,使鏈段排列成摺疊的片層結構。
因此,題目所描述的是由主鏈基團形成規則氫鍵,以穩定局部構形的作用,答案為 Secondary(二級結構)。
選項分析
第 57 題
Myoglobin and hemoglobin differ in oxygen binding properties because:
(A) Myoglobin lacks heme
(B) Hemoglobin exhibits cooperative binding
(C) Myoglobin has higher
(D) Hemoglobin cannot bind
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核心觀念
本題考查 Myoglobin(肌紅蛋白,Mb)與 Hemoglobin(血紅蛋白,Hb)的結構差異及氧氣結合特性。
- Myoglobin:由單一 globin polypeptide chain 組成,含有一個 heme,因此每個 Mb 分子可結合 1 個 。
- Hemoglobin:由四個 globin subunits 組成,成人主要型態 HbA 為 ,含有四個 heme,因此每個 Hb 分子最多可結合 4 個 。
兩者皆透過 heme 中的二價鐵 可逆性結合氧氣:
Mb 與 Hb 最大的功能差異,在於 Hb 具有 cooperative binding(協同結合)。當一個 結合至 Hb 後,會促使 Hb 由低親和力的 **T state(tense state,緊張態)**轉變為高親和力的 R state(relaxed state,鬆弛態),使後續 更容易結合。
因此:
- Mb 的氧解離曲線接近雙曲線。
- Hb 的氧解離曲線呈 S 型,反映正協同性。
解題方法
判斷本題可抓住三個關鍵:
- Mb 與 Hb 都含有 heme。
- Hb 是四聚體,具有 subunit 間的協同作用。
- 越低,代表達到 50% 氧飽和度所需的氧分壓越低,表示氧親和力越高。
的定義為:蛋白質達到 50% 氧飽和度時所需的氧分壓。
Mb 對 的親和力高,因此 較低;Hb 的 較高,較適合在肺部結合氧氣、在組織釋放氧氣。
選項分析
(A) Myoglobin lacks heme
錯誤。Myoglobin 含有一個 heme prosthetic group(血基質輔基),其中的 是結合 的直接部位。Mb 若缺乏 heme,便無法正常結合氧氣。
第 58 題
Which technique would best determine a protein's tertiary structure?
(A) SDS-PAGE
(B) X-ray crystallography
(C) Western blot
(D) PCR
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核心觀念
蛋白質結構分為四個層次:
- 一級結構(primary structure):胺基酸排列順序,以胜肽鍵連接。
- 二級結構(secondary structure):局部規則構形,如 -helix 與 -sheet,主要由主鏈間氫鍵穩定。
- 三級結構(tertiary structure):單一多胜肽鏈完整的三維立體摺疊,受到疏水作用、氫鍵、離子作用、范德華力及二硫鍵等影響。
- 四級結構(quaternary structure):多條多胜肽鏈組成的蛋白質複合體。
題目詢問「最適合用來判定蛋白質的三級結構」的技術,因此應選擇能直接解析蛋白質原子在三維空間中排列情形的方法。
解題方法
**X-ray crystallography(X 射線晶體學)**可先將蛋白質製成規則排列的晶體,再以 X 射線照射。蛋白質晶體中的原子會造成 X 射線繞射,形成繞射圖樣;分析繞射資料後,可利用電子密度圖重建蛋白質的三維結構。
因此,X-ray crystallography 能直接提供蛋白質的:
- 整體三維摺疊
- -helix 與 -sheet 的空間配置
- 活性部位與結合口袋
- 二硫鍵及胺基酸側鏈的相對位置
這些資訊正是蛋白質三級結構的內容。
選項分析
(A) SDS-PAGE
SDS-PAGE 使用十二烷基硫酸鈉(SDS)使蛋白質變性,並大致使蛋白質帶有與其長度相關的負電荷,再依分子量大小進行電泳分離。
其主要用途是:
- 測定蛋白質分子量
- 觀察蛋白質純度
- 分析蛋白質次單元
- 比較不同樣品中的蛋白質大小
SDS 會破壞蛋白質原有的非共價作用,使蛋白質失去天然構形,因此 SDS-PAGE 無法提供蛋白質的天然三維摺疊資訊。故錯誤。
(B) X-ray crystallography
第 59 題
The Bohr effect describes:
(A) pH influence on hemoglobin oxygen affinity
(B) Temperature effects on enzyme activity
(C) Salt concentration on protein solubility
(D) Pressure effects on reaction rates
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核心觀念
Bohr effect(波耳效應)是指血液中 ** 濃度或 分壓上升、pH 下降時,血紅蛋白(hemoglobin, Hb)對氧氣()的親和力降低,使氧合血紅蛋白解離曲線向右移。
其生理意義是:代謝旺盛的組織會產生較多 與酸性物質,促使 Hb 釋放更多 至組織。
主要機轉包括:
- 進入紅血球後,在 carbonic anhydrase(碳酸酐酶)催化下形成碳酸:
-
增加的 與 Hb 結合,穩定去氧血紅蛋白(deoxyhemoglobin)的 T state(tense state),降低 Hb 對 的親和力。
-
也可與 Hb 的胺基形成 carbaminohemoglobin(胺基甲醯血紅蛋白),進一步促進氧氣釋放。
因此,Bohr effect 的核心是「pH/ 與 改變 Hb 的氧氣親和力」。
解題方法
先辨認題幹中的關鍵字:Bohr effect 專門描述呼吸生理中 pH 對 hemoglobin–oxygen affinity 的影響。
判斷方向如下:
- pH 下降、 增加:Hb 對 親和力下降,曲線右移,組織獲得較多氧氣。
- pH 上升、 減少:Hb 對 親和力上升,曲線左移。
所以正確敘述是「pH influence on hemoglobin oxygen affinity」。
選項分析
第 60 題
Which amino acid is most likely to be found in a -turn?
(A) Glycine
(B) Tryptophan
(C) Glutamate
(D) Phenylalanine
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核心觀念
本題考查蛋白質的二級結構,特別是 -turn(-轉角)的胺基酸組成偏好。
-turn 通常由連續四個胺基酸殘基形成,使多胜肽鏈方向急遽改變。其結構常以第 個殘基與第 個殘基之間形成主鏈氫鍵為特徵:
位於轉角內側的第 與第 個殘基,需要具有合適的主鏈 、 二面角。能夠提供較大構形自由度、且側鏈體積小的胺基酸,較容易出現在此處。
Glycine(甘胺酸)的側鏈僅為氫原子,立體障礙極小,主鏈構形自由度最大,因此特別常見於 -turn。
解題方法
判斷 -turn 常見胺基酸時,優先考慮兩項條件:
- 側鏈體積小,避免轉角處產生立體障礙。
- 主鏈具有較大的構形彈性,能採取特殊的 、 二面角。
Glycine 的側鏈為氫:
在蛋白質中,甘胺酸的 -碳連接兩個氫原子,因此側鏈幾乎不會限制主鏈旋轉。這使它能適應 -turn 所需的急遽折返構形。
因此最符合題意的選項為 Glycine。
選項分析
(A) Glycine(甘胺酸)—正確
Glycine 的側鏈最小,僅為氫原子,立體障礙最低,且主鏈二面角可變範圍較大,容易形成 -turn 所需的折返構形。
甘胺酸是 -turn 的常見殘基,尤其可出現在第 或第 位置。
(B) Tryptophan(色胺酸)—錯誤
第 61 題
Disulfide bonds are most important for stabilizing:
(A) -helices
(B) -sheets
(C) Tertiary structure
(D) Primary structure
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核心觀念
本題考查蛋白質四級結構層次,以及穩定各層次結構的主要作用力。
二硫鍵(disulfide bond)是由兩個半胱胺酸(cysteine, Cys)側鏈上的巰基(sulfhydryl group, )經氧化形成的共價鍵:
形成二硫鍵後,兩個半胱胺酸殘基成為胱胺酸(cystine)。由於二硫鍵連接的是蛋白質側鏈上的不同區域,因此主要作用是固定蛋白質的三維折疊形狀,穩定三級結構(tertiary structure)。
解題方法
判斷方式是先確認二硫鍵的位置與功能:
- 二硫鍵形成於兩個 cysteine 側鏈之間。
- 側鏈彼此交聯會限制多胜肽鏈的空間排列。
- 這種跨區域的交聯主要穩定單一多胜肽鏈的三維構形,即三級結構。
二硫鍵也可參與穩定含有多條多胜肽鏈的四級結構(quaternary structure),但本題選項中沒有四級結構,因此正確答案是三級結構。
選項分析
(A) -helices(-螺旋)錯誤
-螺旋屬於蛋白質的二級結構(secondary structure),主要由同一條多胜肽主鏈中羰基氧()與胺基氫()之間的主鏈氫鍵穩定。其特徵是多胜肽骨架規則盤繞形成螺旋。
二硫鍵不是穩定 -螺旋的主要作用力。
(B) -sheets(-摺板)錯誤
-摺板同樣屬於二級結構,主要由相鄰多胜肽鏈段之間的主鏈氫鍵維持。這些鏈段可以呈平行排列或反平行排列。
二硫鍵並非形成與維持 -摺板的主要作用力。
第 62 題
Which amino acid substitution would most likely disrupt an -helix?
(A) Leu Val
(B) Glu Asp
(C) Pro Ala
(D) Lys Arg
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核心觀念
-螺旋(-helix)主要由同一條多胜肽鏈內,第 個胺基酸羰基氧與第 個胺基酸胺基氫之間的主鏈氫鍵維持。其穩定性取決於:
- 主鏈能否形成規則氫鍵。
- 胺基酸本身的螺旋傾向。
- 側鏈體積、電荷與立體障礙。
- 是否存在會扭曲主鏈的胺基酸,尤其是 Pro(脯胺酸)。
Pro 的側鏈與主鏈胺基氮形成環狀結構,使主鏈構形受到限制;同時 Pro 的主鏈氮缺乏可供形成氫鍵的氫,因此常被稱為 -helix breaker(螺旋破壞者)。
因此,最容易破壞 -螺旋的典型替換是:
而題目列出的方向是 ,此方向通常會減少螺旋破壞,並非破壞螺旋。
解題方法
判斷胺基酸替換是否破壞 -螺旋,可依下列順序:
- 先找是否引入 Pro。
- 再判斷是否引入體積過大的側鏈或明顯立體障礙。
- 比較替換前後胺基酸的電荷與化學性質是否大幅改變。
- 若只是相近性質胺基酸之間的保守性替換,通常不會顯著破壞 -螺旋。
本題四個選項中,沒有任何選項將 Pro 引入原本沒有 Pro 的位置;反而選項 C 是移除 Pro。因此依題目字面判讀,沒有正確選項。
選項分析
(A) Leu Val
Leu(白胺酸)與 Val(纈胺酸)皆為疏水性、非帶電胺基酸,也都能存在於 -螺旋中。
Val 的側鏈較短但具有分枝結構,可能造成局部立體障礙,使螺旋穩定性略有變化;然而這種影響通常遠小於引入 Pro 所造成的破壞。
因此,A 不會是最可能破壞 -螺旋的替換。
(B) Glu Asp
Glu(麩胺酸)與 Asp(天門冬胺酸)皆為酸性、通常帶負電的胺基酸:
Asp 比 Glu 少一個 ,側鏈較短,可能使局部電荷排列或螺旋內相互作用略有不同。
第 63 題
The Hill coefficient measures:
(A) Enzyme catalytic efficiency
(B) Cooperativity in ligand binding
(C) Protein stability
(D) Reaction velocity
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核心觀念
Hill coefficient(Hill 係數,記為 )用來描述蛋白質與配體(ligand)結合時的協同性(cooperativity),也就是一個配體結合後,是否會影響其他配體的結合能力。
常用 Hill equation 表示為:
其中:
- :蛋白質被配體佔據的比例
- :游離配體濃度
- :解離常數相關參數
- :Hill coefficient
- :ligand(配體)
Hill coefficient 的意義如下:
- :無明顯協同性,各結合位點彼此獨立
- :正協同性(positive cooperativity),一個配體結合後,促進其他配體結合
- :負協同性(negative cooperativity),一個配體結合後,抑制其他配體結合
因此,Hill coefficient 主要反映「配體結合的協同性程度」,不是酵素催化速率本身。
解題方法
題幹問的是:
The Hill coefficient measures:
判斷關鍵在於 Hill coefficient 的定義。它源自描述多重配體結合與協同性的數學模型,常用於具有多個結合位點的蛋白質,例如血紅蛋白(hemoglobin)。
血紅蛋白結合氧氣時,第一個 結合會促使蛋白質構形改變,使後續 更容易結合,這就是正協同性。其氧氣結合曲線呈現 S 型,而 Hill coefficient 可用來量化此協同性。
所以本題正確概念是「配體結合的協同性」。
選項分析
(A) Enzyme catalytic efficiency
錯誤。酵素催化效率主要以:
第 64 題
Which protein is an example of a motor protein?
(A) Actin
(B) Myosin
(C) Tubulin
(D) Keratin
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核心觀念
本題考查細胞骨架相關蛋白與 **motor protein(馬達蛋白)**的功能分類。
馬達蛋白是一類能利用 ATP 水解所釋放的能量,沿著細胞骨架纖維定向移動,並產生機械力的蛋白質。其基本能量反應為:
常見馬達蛋白包括:
- Myosin(肌凝蛋白):沿著 **Actin filament(肌動蛋白絲)**移動。
- Kinesin(驅動蛋白):主要沿著 **Microtubule(微管)**向微管正端移動。
- Dynein(動力蛋白):主要沿著微管向微管負端移動。
本題選項中,只有 Myosin本身屬於能直接利用 ATP 產生移動與收縮力量的馬達蛋白。
解題方法
判斷馬達蛋白時,先確認該蛋白是否具備以下特徵:
- 能結合 ATP。
- 具有 ATPase(ATP 水解酶)活性。
- 能將 ATP 化學能轉換成機械運動。
- 能沿著 actin filament 或 microtubule 等細胞骨架移動。
Myosin的球狀頭部具有 ATPase 活性,會依序進行 ATP 結合、ATP 水解、與 actin 結合及 power stroke(動力衝程),使肌凝蛋白沿 actin filament 移動,造成肌肉收縮或細胞內囊泡運輸。
其簡化循環可表示為:
因此,Myosin 符合馬達蛋白的定義。
選項分析
(A) Actin
**Actin(肌動蛋白)**是細胞骨架的主要組成蛋白,可聚合形成 actin filament(肌動蛋白絲)。
Actin filament 是 Myosin 移動時所使用的軌道,也參與細胞形狀維持、細胞移動與肌肉收縮。Actin 本身不是典型的 ATP 驅動型馬達蛋白;
第 65 題
Prion diseases result from:
(A) Viral infection
(B) Misfolded proteins
(C) DNA mutations
(D) RNA degradation
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核心觀念
本題考查 prion disease(普里昂疾病/朊毒體疾病) 的致病本質。
Prion 是由異常摺疊蛋白質所形成的感染性蛋白質,主要涉及:
- 正常型普里昂蛋白:(cellular prion protein)
- 異常型普里昂蛋白:(scrapie-associated prion protein)
其核心機轉為異常型 促使正常型 改變構形,轉變成更多異常型蛋白:
異常型蛋白富含 -sheet(β-摺板)結構,具有高度聚集性與抗蛋白酶分解特性,會在神經組織中累積,造成神經元損傷、海綿樣腦病變與進行性神經退化。
因此,普里昂疾病的直接原因是 misfolded proteins(錯誤摺疊的蛋白質)。
解題方法
判斷 prion disease 的關鍵,是辨認其是否需要核酸作為遺傳或感染性物質。
病毒、細菌與多數病原體通常具有 DNA 或 RNA 等核酸;prion 的特殊性在於它是「僅由異常構形蛋白質造成的感染性因子」,不以 DNA 或 RNA 作為主要致病成分。
本題不涉及代謝反應或計算,直接依據 prion 的定義與蛋白質構形轉換機轉判斷:
所以正確選項為 (B)。
選項分析
(A) Viral infection(病毒感染)—錯誤
病毒是含有 DNA 或 RNA 的感染性微生物,需要利用宿主細胞的機制進行複製。Prion 不屬於病毒,也沒有病毒所需的核酸基因組。
Prion disease 可具有感染性,但其感染性來自異常蛋白質構形誘導,不是病毒感染造成。
第 66 題
Anfinsen's experiment with ribonuclease demonstrated:
(A) Protein denaturation is irreversible
(B) Primary structure determines tertiary structure
(C) Chaperones are required for folding
(D) Disulfide bonds are unnecessary
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核心觀念
本題考查 Anfinsen’s experiment(Anfinsen 的核糖核酸酶實驗)及「蛋白質一級結構決定三度結構」的概念。
Anfinsen 以 bovine pancreatic ribonuclease A(牛胰核糖核酸酶 A,RNase A)進行實驗。RNase A 含有:
- 124 個胺基酸
- 8 個 cysteine(半胱胺酸)
- 可形成 4 個 disulfide bonds(二硫鍵)
實驗中先以 urea(尿素)使蛋白質變性,再以 -mercaptoethanol(-巰基乙醇)還原二硫鍵:
移除尿素與還原劑後,RNase A 可自行重新摺疊,並重新形成正確的二硫鍵,恢復接近原本的酵素活性。
此結果表示:蛋白質摺疊所需的結構資訊,主要已經存在於胺基酸的一級結構中。換言之,在適當條件下,一級結構可決定蛋白質的天然三度結構。
解題方法
本題應抓住 Anfinsen 實驗的核心結果:
如果蛋白質能在沒有額外摺疊輔助的情況下恢復原本構形與功能,代表:
- 摺疊資訊不是由外加的 chaperone(分子伴護蛋白)所提供。
- 蛋白質的天然構形是由其胺基酸序列所決定。
- 變性通常不代表肽鍵被破壞,因此一級結構仍然保留。
- 二硫鍵雖然在變性過程中被還原,但重新摺疊時可再次形成正確配對。
因此正確選項是「Primary structure determines tertiary structure」。
選項分析
(A) Protein denaturation is irreversible
錯誤。
Anfinsen 實驗正好證明某些蛋白質的變性可以是可逆的。RNase A 經尿素與 -mercaptoethanol 處理後失去活性;移除這些試劑後,蛋白質能重新摺疊並恢復酵素功能。
須注意,變性主要破壞氫鍵、離子作用、疏水作用及二硫鍵等高階結構;只要一級結構與肽鍵未被破壞,蛋白質可能重新摺疊。若變性造成不可逆聚集或肽鍵水解,才可能無法恢復。
(B) Primary structure determines tertiary structure
正確。
第 67 題
Which amino acid can form hydrogen bonds via its side chain?
(A) Alanine
(B) Serine
(C) Valine
(D) Leucine
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核心觀念
本題考查胺基酸側鏈的化學性質,以及側鏈是否含有能參與氫鍵的極性官能基。
氫鍵通常形成於:
- 氫鍵供體(donor):含有與高電負度原子相連的氫,例如 、。
- 氫鍵受體(acceptor):具有可提供孤電子對的高電負度原子,主要是氧、氮,有時包括硫。
在蛋白質中,側鏈氫鍵可協助維持三級結構與四級結構,也可參與酵素活性部位的辨識與催化。
解題方法
逐一觀察各胺基酸的側鏈,判斷是否含有氧、氮、硫等可形成氫鍵的原子。
本題選項的側鏈如下:
- Alanine:
- Serine:
- Valine:
- Leucine:
只有 Serine 的側鏈含有羥基 。羥基中的氧具有孤電子對,可作為氫鍵受體;羥基上的氫也可作為氫鍵供體,因此 Serine 側鏈能與水分子、其他胺基酸側鏈或蛋白質主鏈形成氫鍵。
選項分析
(A) Alanine
Alanine(丙胺酸)的側鏈為 ,屬於非極性的烷基。
其中只有碳與氫,沒有氧、氮或硫等能有效參與氫鍵的高電負度原子,因此 Alanine 的側鏈不能形成氫鍵。
(B) Serine
第 68 題
The proteasome primarily degrades:
(A) Glycogen
(B) Ubiquitinated proteins
(C) Phospholipids
(D) Nucleic acids
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核心觀念
本題考「蛋白質降解系統」的功能與受質辨識。
Proteasome(蛋白酶體)是細胞內負責分解特定蛋白質的大型蛋白質複合體,主要參與 ubiquitin–proteasome system(泛素—蛋白酶體系統)。其典型受質先被 ubiquitin(泛素)標記,再送入 proteasome 分解。
常見流程如下:
- 目標蛋白質先由 ubiquitin-activating enzyme()、ubiquitin-conjugating enzyme()及 ubiquitin ligase()依序進行泛素化。
- 目標蛋白質通常形成 polyubiquitin chain(多聚泛素鏈),其中以 Lys48-linked chain 最典型,代表蛋白質將被送往蛋白酶體降解。
- 26S proteasome 由 20S catalytic core(20S 催化核心)及兩側的 19S regulatory particle(19S 調節顆粒)組成。
- 19S 調節顆粒辨識泛素標記,移除並回收 ubiquitin;同時利用 ATP 展開蛋白質。
- 展開後的蛋白質進入 20S 核心,由其內部的 protease 活性切割成短胜肽,之後再由細胞內 peptidase 分解為胺基酸。
因此,proteasome 主要降解的是「被 ubiquitin 標記的蛋白質」。
解題方法
判斷本題的切入點是辨認各選項所屬的主要細胞分解系統:
- 蛋白質:主要由 proteasome 或 lysosome 分解。
- 醣原:主要由 glycogen phosphorylase 等醣原代謝酵素處理。
- 磷脂質:主要由 phospholipase 分解,或經 lysosome 進行膜成分降解。
- 核酸:主要由 nuclease 分解。
題幹使用「proteasome」這個關鍵字,應直接聯想到 ubiquitin–proteasome system。proteasome 的核心功能不是分解所有細胞大分子,而是選擇性處理經泛素標記的蛋白質,特別是短壽命蛋白質、錯誤摺疊蛋白質及部分細胞週期調控蛋白質。
選項分析
(A) Glycogen
錯誤。Glycogen(醣原)是葡萄糖的儲存形式,主要透過 glycogenolysis(醣原分解)代謝。
關鍵反應為 glycogen phosphorylase 以無機磷酸切下醣原末端的葡萄糖殘基,生成 glucose-1-phosphate:
接著由 phosphoglucomutase 將 glucose-1-phosphate 轉換為 glucose-6-phosphate。醣原的主要分解酵素是 glycogen phosphorylase,而不是 proteasome。
第 69 題
Which protein structure prediction method uses known structures as templates?
(A) Ab initio modeling
(B) Homology modeling
(C) Threading
(D) Molecular dynamics
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核心觀念
本題考查蛋白質三級結構預測(protein structure prediction)方法的分類,關鍵字是:
“uses known structures as templates”
其中,利用已知結構的同源蛋白質作為模板,依據胺基酸序列相似性推測未知蛋白質三維結構的方法,稱為 Homology modeling(同源建模),也稱為 comparative modeling(比較建模)。
其基本原理是:若兩個蛋白質具有共同演化來源,且胺基酸序列具有足夠相似性,通常會保留相近的整體摺疊與空間結構。因此,可將已知結構的同源蛋白質作為模板,將目標蛋白質序列套入模板骨架,再修正插入區、缺失區、迴圈與側鏈位置。
基本流程為:
- 尋找具有實驗解析結構的同源蛋白質。
- 進行目標序列與模板序列的序列比對(sequence alignment)。
- 依照模板建立目標蛋白質的主鏈骨架。
- 模擬插入、缺失區域及迴圈結構。
- 配置側鏈並進行結構最佳化。
- 以立體化學合理性及能量分析驗證模型。
解題方法
直接抓住題幹中的「known structures as templates」:
- 已知結構被當作模板;
- 目標蛋白質通常與模板蛋白質具有序列同源性;
- 依照同源性推測目標蛋白質的結構。
這三項正是 Homology modeling 的定義,因此選擇 (B)。
本題不涉及代謝途徑、酵素反應或數值計算,判斷重點是辨認各種結構預測方法是否依賴已知結構模板。
選項分析
(A) Ab initio modeling(從頭建模)
錯誤。
Ab initio modeling 不以已知同源蛋白質結構作為主要模板,而是從胺基酸序列本身出發,根據物理化學原理、鍵角、鍵長、疏水作用、氫鍵、靜電作用及自由能等因素,預測蛋白質可能採取的三維結構。
其概念可表示為尋找自由能較低的構形:
其中 代表系統的自由能。由於蛋白質構形空間非常龐大,Ab initio modeling 的計算難度高,尤其不利於大型蛋白質的精確預測。
(B) Homology modeling(同源建模)
正確。
Homology modeling 使用已知三維結構的同源蛋白質作為模板,根據目標蛋白質與模板蛋白質之間的序列比對結果,建立目標蛋白質的結構模型。
當目標序列與模板序列具有較高相似性,且比對位置可靠時,兩者通常具有相似的:
第 70 題
Zinc finger motifs are examples of:
(A) DNA-binding domains
(B) Enzyme active sites
(C) Membrane channels
(D) Chaperone proteins
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核心觀念
Zinc finger motif(鋅指基序)是由特定胺基酸排列形成的蛋白質結構單元,利用鋅離子 與 cysteine(半胱胺酸)及/或 histidine(組胺酸)的側鏈配位,穩定局部三維結構,使蛋白質能辨識並結合特定 DNA 序列。
常見類型包括:
- C2H2 zinc finger:由 2 個 cysteine 與 2 個 histidine 配位鋅離子。
- C4 zinc finger:常見於 nuclear receptor(核受體),由 4 個 cysteine 配位鋅離子。
許多 zinc finger 蛋白具有 DNA-binding domain(DNA 結合域),可作為 transcription factor(轉錄因子),調控基因轉錄。因此本題的分類重點是:鋅指基序主要負責蛋白質與 DNA 的特異性結合。
解題方法
先辨認題幹中的關鍵詞 zinc finger motifs。在生物化學與分子生物學中,zinc finger 是典型的 DNA-binding structural motif,常出現在轉錄因子與核受體的 DNA-binding domain 中。
其作用流程可概括為:
因此正確分類是 DNA-binding domains。
選項分析
(A) DNA-binding domains
正確。Zinc finger motifs 能形成穩定的蛋白質結構,讓蛋白質辨識 DNA 大溝中的特定鹼基序列。典型例子包括:
- C2H2 zinc finger transcription factors
- Steroid hormone receptors(類固醇荷爾蒙受體)
- Thyroid hormone receptor(甲狀腺素受體)
- Nuclear receptor superfamily(核受體超家族)
以核受體為例,荷爾蒙與受體結合後,受體的 zinc finger DNA-binding domain 會辨識 hormone response element(荷爾蒙反應元件),進而影響下游基因的轉錄。
(B) Enzyme active sites
第 71 題
Cardiolipin is a unique phospholipid found predominantly in:
(A) Lysosomes
(B) Mitochondrial inner membrane
(C) Plasma membrane
(D) Golgi apparatus
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核心觀念
本題考查「不同細胞器膜的特徵性脂質分布」。
Cardiolipin(心磷脂)又稱 diphosphatidylglycerol(二磷脂醯甘油),是一種特殊的磷脂,由兩個 phosphatidic acid(磷脂酸)經由 glycerol(甘油)連接而成,因此具有:
- 四條脂肪酸鏈
- 兩個磷酸基
- 特殊的雙磷脂結構
- 高度集中於粒線體內膜
在真核細胞中,cardiolipin 主要位於 mitochondrial inner membrane(粒線體內膜),尤其與氧化磷酸化相關的膜蛋白及電子傳遞鏈複合體密切結合,有助於維持內膜結構與能量代謝功能。
粒線體內膜上進行:
- 電子傳遞鏈(electron transport chain)
- 質子梯度建立
- ATP synthase(ATP 合成酶)利用質子動力合成 ATP
Cardiolipin 能穩定電子傳遞鏈複合體及其超複合體(supercomplexes),對粒線體內膜的功能相當重要。
解題方法
判斷細胞器特有脂質時,先辨認 cardiolipin 的細胞定位:
Cardiolipin 雖然在細菌細胞膜中也可發現,但在真核細胞生化考題中,最具代表性的定位是粒線體內膜。這是因為粒線體源自內共生的細菌,cardiolipin 的分布也保留了部分細菌膜脂質特徵。
因此正確選項為 mitochondrial inner membrane。
選項分析
第 72 題
Which lipid-soluble molecule acts as a second messenger by activating protein kinase C?
(A)
(B) Diacylglycerol (DAG)
(C) cAMP
(D) Calcium ions
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核心觀念
本題考查細胞訊息傳遞中的「第二訊息傳遞者(second messenger)」及其與 protein kinase C, PKC(蛋白質激酶 C) 的關係。
典型路徑如下:
活化後的 phospholipase C(PLC)會將細胞膜上的磷脂醯肌醇-4,5-二磷酸()水解成兩個第二訊息傳遞者:
其中:
- DAG(diacylglycerol,二酸甘油酯):脂溶性,留在細胞膜上。
- (inositol 1,4,5-trisphosphate,肌醇三磷酸):水溶性,擴散至細胞質,促使內質網釋放 。
經典型 PKC(conventional PKC)活化通常需要:
- 細胞膜上的 DAG;
- 細胞質中升高的 ;
- 磷脂膜環境。
因此,本題的關鍵限定詞是 lipid-soluble molecule(脂溶性分子),且其作用是活化 PKC。符合者為 DAG。
解題方法
先辨認題目指定的酵素:protein kinase C。
再由 PLC 訊息傳遞路徑定位其直接活化因子:
DAG 具有疏水性的脂肪酸鏈,因此是脂溶性分子,會留在細胞膜內,直接與 PKC 的 C1 domain 結合,促使 PKC 定位於細胞膜並活化。
雖然與 DAG 同時產生,但屬於水溶性分子,主要功能是促使內質網釋放 。 可協助某些 PKC 活化,卻不是脂溶性分子;題目要求的是能活化 PKC 的脂溶性第二訊息傳遞者,因此答案是 DAG。
選項分析
(A) :錯誤
第 73 題
The fluid mosaic model describes:
(A) DNA structure
(B) Membrane structure
(C) Protein folding
(D) Enzyme kinetics
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核心觀念
「流動鑲嵌模型」(fluid mosaic model)是描述生物膜結構與組成的模型,由 Singer 與 Nicolson 提出。
其主要概念包括:
- 磷脂雙層(phospholipid bilayer):磷脂具有親水性頭部與疏水性尾部,排列形成膜的基本骨架。
- 膜蛋白鑲嵌其中:包括整合膜蛋白(integral membrane proteins)與周邊膜蛋白(peripheral membrane proteins),負責運輸、受體、酵素活性與細胞黏附等功能。
- 膜具有流動性:磷脂與部分蛋白質可在膜平面內側向移動。
- 鑲嵌性與不對稱性:不同種類的蛋白質分布於磷脂雙層中,膜兩側的脂質與醣蛋白組成也不完全相同。
- 膽固醇(cholesterol):可調節膜的流動性與穩定性。
- 醣類結構:醣蛋白與醣脂上的醣鏈通常分布於細胞膜外側,參與細胞辨識。
因此,流動鑲嵌模型所描述的是細胞膜或生物膜的結構。
解題方法
先辨認題幹中的專有名詞:fluid mosaic model 並非某一條代謝途徑、酵素反應或蛋白質構形模型,而是細胞生物學中用來說明膜結構的經典模型。
關鍵字判斷如下:
- fluid:表示膜內磷脂與部分膜蛋白具有流動性。
- mosaic:表示多種蛋白質鑲嵌於磷脂雙層中。
- model:表示對膜組成、排列與動態特性的整體描述。
所以正確選項為 membrane structure。
選項分析
(A) DNA structure
第 74 題
Which transport mechanism requires ATP directly?
(A) Facilitated diffusion
(B) Primary active transport
(C) Secondary active transport
(D) Simple diffusion
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核心觀念
本題考查細胞膜物質運輸依賴能量的方式,關鍵在於區分:
- Primary active transport(初級主動運輸):直接水解 ATP,將能量用於逆濃度梯度或電化學梯度運輸。
- Secondary active transport(次級主動運輸):不直接水解 ATP,而是利用另一種物質所建立的電化學梯度。
- Facilitated diffusion(促進性擴散)與Simple diffusion(簡單擴散):皆屬被動運輸,不需 ATP。
初級主動運輸的基本反應可表示為:
釋放的能量由膜蛋白直接利用,以推動物質逆其濃度梯度運輸。
解題方法
判斷「是否直接需要 ATP」即可:
- 若膜蛋白本身直接進行 ATP 水解,屬於 primary active transport。
- 若運輸依靠離子梯度所儲存的能量,屬於 secondary active transport,ATP 只是在較早階段間接參與。
- 若物質沿濃度梯度移動,屬於被動運輸,不需 ATP。
典型例子是 Na⁺/K⁺-ATPase(鈉鉀幫浦):
Na⁺/K⁺-ATPase 直接水解 ATP,將 3 個 Na⁺送出細胞、2 個 K⁺送入細胞,因此是初級主動運輸。
選項分析
(A) Facilitated diffusion(促進性擴散)
錯誤。
促進性擴散利用膜上的通道蛋白或載體蛋白,使極性分子或離子沿著其電化學梯度移動,例如:
- \ce{GLUT} 運輸葡萄糖
- 離子通道運輸 \ce{Na+}、\ce{K+}、\ce{Cl-}
其能量來源是濃度梯度或電化學梯度,不需直接消耗 ATP。
(B) Primary active transport(初級主動運輸)
正確。
第 75 題
Lipid rafts are enriched in:
(A) Cholesterol and sphingolipids
(B) Phosphatidylcholine
(C) Triglycerides
(D) Free fatty acids
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核心觀念
本題考查細胞膜中的 lipid rafts(脂筏)。脂筏是細胞膜外側小區域中,脂質與膜蛋白呈現選擇性聚集的微結構,主要功能包括:
- 作為受體、訊息傳遞蛋白與細胞黏附分子的聚集平台
- 協助膜蛋白分選與囊泡運輸
- 參與細胞訊息傳遞與膜融合
脂筏的膜脂組成具有兩項代表性特徵:
- 富含 cholesterol(膽固醇)
- 富含 sphingolipids(鞘脂),包括 sphingomyelin(鞘磷脂)與 glycosphingolipids(醣鞘脂)
鞘脂的脂肪酸鏈通常較長且飽和度較高,彼此排列緊密;膽固醇則可插入鞘脂之間,穩定這個較有秩序的膜區域。因此,脂筏常被描述為具有較高秩序性的液態區域,即 liquid-ordered domain(液態有序區)。
解題方法
判斷 lipid rafts 的組成時,抓住「膽固醇+鞘脂」這個核心組合即可。
一般細胞膜主要由 phospholipids(磷脂)、cholesterol 與 glycolipids(醣脂)構成。脂筏不是由任意膜脂平均分布形成,而是特別富集:
膽固醇具有四環結構,可與鞘脂較長且飽和的脂肪酸鏈緊密作用,降低脂質鏈的自由活動,使脂筏比周圍膜區域具有較高的膜秩序與相對穩定性。
本題不涉及代謝途徑、酵素反應或計算,關鍵在於辨認脂筏的特徵性膜脂組成。
選項分析
(A) Cholesterol and sphingolipids
正確。脂筏最典型的組成就是膽固醇與鞘脂。鞘脂包括 sphingomyelin 與 glycosphingolipids;膽固醇則填補並穩定鞘脂疏水鏈之間的空間,形成較有序的膜微區。
(B) Phosphatidylcholine
第 76 題
The sodium-potassium pump moves:
(A) out, in per ATP
(B) out, in per ATP
(C) in, out per ATP
(D) in, out per ATP
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核心觀念
本題考查 鈉鉀幫浦(sodium-potassium pump,\ce{Na+}/\ce{K+}-ATPase) 的運輸方向與化學計量。
鈉鉀幫浦位於細胞膜上,屬於 P 型膜 ATPase(P-type ATPase),利用水解 ATP 所釋放的能量,主動運輸鈉離子與鉀離子,使兩者逆其電化學梯度移動。
每水解 1 分子 ATP,鈉鉀幫浦固定完成:
因此整體反應可表示為:
其中 為無機磷酸鹽。
解題方法與運作機轉
判斷本題可直接掌握兩個關鍵數字:
- 向外運送 個
- 向內運送 個
其基本運作步驟如下:
- 細胞內側的鈉鉀幫浦先結合 個 。
- ATP 水解,並將磷酸基轉移到幫浦蛋白上,使蛋白質發生構形改變。
- 幫浦轉為向細胞外開放,釋放 個 。
- 細胞外側結合 個 。
- 幫浦蛋白去磷酸化,回復原本構形。
- 個 被釋放至細胞內。
所以,每消耗 1 個 ATP,淨結果就是:
這種運輸會造成每一循環有 3 個正電荷移出、2 個正電荷移入,細胞膜外側相對較正、細胞內側相對較負,因此鈉鉀幫浦也是一種 電生性運輸(electrogenic transport)。
選項分析
(A) out, in per ATP
錯誤。
第 77 題
Which vitamin is essential for blood clotting?
(A) Vitamin A
(B) Vitamin K
(C) Vitamin E
(D) Vitamin D
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核心觀念
本題考查脂溶性維生素中,哪一種直接參與血液凝固因子的活化。答案是 Vitamin K(維生素 K)。
維生素 K 是肝臟合成多種凝血蛋白所必需的輔酶,主要作用是催化凝血因子中特定 glutamate(麩胺酸,Glu)殘基的 -carboxylation(-羧化):
生成的 -carboxyglutamate(Gla)能夠結合 ,使凝血因子附著於帶負電的血小板磷脂表面,進而參與凝血酵素複合體的形成。
維生素 K 依賴性的主要凝血因子包括:
- Factor II(凝血因子 II,prothrombin,凝血酶原)
- Factor VII(凝血因子 VII)
- Factor IX(凝血因子 IX)
- Factor X(凝血因子 X)
此外,抗凝血蛋白 Protein C 與 Protein S 也需要維生素 K 進行活化。
解題方法
判斷本題的關鍵,是將「blood clotting(血液凝固)」直接聯想到:
維生素 K 參與的反應發生在凝血因子由肝臟合成之後的修飾階段。其基本反應可表示為:
此反應由 -glutamyl carboxylase(-麩胺醯羧化酶)催化,並需要還原型維生素 K 作為輔助因子。經過羧化後,凝血因子才能有效結合 ,定位於細胞膜表面,促進凝血級聯反應。
因此,只要看到「血液凝固所必需的維生素」,即可選擇 Vitamin K。
選項分析
(A) Vitamin A
第 78 題
Membrane potential is primarily maintained by:
(A) ATPase
(B) GLUT transporters
(C) Aquaporins
(D) Gap junctions
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核心觀念
本題考查細胞膜電位(membrane potential)的形成與維持機制。
細胞膜內外存在不均等的離子分布:
- 細胞外: 濃度高、 濃度低
- 細胞內: 濃度高、 濃度低
- 細胞內含有帶負電的大分子蛋白質與有機陰離子
這些離子濃度梯度使細胞膜內外產生電位差。靜止狀態下,細胞膜通常對 的通透性最高, 經由漏通道外流,使細胞內相對帶負電;而維持此離子濃度梯度的主要運輸蛋白是 ATPase。
ATPase 每水解 1 分子 ATP,將 3 個 泵出細胞,同時將 2 個 泵入細胞:
其整體作用可表示為:
由於泵出的正電荷多於泵入的正電荷, ATPase 具有電生性(electrogenic)作用,直接使細胞內更偏負。此外,它所建立的 與 濃度梯度,也是細胞膜電位能夠長期維持的根本。
解題方法
判斷本題可分成兩個層次:
- 找出能主動維持離子濃度梯度的蛋白質。
- 確認該蛋白質是否直接造成膜內外電荷不對稱。
膜電位的短時間變化主要受離子通道開關與離子通透性影響,尤其是 漏通道;但若沒有持續運作的 ATPase,細胞內外的 、 濃度梯度會逐漸消失,膜電位也無法長期維持。
因此,題目問「primarily maintained」時,應選擇負責主動建立並補充離子梯度的 ATPase。
選項分析
(A) ATPase:正確
第 79 題
Which lipid is a precursor for steroid hormones?
(A) Phosphatidylcholine
(B) Cholesterol
(C) Sphingomyelin
(D) Ganglioside
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核心觀念
本題考查「類固醇荷爾蒙的前驅物」及脂質分類。
類固醇荷爾蒙(steroid hormones)皆以膽固醇(cholesterol)為共同起始原料,包括:
- 腎上腺皮質荷爾蒙:cortisol、aldosterone
- 性荷爾蒙:testosterone、estrogen、progesterone
- 維生素 D 的活化衍生物
膽固醇首先在粒線體內經由膽固醇側鏈裂解酶(cholesterol desmolase,又稱 P450scc,基因名稱為 CYP11A1)催化,進行側鏈裂解反應,形成 pregnenolone(孕烯醇酮):
Pregnenolone 是類固醇荷爾蒙生合成途徑的關鍵第一個產物,之後可再轉變成 progesterone、cortisol、aldosterone、testosterone 等。
因此,本題的關鍵是辨認哪一種脂質可作為類固醇荷爾蒙的共同前驅物。
解題方法
判斷脂質是否能作為類固醇荷爾蒙前驅物,可先依其結構與功能分類:
- 膽固醇屬於 sterol(固醇類),具有四環類固醇核心結構,是類固醇荷爾蒙的直接前驅物。
- 磷脂主要構成細胞膜,通常不是類固醇荷爾蒙的直接起始原料。
- 鞘脂與醣鞘脂主要參與細胞膜結構、細胞辨識及訊息傳遞,也不是類固醇荷爾蒙的共同前驅物。
因此答案為 cholesterol。
選項分析
(A) Phosphatidylcholine(磷脂醯膽鹼)
Phosphatidylcholine 是最常見的甘油磷脂之一,主要由 glycerol、兩條脂肪酸、phosphate 及 choline 組成,是細胞膜雙層的重要成分。
它的主要功能包括:
- 維持細胞膜結構
- 參與膜蛋白及膜性胞器的形成
- 作為部分訊息傳遞分子的來源
Phosphatidylcholine 不具有類固醇的四環核心結構,也不會直接經由 CYP11A1 轉變成 pregnenolone,因此不是類固醇荷爾蒙的前驅物。
錯誤。
(B) Cholesterol(膽固醇)
Cholesterol 是 sterol,具有典型的四環類固醇核心。它是類固醇荷爾蒙生合成的共同起始原料。
第 80 題
The major phospholipid in eukaryotic cell membranes is:
(A) Phosphatidylserine
(B) Phosphatidylcholine
(C) Phosphatidylethanolamine
(D) Phosphatidylinositol
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核心觀念
本題考查真核細胞膜中主要磷脂的種類與結構。真核細胞膜的磷脂多屬於甘油磷脂(glycerophospholipids),基本骨架為:
其中,phosphate 所連接的頭部基團不同,形成不同的磷脂:
- Phosphatidylcholine, PC:磷脂醯膽鹼
- Phosphatidylethanolamine, PE:磷脂醯乙醇胺
- Phosphatidylserine, PS:磷脂醯絲胺酸
- Phosphatidylinositol, PI:磷脂醯肌醇
在一般真核細胞膜中,含量最豐富、最具代表性的磷脂是 phosphatidylcholine(PC)。
解題方法
直接抓住題幹中的關鍵字:
“The major phospholipid in eukaryotic cell membranes”
意思是「真核細胞膜中主要、含量最豐富的磷脂」。
PC 通常是細胞膜中含量最高的磷脂之一,具有兩條疏水性脂肪酸尾部與帶電的 choline 頭部。其頭部整體呈電中性但具有內部正、負電荷,因此屬於兩性離子(zwitterion),適合形成穩定的脂雙層。
PC 的合成可歸入 Kennedy pathway(Kennedy 路徑),其關鍵反應包括:
其中涉及 choline kinase、CTP:phosphocholine cytidylyltransferase,以及 choline phosphotransferase 等酵素。此合成路徑產生的 PC 是真核細胞膜的重要結構性磷脂。
選項分析
(A) Phosphatidylserine(磷脂醯絲胺酸)
錯誤。PS 是帶負電荷的酸性磷脂,主要分布於細胞膜的內側葉(cytosolic leaflet)。正常情況下,flippase 會協助維持 PS 位於內側;細胞凋亡時,PS 暴露於外側,可被吞噬細胞辨識為「吃我」訊號。